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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00440 phylogeny
for amino acid alignment


 
(((((((((((((P96856_MYCTU/21-67,Y790_MYCBO/35-81),((Q54288_STRHY/25-71,(O50423_MYCTU/23-69,P72185_9ACTO/45-91)),((O53317_MYCTU/26-72,Q51730_PSEFL/22-68),Y1581_MYCBO/25-71))),((Q9ZFC1_MYCSM/18-64,O54102_STRCO/20-66),O69909_STRCO/12-58)),(((Y1388_MYCBO/21-67,(Q9Z480_9RHIZ/8-54,(((TER5_ECOLI/9-55,TER4_ECOLI/8-54),TER3_ECOLI/9-55),Q9Z551_STRCO/18-64))),(Q53901_STRCO/36-82,O52558_AMYMD/34-80)),O87854_STRCO/12-58)),(YIJC_ECOLI/15-62,O53295_MYCTU/35-80)),((PKSA_BACSU/14-57,(Q53772_STAAU/14-60,YDH1_XANAU/20-66)),((BETI_ECOLI/14-60,BETI_RHIME/14-60),(O33453_PSEPU/19-65,(O86510_STRCO/15-61,Q55363_SYNY3/17-63))))),(((((O66658_AQUAE/15-61,((YCFQ_ECOLI/24-70,YJGJ_ECOLI/21-67),O32228_BACSU/5-50)),(Q9ZGB7_STRCY/16-62,(Q51516_PSEAE/7-53,Q9Z3X8_9PSED/7-53))),(((YUXN_BACSU/8-54,YERO_BACSU/8-54),P94423_BACSU/8-54),O28458_ARCFU/8-54)),((Q59306_CLOPA/8-54,(((O69500_MYCLE/17-63,O27135_METTH/17-63),O05858_MYCTU/44-90),(((O86852_STRCO/14-60,((AFRP_STRGR/14-60,(O24739_STRVG/15-61,O66121_STRCO/14-60)),Q9ZHP8_STRFR/13-59)),(((YXAF_BACSU/11-58,O34619_BACSU/10-57),O85706_CLOAB/14-60),(((TCMR_STRGA/32-78,O53054_LISIV/8-54),Q59213_BACME/8-54),YPB3_LACLA/13-59))),((YWCC_BACSU/17-63,P96812_MYCTU/20-66),(QACR_STAAM/7-53,O67157_AQUAE/7-53))))),(((Y893_HAEIN/12-58,P94548_BACSU/11-57),(YHGD_BACSU/9-55,(BM3R_BACME/11-57,O08335_BACSU/12-58))),((((O66635_AQUAE/12-58,P96701_BACSU/12-58),((P95100_MYCTU/26-72,P96222_MYCTU/29-75),Q9ZN97_ECOLI/22-68)),(UIDR_ECOLI/16-62,O07001_BACSU/12-58)),(O31560_BACSU/17-63,O08377_MYCTU/24-70))))),((O27815_METTH/18-64,O34643_BACSU/8-54),(P73186_SYNY3/47-93,((O67930_AQUAE/8-54,(TTK_HAEIN/36-82,TTK_ECOLI/16-62)),O67927_AQUAE/18-64))))),((Q9Z601_NOSPU/12-57,((YBIH_ECOLI/17-62,(YTTP_BACSU/9-55,O07252_MYCTU/11-57)),(LUXR_VIBHA/21-67,O86312_MYCTU/12-57))),(O53612_MYCTU/19-64,(Y3439_MYCBO/23-69,O33187_MYCTU/24-70)))),(((O54185_STRCO/76-120,O07254_MYCTU/13-59),((((O07229_MYCTU/19-65,O53310_MYCTU/15-61),P95251_MYCTU/223-269),(O06169_MYCTU/30-76,P95251_MYCTU/19-65)),(P96839_MYCTU/15-61,((O86514_STRCO/19-65,O53323_MYCTU/22-68),O08306_NOCSI/21-64)))),(O53165_MYCTU/16-62,(O68442_9RHIZ/15-61,((ENVR_ECOLI/16-62,ACRR_ECOLI/16-62),MTRR_NEIGO/15-61))))),TETC_ECOLI/18-64),P96821_MYCTU/93-139),P72624_SYNY3/24-70),O53623_MYCTU/19-65,O53119_MYCLE/19-65);
(((((((((((((P96856_MYCTU/21-67:0.36372,Y790_MYCBO/35-81:0.61235):0.09166,((Q54288_STRHY/25-71:0.44413,(O50423_MYCTU/23-69:0.37233,P72185_9ACTO/45-91:0.21283):0.05637):0.14069,((O53317_MYCTU/26-72:0.33683,Q51730_PSEFL/22-68:0.56780):0.13572,Y1581_MYCBO/25-71:0.47211):0.09593):0.39475):0.11772,((Q9ZFC1_MYCSM/18-64:0.61332,O54102_STRCO/20-66:0.34362):0.08032,O69909_STRCO/12-58:0.60046):0.08813):0.13343,(((Y1388_MYCBO/21-67:0.67887,(Q9Z480_9RHIZ/8-54:0.09943,(((TER5_ECOLI/9-55:0.43744,TER4_ECOLI/8-54:0.00000):0.21259,TER3_ECOLI/9-55:0.12201):0.13172,Q9Z551_STRCO/18-64:0.67272):0.05623):0.20128):0.00000,(Q53901_STRCO/36-82:0.26266,O52558_AMYMD/34-80:0.45903):0.40177):0.22201,O87854_STRCO/12-58:0.52141):0.14899):0.07829,(YIJC_ECOLI/15-62:0.54103,O53295_MYCTU/35-80:0.94247):0.20081):0.13927,((PKSA_BACSU