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PDBsum entry 4xuj
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Pore analysis for: 4xuj calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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4xuj
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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30 pores,
coloured by radius |
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30 pores,
coloured by radius
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30 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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1.82 |
2.11 |
26.0 |
-1.75 |
-0.66 |
20.6 |
77 |
|
2 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
|
DA -32 I DA -31 I DA -
30 I DG 26 J DC 27 J DA 28 J DA 35 J DA 36 J
|
 |
|
2 |
 |
3.13 |
3.17 |
29.2 |
-2.39 |
-0.20 |
27.5 |
79 |
4 |
0 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DG -
34 I DA 37 I DT 38 I DC 40 I DA 41 I DC 42 I DA -
45 J DA -43 J DG -42 J DT -41 J DT -39 J
|
|
3 |
 |
3.58 |
3.74 |
32.0 |
-1.89 |
-0.78 |
20.5 |
89 |
3 |
1 |
3 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DG 57 I DC 58 I DA 59 I DG 60 I DC -63 J DA -
62 J DC -61 J DC -60 J DG -55 J DT 19 J DG 20 J
|
|
4 |
 |
1.92 |
1.92 |
42.8 |
-0.58 |
-0.62 |
7.7 |
82 |
2 |
0 |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DT -21 I DC -20 I DA -16 I DG 60 I DG 61 I DC -
57 J DA -56 J DG -55 J DT 17 J DT 19 J DG 20 J
|
|
5 |
 |
0.92 |
0.92 |
44.2 |
-0.86 |
-0.78 |
9.5 |
77 |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DG -40 I DT -39 I DA -38 I DT -37 I DT -36 I DT -
35 I DG -34 I DC 40 I DA 41 I DA -
45 J DT 38 J DA 39 J DC 40 J DA 41 J DC 42 J
|
|
6 |
 |
1.24 |
1.24 |
44.7 |
-1.12 |
-0.68 |
10.4 |
83 |
3 |
0 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
DG -34 I DG -33 I DT 46 I DG 47 I DT -50 J DA -
46 J DA -45 J DA -44 J DA -43 J DT 30 J
|
|
7 |
 |
2.11 |
2.32 |
45.4 |
-2.37 |
-0.61 |
26.5 |
74 |
4 |
1 |
0 |
0 |
0 |
1 |
0 |
DG -14 I DC -13 I DA -12 I DT -
11 I DG 57 I DC 58 I DA 59 I DG 60 I DG 61 I DT
62 I DA -66 J DT -65 J DC -64 J DC -63 J DA -
62 J DC -61 J DC -60 J DC 10 J DA 11 J DT 12 J
|
|
8 |
 |
2.60 |
2.86 |
46.0 |
-1.68 |
-0.48 |
20.1 |
86 |
6 |
0 |
5 |
2 |
1 |
0 |
0 |
4A6 201 D DG -34 I DC -24 I DG -55 J DA -45 J DA -
44 J DG 20 J DA 28 J
|
|
9 |
 |
2.84 |
2.84 |
47.9 |
-2.98 |
-0.49 |
35.1 |
79 |
9 |
0 |
1 |
0 |
1 |
0 |
0 |
DA -44 I DA -43 I DG -42 I DT -41 I DT -
39 I DA 28 I DG 29 I DT 30 I DG -34 J DG -
33 J DA -32 J DA -31 J DC -
