spacer
spacer

PDBsum entry 3bfx

Go to PDB code: 
Top Page protein ligands Protein-protein interface(s) links
Protein chain A    -    representing identical chain: B PDB id
3bfx
Protein chain A highlighted
(click to view)
 
Motifs
Secondary structure
Wiring diagram
Residue conservation
ProMotif
2 sheets
2 beta alpha beta units
1 beta hairpin
6 strands
14 helices
20 helix-helix interacs
16 beta turns
2 gamma turns
Catalytic residues
H109-K49-S139
Variants
Arg206Trp
Val16Ala
Ile62Thr
Arg131Gln
Leu127Phe
Tyr128His
Arg282Thr
Arg87Gln
  
Chain & (253 residues)

PROMOTIF summary

PROMOTIF documentation
Secondary structure summary

 Strand   Alpha helix   3-10 helix   Other   Total residues 
 27 (10.7%)   120 (47.4%)   0 (0.0%)   106 (41.9%)   253 
2 beta sheets

 Sheet   No. 
 strands 
 Type   Barrel   Topology 
 A   2   Antiparallel   N   1 
 B   4   Parallel   N   1X -2X -1X 
2 beta-alpha-beta motifs

 Strand 1   Strand 2   No. of   No. of residues 
 Start   End   Length   Start   End   Length   helices   Loop   Helix 
 Leu 42   Thr 46     Ile 105   Thr 108       45   24 
 Lys 125   Ala 130     Gln 188   Phe 193       57   40 
1 beta hairpin

 Strand 1   Strand 2   Hairpin 
 Start   End   Length   Start   End   Length   class 
 Lys14   Val16   3   Thr19   Leu21   3   2:2 IP 
6 strands

 Start   End   Sheet   No.
resid 
 Lys14   Val16     
 Thr19   Leu21     
 Leu42   Thr46     
 Ile105   Thr108     
 Lys125   Ala130     
 Gln188   Phe193     
14 helices

 Start   End   Type   No.
resid 
 Pro23   Asp27     
 Trp29   Gln33     
 Thr52   Gln64     13 
 Gly93   Ala99     
 Ser118   Glu121     
 Ala133   Met146     14 
 Trp156   Ile164     
 Trp173   Met183     11 
 Tyr194   Arg199     
 Pro201   Phe211     11 
 Glu218   Glu227     10 
 Phe230   Glu235     
 Trp265   His268     
 Val271   Met285     15 
20 helix-helix interactions

   Helix   Interaction   No. interacting residues 
 Helices   types   type   Helix 1   Helix 2 
 A1   A2             
 A2   A4             
 A3   A9             
 A3   A10             
 A3   A11             
 A3   A12             
 A5   A8             
 A6   A7             
 A6   A8             
 A6   A13             
 A6   A14             
 A7   A8             
 A7   A13             
 A7   A14             
 A8   A14             
 A9   A10             
 A9   A12             
 A10   A11             
 A11   A12             
 A13   A14             
16 beta turns

     Turn   
 Turn   Sequence   type   H-bond 
 Glu15-Gly18    EVEG    IV    
 Val16-Thr19    VEGT    I'   Yes 
 Lys38-Asp41    KPDD    I   Yes 
 Tyr47-Ala50    YPKA    II   Yes 
 Lys49-Thr52    KAGT    IV    
 Phe82-Trp85    FIEW    I   Yes 
 Arg87-Gln90    RPPQ    VIa1   Yes 
 Pro88-Pro91    PPQP    IV    
 Pro101-Arg104    PSPR    IV    
 Ser111-Leu114    STQL    IV    
 Thr112-Leu115    TQLL    I    
 Asn147-Leu150    NHML    I   Yes 
 Val168-Gly171    VVWG    II   Yes 
 Met257-Gly260    MRKG    IV    
 Thr261-Asp264    TVGD    IV    
 Met285-Thr288    MEGT    II   Yes 
2 gamma turns

 Start   End   Sequence   Turn type 
 Gly166   Val168   GKV   INVERSE 
 Phe256   Arg258   FMR   INVERSE 
  
spacer
spacer