Array Design Name JCVI PFGRC Streptococcus mutans 10K v2.1 array designed primarily based on strain UA159 [FULL_FEATURE_LAYOUT] Provider Jerry Li(jli@jcvi.org) Comment[ArrayExpressAccession] A-GEOD-4340 Comment[SecondaryAccession] GPL4340 Comment[Description] Array Manufacturer: TIGR PFGRC, Distribution: non-commercial, Technology: spotted oligonucleotide, This set includes 1948 oligonucleotides, has 10752 spots distributed in 96 blocks.
Reporter Name = Unique identification of each spot
Comment[Row] = Row of slide
Comment[Column] = Colunm of slide
Comment[Meta Row] = Meta row of slide
Comment[Meta Column] = Meta colunm of slide
Comment[Sub Row] = Row of block
Comment[Sub Column] = Colunm of block
Comment[Oligo ID] = Oligo identification
Reporter Sequence = Oligo sequence
Comment[GC%] = GC content of the sequence
Comment[Internal Repeat Score] = Internal repeat score
Comment[Self-Annealing Score] = Self-anneal score
Comment[Primary Strain] = The strain of primary target
Comment[Primary Target] = Locus primarily hit by the oligo
Comment[Common Name of Primary Target] = Common name of primary target
Comment[Gene Symbol] = Gene symbol
Comment[Strain UA159] = Target map of strain UA159
Comment[ORF] = Locus primarily hit by the oligo LINK_PRE:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=gene&cmd=search&term= LINK_SUF:[gene name]
Comment[SPOT_ID] = spot identifier Comment[SubmittedName] JCVI PFGRC Streptococcus mutans 10K v2.1 array designed primarily based on strain UA159 [FULL_FEATURE_LAYOUT] Comment[Organism] Streptococcus mutans Printing Protocol 2QSM, with arrayer LUCIDEA, mode Normal, replicates 4, repeats 1, slide_dips 38, machine cycles 6075497, pen id 10185, pen cycles -1, operator cs, humidity control On, humidity set point65 Surface Type Epoxy Substrate Type Term Source Name Comment[AdditionalFile:txt] A-GEOD-4340_comments.txt [main] Reporter Name Reporter Sequence 1 GGTTCATCTTTTTTCCTTTGTTAAGCTTATTTATTATGATATAATGAAGTATTCAATTGAAGAAAAAGTC 2 GAAAATCGAAAAAGACTTCTCAGACAAGAGGCTTTAGGGCATTTTTTGATATAATAAGAAAAAAGATTAA 3 TGAGGAAAATTCGTTTTTTAAAATTGTCCAAGTTCCTAAATCCAAAGGCATTGGCTTTGATATCTTTGAT 4 GCTTTTCGAAAGAAAAATCATAATGATTTGCGACACTCTGAAAGACTGCTATCAACTAACTTTCAGAGTG 5 CAGTTACACCAAATTCTTCTTCAATCGCTTTTACAAGATCGTTAAGCTCAAGGATTGAAGCTTCTTTAAT 6 GCAGGCTAAAAATGATGATGTTGAAACTTTTGATAGTTTTGATGATTGGAAATCAGAGATGAGTGCCTAT 7 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