spacer
spacer

PDBsum entry 2gve

Go to PDB code: 
Top Page protein ligands metals clefts links
Cleft analysis for: 2gve PDB id
2gve
View options
Binding-site(s)
Binding-surface(s)
Coloured by
 cleft (as in table below)
 closest atom type
 residue type
 residue conservation
Clefts
R1
ratio
Accessible
vertices
Buried
vertices
Average
depth
Residue..type
Ligands
Volume
1 3782.11 0.98 70.47 2 17.11 1 16.67 1 12 11 9 8 7 10 0 DOD 1024[A], DOD 1047[A], DOD 
1049[A], DOD 1051[A], DOD 1091[A], D
OD 1094[A], DOD 1104[A], DOD 1106[
A], DOD 1108[A], DOD 1116[A], DOD 
1119[A], DOD 1121[A], DOD 1131[A], D
OD 1168[A], DOD 1170[A], DOD 1173[
A], DOD 1174[A], DOD 1200[A], DOD 
1204[A], DOD 1205[A], DOD 1206[A], D
OD 1208[A], DOD 1218[A], DOD 1236[
A], DOD 1240[A], DOD 1243[A], DOD 
1248[A] (95 atoms)
2 3842.44 0.00 60.59 6 12.69 3 13.41 2 7 6 8 14 7 8 0 DOD 1006[A], DOD 1007[A], DOD 
1008[A], DOD 1009[A], DOD 1038[A], D
OD 1062[A], DOD 1063[A], DOD 1080[
A], DOD 1098[A], DOD 1114[A], DOD 
1115[A], DOD 1140[A], DOD 1141[A], D
OD 1142[A], DOD 1145[A], DOD 1212[
A], DOD 1214[A], DOD 1223[A], DOD 
1229[A], DOD 1233[A], DOD 1257[A], D
OD 1267[A], DOD 1306[A], DOD 1321[
A], DOD 1325[A], DOD 1348[A], DOD 
3191[A] (71 atoms)
3 1906.88 0.00 59.49 9 10.41 5 8.94 5 3 6 3 10 3 1 0 DOD 1001[A], DOD 1136[A], DOD 
1201[A], DOD 1241[A], DOD 1312[A], D
OD 2018[A], DOD 2021[A], DOD 3001[
A] (17 atoms)
4 1630.12 0.00 59.90 8 8.82 6 9.00 4 6 5 3 10 1 5 0 DOD 1020[A], DOD 1025[A], DOD 
1057[A], DOD 1065[A], DOD 1066[A], D
OD 1068[A], DOD 1069[A], DOD 1070[
A], DOD 1079[A], DOD 1222[A], DOD 
1237[A], DOD 1250[A], DOD 1293[A], D
OD 1328[A], DOD 1334[A], DOD 1374[
A], DOD 1376[A], DOD 1377[A] (44 
atoms)
5 1007.44 0.00 66.62 4 10.42 4 7.37 8 7 3 2 5 2 0 0 DOD 1010[A], DOD 1034[A], DOD 
1048[A], DOD 1184[A], DOD 1185[A], D
OD 1313[A] (12 atoms)
6 640.83 0.00 72.54 1 14.68 2 9.17 3 4 3 2 1 2 1 0 DOD 1014[A], DOD 1133[A], DOD 
1166[A], DOD 1249[A], DOD 1262[A], D
OD 1274[A], DOD 1332[A], DOD 1383[
A], DOD 3032[A] (21 atoms)
7 464.48 0.00 58.73 10 6.26 8 8.77 6 2 1 1 3 1 1 0 DOD 1011[A], DOD 1084[A], DOD 
1085[A] (9 atoms)
8 513.00 0.00 67.07 3 6.03 9 8.18 7 3 0 1 7 1 1 0 DOD 3070[A](1 atom)
9 363.66 0.00 60.34 7 5.23 10 6.26 9 2 3 1 3 1 1 0 DOD 1233[A], DOD 1333[A], DOD 
2032[A] (9 atoms)
10 372.09 0.00 61.70 5 7.68 7 6.10 10 4 3 0 2 0 0 0 DOD 1165[A], DOD 1375[A], DOD 
3039[A], DOD 3041[A] (10 atoms)
 Protein structure

Residue-type_colouring
Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine
H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C
spacer
spacer