/14-57:0.56821,(Q53772_STAAU/14-60:0.56252,YDH1_XANAU/20-66:0.62511):0.15208):0.07165,((BETI_ECOLI/14-60:0.50550,BETI_RHIME/14-60:0.49352):0.07950,(O33453_PSEPU/19-65:0.73572,(O86510_STRCO/15-61:0.49038,Q55363_SYNY3/17-63:0.63833):0.05289):0.18428):0.12621):0.20809):0.19557,(((((O66658_AQUAE/15-61:0.33033,((YCFQ_ECOLI/24-70:0.33470,YJGJ_ECOLI/21-67:0.69560):0.53948,O32228_BACSU/5-50:0.57241):0.10836):0.18887,(Q9ZGB7_STRCY/16-62:0.50156,(Q51516_PSEAE/7-53:0.15001,Q9Z3X8_9PSED/7-53:0.08429):0.56061):0.00000):0.09088,(((YUXN_BACSU/8-54:0.07080,YERO_BACSU/8-54:0.34359):0.20419,P94423_BACSU/8-54:0.47706):0.11476,O28458_ARCFU/8-54:0.62640):0.08403):0.11168,((Q59306_CLOPA/8-54:0.42245,(((O69500_MYCLE/17-63:0.44826,O27135_METTH/17-63:0.47044):0.13186,O05858_MYCTU/44-90:0.55632):0.09766,(((O86852_STRCO/14-60:0.12475,((AFRP_STRGR/14-60:0.25277,(O24739_STRVG/15-61:0.56928,O66121_STRCO/14-60:0.19833):0.18015):0.05363,Q9ZHP8_STRFR/13-59:0.23534):0.15618):0.20872,(((YXAF_BACSU/11-58:0.20951,O34619_BACSU/10-57:0.04013):0.45357,O85706_CLOAB/14-60:0.38821):0.12623,(((TCMR_STRGA/32-78:0.85157,O53054_LISIV/8-54:0.07593):0.30145,Q59213_BACME/8-54:0.36784):0.20880,YPB3_LACLA/13-59:0.47134):0.13739):0.20698):0.18202,((YWCC_BACSU/17-63:0.83518,P96812_MYCTU/20-66:0.58258):0.14706,(QACR_STAAM/7-53:0.38552,O67157_AQUAE/7-53:0.30725):0.14526):0.07657):0.08557):0.03831):0.02611,(((Y893_HAEIN/12-58:0.62124,P94548_BACSU/11-57:0.32986):0.19620,(YHGD_BACSU/9-55:0.29871,(BM3R_BACME/11-57:0.14630,O08335_BACSU/12-58:0.22147):0.43237):0.18544):0.05726,((((O66635_AQUAE/12-58:0.22820,P96701_BACSU/12-58:0.50675):0.10008,((P95100_MYCTU/26-72:0.53322,P96222_MYCTU/29-75:0.40883):0.43179,Q9ZN97_ECOLI/22-68:0.60225):0.16138):0.09907,(UIDR_ECOLI/16-62:0.45043,O07001_BACSU/12-58:0.35583):0.09908):0.16488,(O31560_BACSU/17-63:0.54818,O08377_MYCTU/24-70:0.42614):0.06815):0.15368):0.08956):0.08509):0.08259,((O27815_METTH/18-64:0.54836,O34643_BACSU/8-54:0.16863):0.20229,(P73186_SYNY3/47-93:0.52751,((O67930_AQUAE/8-54:0.80795,(TTK_HAEIN/36-82:0.27827,TTK_ECOLI/16-62:0.23026):0.54091):0.18205,O67927_AQUAE/18-64:0.15285):0.21458):0.13234):0.17950):0.06482):0.13546,((Q9Z601_NOSPU/12-57:0.41843,((YBIH_ECOLI/17-62:0.47002,(YTTP_BACSU/9-55:0.65026,O07252_MYCTU/11-57:0.51236):0.09443):0.17364,(LUXR_VIBHA/21-67:0.79762,O86312_MYCTU/12-57:0.45136):0.19351):0.15222):0.11548,(O53612_MYCTU/19-64:0.61278,(Y3439_MYCBO/23-69:0.41996,O33187_MYCTU/24-70:0.45189):0.17865):0.03064):0.15883):0.09051,(((O54185_STRCO/76-120:0.55802,O07254_MYCTU/13-59:0.90089):0.21545,((((O07229_MYCTU/19-65:0.54376,O53310_MYCTU/15-61:0.43139):0.00000,P95251_MYCTU/223-269:0.65549):0.21040,(O06169_MYCTU/30-76:0.24546,P95251_MYCTU/19-65:0.42091):0.16324):0.13487,(P96839_MYCTU/15-61:0.52071,((O86514_STRCO/19-65:0.35729,O53323_MYCTU/22-68:0.38880):0.31667,O08306_NOCSI/21-64:0.25670):0.10878):0.14625):0.13727):0.08059,(O53165_MYCTU/16-62:0.63735,(O68442_9RHIZ/15-61:0.50535,((ENVR_ECOLI/16-62:0.44956,ACRR_ECOLI/16-62:0.16966):0.11098,MTRR_NEIGO/15-61:0.32816):0.18910):0.09423):0.00000):0.10063):0.02673,TETC_ECOLI/18-64:0.63844):0.00640,P96821_MYCTU/93-139:0.55442):0.34165,P72624_SYNY3/24-70:0.30464):0.49188,O53623_MYCTU/19-65:0.00000,O53119_MYCLE/19-65:0.33350);