29 J DA 35 J DA 36 J DA 37 J DT 38 J DC 40 J
|
|
10 |
 |
2.42 |
2.65 |
48.4 |
-1.60 |
-0.68 |
14.8 |
90 |
8 |
0 |
6 |
2 |
0 |
0 |
0 |
DA -31 I DC -24 I DG -
55 J DG 20 J DG 26 J DC 27 J DA 28 J
|
|
11 |
 |
2.12 |
2.31 |
49.2 |
-2.26 |
-0.67 |
25.7 |
74 |
5 |
2 |
0 |
0 |
0 |
1 |
0 |
DC -24 I DG -14 I DC -13 I DA -12 I DT -
11 I DG 60 I DG 61 I DA -66 J DG -
55 J DC 10 J DA 11 J DT 12 J DT 19 J DG 20 J
|
|
12 |
|
3.87 |
3.93 |
55.7 |
-1.31 |
-0.71 |
14.9 |
75 |
3 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DA -16 I DG -15 I DG -
14 I DC 58 I DA 59 I DG 60 I DG 61 I DT 62 I DA -
66 J DT -65 J DC -64 J DC -63 J DA -62 J DC -
61 J DC -60 J DC -57 J DG 20 J
|
|
13 |
|
2.12 |
2.27 |
56.8 |
-1.46 |
-0.69 |
15.4 |
74 |
3 |
1 |
0 |
0 |
0 |
1 |
0 |
DA -16 I DG -15 I DG -14 I DC -13 I DA -12 I DT -
11 I DG 61 I DT 62 I DA -66 J DC -
57 J DC 10 J DA 11 J DT 12 J DG 20 J
|
|
14 |
|
2.61 |
3.31 |
62.0 |
-1.99 |
-0.72 |
24.2 |
80 |
7 |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DA -44 I DT -35 I DG -
34 I DA 28 I DG 29 I DT 30 I DA 39 I DC 40 I DA
41 I DA -45 J DT -35 J DG -34 J DG -33 J DA -
32 J DA -31 J DC -29 J DA 39 J
|
|
15 |
|
2.68 |
3.30 |
62.3 |
-2.12 |
-0.63 |
26.0 |
78 |
7 |
2 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DA -44 I DA -43 I DG -42 I DT -41 I DT -39 I DT -
35 I DG -34 I DA 39 I DC 40 I DA 41 I DA -
45 J DT -35 J DG -
34 J DA 36 J DA 37 J DT 38 J DA 39 J DC 40 J
|
|
16 |
|
2.62 |
2.77 |
69.5 |
-2.77 |
-0.41 |
30.1 |
78 |
15 |
3 |
4 |
2 |
3 |
0 |
0 |
4A6 203 H DA 28 I DG 29 I DA -31 J DC -29 J
|
|
17 |
|
1.27 |
1.27 |
70.6 |
-1.18 |
-0.70 |
11.3 |
89 |
4 |
0 |
4 |
0 |
1 |
1 |
0 |
DT -25 I DC -
24 I DT 46 I DG 47 I DG 48 I DT 49 I DA 50 I DG
51 I DG -55 J DC -47 J DA -46 J DA -45 J DA -
44 J DA -43 J DG 20 J
|
|
18 |
|
2.27 |
3.76 |
72.2 |
-2.64 |
-0.46 |
31.2 |
78 |
13 |
4 |
3 |
1 |
2 |
0 |
0 |
4A6 201 D DG -34 I DA 41 I DA -45 J DA -44 J
|
|
19 |
|
2.26 |
3.70 |
79.1 |
-2.52 |
-0.53 |
27.5 |
84 |
12 |
4 |
8 |
2 |
2 |
0 |
0 |
4A6 201 D DC -24 I DG -55 J DG 20 J DA 28 J
|
|
20 |
|
2.77 |
3.99 |
95.3 |
-2.85 |
-0.45 |
32.1 |
80 |
16 |
2 |
4 |
2 |
4 |
0 |
0 |
4A6 203 H DA -44 I DA -43 I DG -42 I DT -41 I DT -
39 I DG -34 J DA 36 J DA 37 J DT 38 J DC 40 J
|
|
21 |
|
2.36 |
2.37 |
103.0 |
-2.22 |
-0.46 |
24.5 |
82 |
15 |
3 |
9 |
4 |
3 |
0 |
0 |
4A6 203 H DG -
55 I DT 17 I DT 19 I DG 20 I DA 21 I DA 28 I DC -
24 J DA -22 J DT -21 J DC -20 J DA -19 J
|
|
22 |
|
2.16 |
2.23 |
110.6 |
-1.49 |
-0.61 |
18.0 |
86 |
9 |
2 |
7 |
3 |
1 |
0 |
0 |
4A6 203 H DG -55 I DA -44 I DT -35 I DG -
34 I DT 17 I DT 19 I DG 20 I DA 21 I DA 28 I DA
39 I DC 40 I DA 41 I DA -45 J DT -35 J DG -
34 J DC -24 J DA -22 J DT -21 J DC -20 J DA -
19 J DA 39 J
|
|
23 |
|
1.90 |
1.89 |
110.0 |
-1.70 |
-0.64 |
17.5 |
76 |
5 |
1 |
1 |
0 |
0 |
2 |
0 |
DC -7 I DA -6 I DG -
5 I DC 58 I DA 59 I DG 60 I DT 68 I DT 69 I DG 70
I DA 71 I DT 72 I DA -69 J DA -68 J DT -67 J DC -
64 J DC -63 J DA -62 J DC -61 J DC -60 J DT 12 J
|
|
24 |
|
2.28 |
2.33 |
121.8 |
-1.71 |
-0.35 |
19.2 |
85 |
13 |
3 |
15 |
6 |
5 |
0 |
0 |
4A6 201 D 4A6 203 H DG -55 I DC -
24 I DT 17 I DT 19 I DG 20 I DA 21 I DA 28 I DG -
55 J DC -24 J DA -22 J DT -21 J DC -20 J DA -
19 J DG 20 J DA 28 J
|
|
25 |
|
1.80 |
1.85 |
139.5 |
-1.82 |
-0.63 |
21.2 |
85 |
12 |
4 |
6 |
3 |
1 |
1 |
0 |
4A6 203 H DA -66 I DT -65 I DG -55 I DA -44 I DT -
35 I DG -
34 I DC 10 I DA 11 I DT 19 I DA 28 I DA 39 I DC
40 I DA 41 I DA -45 J DT -35 J DG -34 J DC -
24 J DG -14 J DC -13 J DA -12 J DT -
11 J DA 39 J DG 60 J DG 61 J
|
|
26 |
|
1.51 |
1.51 |
141.4 |
-1.40 |
-0.67 |
14.2 |
78 |
6 |
0 |
1 |
0 |
0 |
2 |
0 |
DA -16 I DG -15 I DG -14 I DC -7 I DA -6 I DG -
5 I DA 59 I DG 60 I DG 61 I DT 62 I DT 68 I DT 69
I DG 70 I DA 71 I DT 72 I DA -69 J DA -68 J DT -
67 J DA -66 J DT -65 J DC -64 J DC -63 J DC -
57 J DG 20 J
|
|
27 |
|
1.93 |
1.98 |
150.6 |
-1.92 |
-0.40 |
21.4 |
84 |
16 |
5 |
14 |
6 |
5 |
1 |
0 |
4A6 201 D 4A6 203 H DA -66 I DG -55 I DC -
24 I DC 10 I DA 11 I DT 19 I DA 28 I DG -55 J DC -
24 J DG -14 J DC -13 J DA -12 J DT -
11 J DG 20 J DA 28 J DG 60 J DG 61 J
|
|
28 |
|
2.10 |
2.08 |
155.7 |
-1.43 |
-0.41 |
19.1 |
81 |
10 |
2 |
4 |
7 |
0 |
2 |
0 |
DC -7 I DA -6 I DG -5 I DC -4 I DT -3 I DG -
2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DG 70 I DA 71 I DT 72 I DA -
69 J DA -68 J DT -67 J DG -2 J DT 0 J DT 12 J
|
|
29 |
|
1.81 |
1.84 |
165.3 |
-1.55 |
-0.49 |
17.9 |
80 |
10 |
2 |
4 |
5 |
0 |
2 |
0 |
DT -67 I DA -66 I DA -
1 I DT 1 I DC 10 I DA 11 I DT 12 I DC -13 J DA -
12 J DT -11 J DT -8 J DC -7 J DA -6 J DG -5 J DC -
4 J DA 71 J DT 72 J
|
 |
30 |
|
1.91 |
2.03 |
207.1 |
-1.53 |
-0.59 |
17.1 |
74 |
10 |
1 |
0 |
2 |
0 |
4 |
0 |
DT -67 I DA -66 I DC -7 I DA -6 I DG -5 I DC -
4 I DT -3 I DG -2 I DA -
1 I DA 0 I DT 1 I DC 10 I DA 11 I DT 12 I DG 70 I
DA 71 I DT 72 I DA -69 J DA -68 J DT -67 J DC -
13 J DA -12 J DT -11 J DT -8 J DC -7 J DA -
6 J DG -5 J DC -4 J DG -
2 J DT 0 J DT 12 J DA 71 J DT 72 J
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
 |
Residue-type_colouring |
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|
|
Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program