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PDBsum entry 3cme

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Top Page protein dna_rna ligands metals Protein-protein interface(s) links
Ligand/metal interactions PDB id
3cme
Ligand highlighted
PHE-ACA
Ligands
__C-__A
C 55(5) to A 66(5)
PHE-ACA
PHE 77(6) to ACA 78(6)
Metals
_MG ×93
MG 801 (0)
MG 805 (A)
MG 802 (0)
MG 804 (A)
MG 808 (0)
MG 803 (B)
MG 801 (0)
MG 802 (C)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 809 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 805 (0)
MG 804 (K)
MG 807 (T)
MG 800 (2)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 805 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 805 (0)
MG 808 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 805 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 805 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 806 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 805 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 805 (0)
MG 806 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (0)
MG 805 (0)
MG 807 (0)
MG 808 (0)
MG 809 (0)
MG 800 (0)
MG 801 (0)
MG 802 (0)
MG 803 (0)
MG 804 (9)
MG 801 (A)
MG 802 (B)
MG 806 (Y)
_NA ×75
NA 858 (H)
NA 853 (C)
NA 850 (S)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 858 (0)
NA 859 (0)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 859 (0)
NA 850 (0)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 858 (0)
NA 859 (0)
NA 850 (0)
NA 851 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 858 (0)
NA 859 (0)
NA 850 (0)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 858 (0)
NA 859 (0)
NA 850 (0)
NA 851 (0)
NA 852 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 856 (0)
NA 857 (0)
NA 858 (0)
NA 859 (0)
NA 850 (0)
NA 851 (0)
NA 853 (0)
NA 854 (0)
NA 855 (0)
NA 853 (9)
NA 854 (9)
NA 852 (9)
NA 858 (J)
NA 859 (M)
NA 850 (Q)
NA 852 (R)
_SR ×108
SR 897 (H)
SR 891 (T)
SR 899 (T)
SR 902 (Y)
SR 893 (3)
SR 908 (0)
SR 903 (9)
SR 897 (A)
SR 897 (B)
SR 905 (F)
SR 892 (H)
SR 899 (L)
SR 892 (R)
SR 892 (1)
SR 899 (3)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 890 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 890 (0)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 891 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 890 (0)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 891 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 890 (0)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 890 (0)
SR 891 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 898 (0)
SR 899 (0)
SR 890 (0)
SR 891 (0)
SR 892 (0)
SR 893 (0)
SR 894 (0)
SR 895 (0)
SR 896 (0)
SR 897 (0)
SR 898 (0)
SR 900 (0)
SR 901 (0)
SR 904 (0)
SR 906 (0)
... plus 8 others
_CL ×22
CL 886 (J)
CL 881 (J)
CL 888 (M)
CL 887 (N)
CL 888 (O)
CL 881 (Q)
CL 880 (Y)
CL 883 (0)
CL 885 (0)
CL 882 (0)
CL 883 (0)
CL 885 (0)
CL 882 (0)
CL 889 (A)
CL 889 (B)
CL 881 (J)
CL 882 (J)
CL 880 (L)
CL 884 (L)
CL 886 (R)
CL 887 (Y)
CL 884 (3)
_CD ×5
CD 871 (U)
CD 873 (Z)
CD 875 (O)
CD 872 (1)
CD 874 (3)
__K ×2
K 8401(0)
K 8402(0)
  
Ligand PHE-ACA - 6-Aminohexanoic acid [Aminocaproic acid]
Formula: C6H13NO2
Validation of ligand annotation
Per Residue Validation
Atoms Missing Incorrect Chiral Centres
Residue Dic. Struc. Link Subs. Atoms Rings Planar High C Other
PHE 77(6) 12 12 1 1 Complete Chiral checks - OK
ACA 78(6) 9 9 1 1 Complete Chiral checks - OK
Advanced Analysis
Residue Name Mismatches Count
PHE 77(6) O: OXT 1
ACA 78(6) O1: O2 1
Additional Information

Jmol
 

LIGPLOT of interactions involving ligand


Jmol


 

PHE 77(6) to ACA 78(6)

  
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