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1. Introduction

ChEBI se présente comme la ressource publique des entités moléculaires, avec un accent plus particulier sur les composés chimiques de ‘petite taille’. Le terme d’entité moléculaire s’applique pour décrire tout atome, molécule, ion, paire d’ions, radical, ion radical, complexe, conformère, etc. bien défini d'un point de vue chimique ou isotopique et pouvant être identifié individuellement en tant qu’entité distincte. Les entités moléculaires en question sont soit naturelles, soit synthétiques et interviennent dans des processus chimiques se déroulant au sein des êtres vivants.

ChEBI est aussi une classification, et ce sous la forme d’une ontologie, où les relations entre entités moléculaires (ou classes d’entités moléculaires) et leurs ascendants/descendants sont clairement spécifiées.

ChEBI utilise la nomenclature, la terminologie et les symboles internationaux établis par les instances scientifiques officielles suivantes:

Par convention, les molécules polyméres codées par les génomes (e.g. acides nucléiques, protéines et peptides dérivés de protéines par clivage) ne sont pas représentés dans ChEBI.

L’ensemble des données contenues dans ChEBI est libre de droit ou est issu de ressources libres de droit. ChEBI est donc une ressource libre d’accès. De plus, chaque entrée est parfaitement traçable et référence explicitement la source primaire d’information.

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2. Origine des données

Plusieurs sources d’information ont été utilisées afin de créer ChEBI. Les données issues de ces ressources ont été filtrées et, le cas échéant, fusionnées afin d’éviter toute duplication.

Parmi les diverses sources d’information, 2 d’entres elles sont prééminentes:

La liste complète des sources de données primaires peut être consultée dans le guide d’utilisation.

3. Données

ChEBI propose les champs de données suivants:

De plus, une nouvelle page ('Automatic Xrefs') présente une série de références, créees automatiquement et renvoyant vers de nombreuses banques de donnees biologiques et chimiques.

5. Remerciements

ChEBI est actuallement développé avec le soutien de la Commission Européenne, financement SLING (contrat 226073, Activité d'integration, Infrastructure de recherche FP7).

Previous funding:

Nous souhaitons également remercier le soutien logiciel suivant: