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PDBsum entry 4xk8

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Top Page protein ligands Protein-protein interface(s) pores links
Pore analysis for: 4xk8 calculated with MOLE 2.0 PDB id
4xk8
Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands

View options
MOLEonline 2.0 manipulation
and
visualization
with HETATM:
without HETATM:
 
39 pores, coloured by radius 31 pores, coloured by radius 31 pores, coloured as in
list below
Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown.
Pores
Free R
Length
HPathy
HPhob
Polar
Rel Mut
Residue..type
Ligands
Radius
1 1.42 1.46 61.2 -1.08 -0.31 19.6 86 5 2 4 7 1 2 0  
2 1.30 1.31 96.8 0.41 0.47 8.0 76 5 1 6 16 6 2 0  CLA 806 a CLA 807 a CLA 809 a CLA 814 a CLA 820 a
CLA 829 a CLA 830 a CLA 831 a BCR 851 a BCR 854 a
BCR 3003 j
3 1.30 1.30 103.8 0.40 0.47 11.5 73 7 1 2 19 8 2 0  CLA 816 a CLA 818 a CLA 819 a CLA 820 a CLA 828 a
CLA 830 a CLA 836 a CLA 837 a BCR 849 a BCR 850 a
BCR 853 a CLA 1401 k
4 2.43 2.44 126.4 0.59 0.66 11.0 76 9 2 5 17 13 1 0  CLA 805 b CLA 806 b CLA 813 b CLA 816 b CLA 817 b
CLA 818 b CLA 819 b CLA 820 b CLA 824 b CLA 826 b
CLA 828 b CLA 829 b CLA 834 b CLA 835 b BCR 843 b
BCR 844 b BCR 847 b DGD 849 b CLA 101 g CLA 102 g
BCR 104 g
5 1.96 1.97 140.6 1.04 0.76 9.2 73 9 0 4 24 12 0 0  CLA 806 a CLA 807 a CLA 809 a CLA 814 a CLA 816 a
CLA 818 a CLA 819 a CLA 820 a CLA 828 a CLA 829 a
CLA 830 a CLA 831 a CLA 836 a CLA 837 a BCR 849 a
BCR 850 a BCR 851 a BCR 853 a BCR 854 a BCR 3003
j CLA 1401 k
6 1.39 2.18 147.5 -0.41 0.17 13.3 79 10 5 11 17 9 4 0  CLA 803 a CLA 805 b CLA 806 b CLA 808 b CLA 809 b
CLA 810 b CLA 827 b CLA 828 b CLA 829 b BCR 844 b
BCR 848 b DGD 849 b BCR 201 l
7 1.30 1.31 154.8 0.58 0.52 9.3 73 12 1 6 21 13 3 0  CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807 a CLA 814 a
CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a CLA 841 a CLA 842 a
CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 851 a BCR 854 a
BCR 801 b CLA 832 b CLA 833 b HTG 7001 f CLA 7002
f BCR 3003 j
8 1.98 2.12 160.7 0.42 0.45 8.0 73 8 2 8 23 17 3 0  CLA 801 a CLA 802 a CLA 803 a CLA 804 a CLA 809 a
CLA 810 a CLA 829 a CLA 834 a CLA 835 a CLA 843 a
BCR 854 a CLA 856 a CLA 802 b CLA 803 b CLA 809 b
CLA 810 b CLA 833 b CLA 839 b CLA 840 b PQN 842 b
BCR 848 b BCR 101 i BCR 3003 j BCR 201 l
9 2.49 2.65 170.7 0.40 0.61 13.0 75 15 2 8 24 19 1 0  BCR 801 b CLA 805 b CLA 806 b CLA 813 b CLA 817 b
CLA 818 b CLA 825 b CLA 826 b CLA 827 b CLA 828 b
CLA 829 b CLA 832 b CLA 833 b CLA 834 b CLA 835 b
CLA 836 b CLA 837 b CLA 838 b CLA 841 b BCR 844 b
DGD 849 b HTG 7001 f BCR 7004 f BCR 3003 j
10 1.35 2.17 170.3 0.29 0.52 10.8 75 10 3 7 22 13 5 0  CLA 803 a CLA 805 b CLA 806 b CLA 808 b CLA 809 b
CLA 810 b CLA 813 b CLA 815 b CLA 816 b CLA 817 b
CLA 818 b CLA 819 b CLA 820 b CLA 824 b CLA 826 b
CLA 827 b CLA 828 b CLA 829 b CLA 834 b CLA 835 b
BCR 843 b BCR 844 b BCR 847 b BCR 848 b DGD 849 b
CLA 101 g CLA 102 g BCR 104 g BCR 201 l
11 1.30 1.31 175.5 0.34 0.46 9.2 70 9 2 5 21 14 4 0  CHL 601 7 CLA 602 7 CLA 610 7 CLA 612 7 XAT 616 7
LHG 618 7 CLA 312 8 BCR 316 8 CLA 804 a CLA 805 a
CLA 806 a CLA 807 a CLA 810 a CLA 812 a CLA 814 a
CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a BCR 851 a
12 1.88 2.28 185.7 0.21 0.31 10.4 78 10 3 10 17 13 3 0  CLA 805 b CLA 806 b CLA 813 b CLA 816 b CLA 817 b
CLA 818 b CLA 819 b CLA 824 b CLA 826 b CLA 828 b
CLA 829 b CLA 834 b CLA 835 b BCR 844 b BCR 847 b
DGD 849 b CLA 101 g
13 2.12 2.34 191.4 0.58 0.61 7.7 70 11 2 7 23 25 5 0  CLA 801 a CLA 802 a CLA 803 a CLA 804 a CLA 834 a
CLA 835 a CLA 841 a CLA 842 a CLA 843 a PQN 845 a
BCR 854 a CLA 856 a BCR 801 b CLA 802 b CLA 803 b
CLA 809 b CLA 810 b CLA 832 b CLA 833 b CLA 839 b
CLA 840 b PQN 842 b BCR 848 b HTG 7001 f CLA 7002
f BCR 101 i BCR 3003 j BCR 201 l
14 1.58 1.53 194.7 -0.12 0.10 12.4 75 13 4 6 22 12 7 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CLA 806 A
CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A CLA 815 A CLA 818 A
CLA 819 A CLA 820 A CLA 821 A CLA 828 A CLA 830 A
CLA 836 A CLA 837 A BCR 848 A BCR 849 A BCR 851 A
CLA 4002 K
15 1.43 1.45 195.9 0.44 0.56 12.4 75 12 1 7 25 17 3 0  CLA 802 a CLA 804 a CLA 809 a CLA 810 a CLA 829 a
CLA 843 a BCR 854 a CLA 856 a BCR 801 b CLA 815 b
CLA 816 b CLA 817 b CLA 820 b CLA 825 b CLA 826 b
CLA 832 b CLA 833 b CLA 834 b CLA 835 b CLA 836 b
CLA 837 b CLA 838 b CLA 841 b BCR 843 b BCR 847 b
HTG 7001 f CLA 7002 f BCR 7004 f CLA 101 g CLA
102 g BCR 104 g BCR 3003 j
16 2.02 3.61 198.6 0.96 0.71 10.1 71 16 0 4 29 19 1 0  CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807 a CLA 814 a
CLA 816 a CLA 818 a CLA 819 a CLA 820 a CLA 828 a
CLA 830 a CLA 831 a CLA 836 a CLA 837 a CLA 841 a
CLA 842 a CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 849 a
BCR 850 a BCR 851 a BCR 853 a BCR 854 a BCR 801 b
CLA 832 b CLA 833 b HTG 7001 f CLA 7002 f BCR
3003 j CLA 1401 k
17 1.32 1.85 204.1 0.03 0.32 16.9 78 18 4 9 30 14 1 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CLA 806 A
CLA 807 A CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A CLA 821 A
CLA 822 A CLA 825 A CLA 826 A CLA 827 A CLA 831 A
CLA 832 A CLA 833 A CLA 840 A CLA 845 A LHG 847 A
BCR 849 A BCR 850 A BCR 851 A
18 1.62 1.82 206.7 0.63 0.54 11.7 66 11 3 4 26 18 2 0  CHL 601 2 CLA 602 2 CLA 603 2 CLA 608 2 CLA 610 2
CLA 612 2 XAT 616 2 LHG 618 2 CLA 302 3 CLA 303 3
CHL 307 3 CLA 315 3 XAT 317 3 BCR 318 3 CLA 805 A
CLA 806 A CLA 807 A CLA 808 A CLA 811 A CLA 812 A
CLA 813 A CLA 814 A CLA 821 A CLA 826 A CLA 831 A
BCR 849 A
19 2.02 3.63 219.3 0.78 0.65 9.8 69 13 1 3 29 20 2 0  CHL 601 7 CLA 602 7 CLA 610 7 CLA 612 7 XAT 616 7
LHG 618 7 CLA 312 8 BCR 316 8 CLA 804 a CLA 805 a
CLA 806 a CLA 807 a CLA 810 a CLA 812 a CLA 814 a
CLA 816 a CLA 818 a CLA 819 a CLA 820 a CLA 828 a
CLA 830 a CLA 831 a CLA 836 a CLA 837 a BCR 849 a
BCR 850 a BCR 851 a BCR 853 a CLA 1401 k
20 1.33 1.73 228.6 0.37 0.53 9.7 70 15 3 7 31 24 5 0  CLA 801 a CLA 802 a CLA 803 a CLA 805 a CLA 806 a
CLA 807 a CLA 814 a CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a
CLA 834 a CLA 835 a CLA 841 a CLA 843 a PQN 845 a
LHG 847 a BCR 851 a CLA 856 a BCR 801 b CLA 802 b
CLA 803 b CLA 809 b CLA 810 b CLA 839 b CLA 840 b
PQN 842 b BCR 848 b BCR 101 i BCR 201 l
21 1.23 1.29 233.8 0.67 0.74 11.6 72 18 1 5 29 22 4 0  CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807 a CLA 814 a
CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a CLA 841 a CLA 842 a
CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 851 a BCR 854 a
BCR 801 b CLA 815 b CLA 816 b CLA 817 b CLA 820 b
CLA 825 b CLA 826 b CLA 832 b CLA 833 b CLA 834 b
CLA 835 b CLA 836 b CLA 837 b CLA 838 b CLA 841 b
BCR 843 b HTG 7001 f CLA 7002 f BCR 7004 f CLA
101 g CLA 102 g BCR 104 g BCR 3003 j
22 1.26 1.39 270.3 0.36 0.60 13.7 74 23 3 10 35 25 3 0  CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807 a CLA 814 a
CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a CLA 841 a CLA 842 a
CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 851 a BCR 854 a
BCR 801 b CLA 805 b CLA 806 b CLA 813 b CLA 817 b
CLA 818 b CLA 825 b CLA 826 b CLA 828 b CLA 829 b
CLA 832 b CLA 833 b CLA 834 b CLA 835 b CLA 836 b
CLA 837 b CLA 838 b CLA 841 b BCR 844 b DGD 849 b
HTG 7001 f CLA 7002 f BCR 7004 f BCR 3003 j
23 1.93 2.25 273.2 0.14 0.55 9.3 67 14 3 7 23 34 6 0  CHL 601 7 CLA 602 7 CLA 610 7 CLA 612 7 XAT 616 7
LHG 618 7 CLA 312 8 BCR 316 8 CLA 801 a CLA 802 a
CLA 803 a CLA 804 a CLA 805 a CLA 809 a CLA 812 a
CLA 831 a CLA 834 a CLA 835 a CLA 841 a CLA 842 a
CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a CLA 856 a BCR 801 b
CLA 802 b CLA 803 b CLA 809 b CLA 810 b CLA 839 b
CLA 840 b PQN 842 b BCR 848 b BCR 101 i BCR 3004
j BCR 201 l
24 2.51 2.69 298.1 0.16 0.63 13.7 72 22 3 8 27 32 4 0  CHL 601 7 CLA 602 7 CLA 610 7 CLA 612 7 XAT 616 7
LHG 618 7 CLA 312 8 BCR 316 8 CLA 802 a CLA 804 a
CLA 805 a CLA 809 a CLA 812 a CLA 831 a CLA 841 a
CLA 842 a CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 854 a
CLA 856 a BCR 801 b CLA 805 b CLA 806 b CLA 813 b
CLA 817 b CLA 818 b CLA 825 b CLA 826 b CLA 828 b
CLA 829 b CLA 832 b CLA 833 b CLA 834 b CLA 835 b
CLA 836 b CLA 837 b CLA 838 b CLA 841 b BCR 844 b
DGD 849 b HTG 7001 f CLA 7002 f BCR 7004 f BCR
3003 j BCR 3004 j
25 1.31 3.11 323.1 0.66 0.58 11.5 73 19 1 8 41 26 5 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CLA 806 A
CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A CLA 815 A CLA 819 A
CLA 820 A CLA 821 A CLA 822 A CLA 824 A CLA 825 A
CLA 827 A CLA 828 A CLA 830 A CLA 833 A CLA 834 A
CLA 835 A CLA 836 A CLA 837 A CLA 838 A CLA 839 A
CLA 840 A BCR 848 A BCR 849 A BCR 850 A BCR 851 A
CLA 203 L CLA 204 L CLA 804 a CLA 841 a CLA 842 a
CLA 843 a PQN 845 a BCR 854 a BCR 801 b CLA 832 b
CLA 833 b HTG 7001 f CLA 7002 f BCR 3003 j
26 1.32 1.45 344.5 0.42 0.43 10.2 73 20 3 10 49 27 6 0  CLA 801 A CLA 802 A CLA 803 A CLA 804 A CLA 810 A
CLA 829 A CLA 834 A CLA 835 A CLA 842 A BCR 852 A
CLA 854 A CLA 802 B CLA 803 B CLA 810 B CLA 833 B
CLA 840 B BCR 848 B BCR 101 I BCR 3003 J BCR 201
L CLA 204 L CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807
a CLA 814 a CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a CLA 841
a CLA 842 a CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 851
a BCR 801 b CLA 832 b CLA 7002 f
27 1.32 1.45 379.4 0.58 0.57 11.7 73 23 2 8 50 29 6 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CLA 806 A
CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A CLA 815 A CLA 819 A
CLA 820 A CLA 821 A CLA 822 A CLA 825 A CLA 827 A
CLA 828 A CLA 830 A CLA 833 A CLA 834 A CLA 835 A
CLA 836 A CLA 837 A CLA 838 A CLA 839 A CLA 840 A
BCR 848 A BCR 849 A BCR 850 A BCR 851 A CLA 203 L
CLA 204 L CLA 804 a CLA 805 a CLA 806 a CLA 807 a
CLA 814 a CLA 820 a CLA 830 a CLA 831 a CLA 841 a
CLA 842 a CLA 843 a PQN 845 a LHG 847 a BCR 851 a
BCR 801 b CLA 7002 f
28 1.29 1.48 386.8 -0.10 0.25 15.3 72 25 11 8 39 27 8 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CHL 303 6
CLA 304 6 CLA 305 6 CLA 309 6 CLA 310 6 CLA 311 6
CLA 312 6 CLA 314 6 CLA 315 6 LHG 320 6 CLA 604 9
CHL 605 9 CHL 607 9 CLA 609 9 CHL 615 9 LUT 616 9
BCR 618 9 CLA 806 A CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A
CLA 815 A CLA 819 A CLA 820 A CLA 821 A CLA 822 A
CLA 824 A CLA 825 A CLA 827 A CLA 828 A CLA 830 A
CLA 833 A CLA 834 A CLA 835 A CLA 836 A CLA 837 A
CLA 838 A CLA 839 A CLA 840 A BCR 848 A BCR 849 A
BCR 850 A BCR 851 A CLA 203 L CLA 204 L
29 1.84 1.83 380.9 0.47 0.50 9.1 71 18 4 11 51 38 8 0  CLA 801 A CLA 802 A CLA 803 A CLA 804 A CLA 810 A
CLA 829 A CLA 834 A CLA 835 A CLA 839 A CLA 842 A
BCR 852 A CLA 854 A CLA 802 B CLA 803 B CLA 810 B
CLA 833 B CLA 840 B BCR 848 B BCR 101 I BCR 3003
J BCR 201 L CLA 204 L CLA 801 a CLA 802 a CLA 803
a CLA 804 a CLA 834 a CLA 835 a CLA 841 a CLA 842
a CLA 843 a PQN 845 a CLA 856 a BCR 801 b CLA 802
b CLA 803 b CLA 809 b CLA 810 b CLA 840 b PQN 842
b BCR 848 b CLA 7002 f BCR 101 i BCR 201 l
30 1.37 3.21 415.8 0.55 0.59 10.5 71 22 3 9 54 40 8 0  CLA 302 3 CLA 303 3 CLA 315 3 XAT 317 3 CLA 608 7
CLA 806 A CLA 811 A CLA 813 A CLA 814 A CLA 815 A
CLA 819 A CLA 820 A CLA 821 A CLA 822 A CLA 825 A
CLA 827 A CLA 828 A CLA 830 A CLA 834 A CLA 835 A
CLA 836 A CLA 837 A CLA 838 A CLA 839 A CLA 840 A
BCR 848 A BCR 849 A BCR 850 A BCR 851 A CLA 203 L
CLA 204 L CLA 801 a CLA 802 a CLA 803 a CLA 804 a
CLA 834 a CLA 835 a CLA 841 a CLA 842 a CLA 843 a
PQN 845 a CLA 856 a BCR 801 b CLA 802 b CLA 803 b
CLA 809 b CLA 810 b CLA 839 b CLA 840 b PQN 842 b
BCR 848 b CLA 7002 f BCR 101 i BCR 201 l
31 2.67 2.67 30.3 -0.89 -0.28 7.2 72 0 1 1 2 3 1 0  CLA 305 6 CLA 306 6 CLA 307 6 CHL 308 6 CLA 310 6
XAT 318 6 BCR 319 6

Residue-type_colouring
Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine
H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C

Acknowledgement
Pores were calculated by MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.
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