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Index of approved drugs and nutraceuticals in the PDB

Generic names

The index below lists the generic names of all approved drugs and nutraceuticals found in structures of the PDB. There are 488 molecules in all (432 drugs and 56 nutraceuticals), contained within 21877 PDB structures.

Drug data taken from DrugBank which currently contains 1682 approved drugs and nutraceuticals.

Types: drug; nutraceutical.
Counts: t = number of different targets for the drug; T = number of those targets with known structure (in PDB); TD = number of those target structures that also have the corresponding drug bound; D = total number of structures containing this drug.

A

  t T TD D
abacavir 1  -  -  3
abiraterone 1  1  -  -
acepromazine 6  2  -  1
acetaminophen 2  1  -  9
acetazolamide 7  7  15  25
acetic acid -  -  -  3003
acetohydroxamic acid 2  2  11  20
acetylcysteine 1  -  -  3
acetylsalicylic acid 3  2  -  8
acyclovir 3  1  2  5
adenine 12  11  10  96
adenosine 4  2  1  120
adenosine monophosphate 16  10  -    -
adenosine triphosphate 33  14  8  862
afatinib 3  3  1  1
ajmaline 1  1  -  4
alendronate 6  4  2  4
aliskiren 1  1  1  1
alitretinoin 6  6  1  3
alogliptin 1  1  1  1
alpha-linolenic acid 5  -  -  3
alprazolam 20  1  -  1
alprenolol 3  2  -  1
alprostadil 2  -  -  1
aluminium 2  1  -  4
amantadine 3  1  -  4
amikacin 2  1  -  2
amiloride 9  4  1  2
aminocaproic acid 3  3  5  16
aminosalicylic acid 5  3  -  3
amitriptyline 21  10  -  1
amlexanox 4  4  1  1
amlodipine 9  4  -  2
amodiaquine 2  1  1  3
amoxicillin 1  -  -  3
amphetamine 4  1  -  -
ampicillin 5  3  -  9
amprenavir 1  -  -  18
amsacrine 3  2  -  1
apixaban 1  1  2  1
argatroban 1  1  3  1
aspartame 2  -  -  2
atazanavir 1  -  -  11
atenolol 1  1  -  3
atorvastatin 3  2  2  1
atovaquone 3  2  -  1
atropine 5  2  -  5
axitinib 3  3  2  2
azacitidine 3  1  -  1
azelaic acid 5  2  -  1
azithromycin 3  1  -  5
aztreonam 2  1  -  4
 

B

  t T TD D
baclofen 2  2  1  1
balsalazide 4  3  -  1
benzyl alcohol -  -  -  1
benzyl benzoate -  -  -  2
bepridil 9  6  1  2
bexarotene 3  3  2  2
bezafibrate 3  3  -  1
bicalutamide 1  1  8  20
bifonazole 2  1  -  1
bimatoprost 4  1  1  1
biotin 9  5  -  84
boceprevir 1  -  -  1
bortezomib 5  -  -  3
bosutinib 10  10  5  7
brinzolamide 4  3  2  3
bromfenac 2  1  -  1
bromocriptine 18  7  -  1
 

C

  t T TD D
caffeine 4  2  1  10
calcidiol 1  1  -  2
calcipotriol 1  1  1  1
calcitriol 1  1  1  1
carbenicillin 1  -  -  1
carbidopa 1  1  -  -
carboplatin 1  -  -  14
carprofen 2  1  -  2
carvedilol 9  7  -  1
cefalotin 8  5  1  3
cefamandole 1  -  -  1
cefixime 1  -  -  1
cefmetazole 6  3  -  1
cefotaxime 5  3  -  3
cefoxitin 12  7  1  4
cefuroxime 1  -  -  2
celecoxib 2  2  -  4
cerulenin 4  4  -  1
chenodeoxycholic acid 1  1  -  1
chlorambucil 1  -  -  2
chloramphenicol 3  3  3  19
chloropyramine 1  1  -  1
chloroquine 4  2  -  2
chlorpromazine 7  3  -  3
chlorthalidone 1  -  -  1
chlorzoxazone 1  1  -  2
cholecalciferol 1  1  -  5
choline 7  2  1  28
cidofovir 1  1  -  1
cilastatin 1  1  1  1
ciprofloxacin 3  1  -  5
cisplatin 1  -  -  54
cladribine 10  6  -  2
clarithromycin 1  -  -  2
clavulanate 1  1  -  4
clindamycin 2  -  -  4
clofarabine 3  2  -  1
clomipramine 7  3  3  3
clonidine 3  2  -  1
clopidogrel 1  1  -  2
clotrimazole 2  -  -  2
cloxacillin 6  2  -    -
cocaine 8  2  -  3
colchicine 2  -  -  4
creatine 6  5  -  3
cyanocobalamin 6  5  -  11
cycloserine 2  -  -  2
cyclothiazide 4  4  -  3
cysteamine 3  1  -  3
cytarabine 2  1  -  2
 

D

  t T TD D
dalfampridine 16  3  -  2
dalfopristin 1  1  1  7
darunavir 1  -  -  49
dasatinib 10  9  1  10
daunorubicin 3  2  -  16
decamethonium 2  1  -  4
delavirdine 1  -  -  1
desflurane 7  2  -  1
desipramine 14  7  2  2
dexamethasone 4  3  2  6
dextroamphetamine 6  -  -  1
diazepam 18  1  -  1
diazoxide 6  3  -  1
dichlorphenamide 4  4  1  1
diclofenac 8  3  -  11
didanosine 2  1  1  1
diethylstilbestrol 3  3  2  5
diflunisal 2  1  -  3
digoxin 1  -  -  2
dihydroergotamine 4  3  -  1
dimethyl sulfoxide -  -  -  809
dinoprostone 4  -  -  1
diphenhydramine 1  1  -  1
disopyramide 6  4  -  1
dobutamine 2  2  -  2
docetaxel 5  2  -  2
donepezil 2  1  1  8
dopamine 7  3  -  6
dorzolamide 3  3  5  5
doxepin 20  7  -  1
doxorubicin 2  1  -  7
doxycycline 3  2  -  2
dronabinol 2  2  -  1
duloxetine 3  -  -  2
dyphylline 8  7  -  1
 

E

  t T TD D
econazole 1  -  -  1
edetic acid 3  -  -  9
edrophonium 2  2  -  3
efavirenz 1  -  -  6
emtricitabine 1  -  -  1
epinephrine 8  5  -  3
epirubicin 3  2  -  4
ergocalciferol 1  1  -  1
ergotamine 10  4  -  3
erlotinib 2  2  2  3
ertapenem 8  3  -  3
erythromycin 3  1  -  11
estradiol 3  3  14  29
estriol 2  2  1  2
estrone 1  1  1  1
ethacrynic acid 2  -  -  8
ethanol 7  4  -  189
ethoxzolamide 4  4  4  4
etidronic acid 3  1  -  1
etoposide 2  2  1  2
etoricoxib 1  1  -  1
exemestane 1  1  1  1
 

F

  t T TD D
felodipine 13  7  -  1
fenoprofen 2  1  -  2
finasteride 3  1  -  1
fluconazole 1  -  -  1
flucytosine 3  1  -  2
fludrocortisone 3  3  1  1
fluorescein 2  -  -  10
fluorouracil 3  1  -  10
fluoxetine 1  -  -  2
flurazepam 19  1  -  2
flurbiprofen 2  1  -  10
fluticasone furoate 1  1  1  1
fluvastatin 1  1  2  1
fluvoxamine 1  -  -  1
folic acid 2  1  1  55
fomepizole 4  4  -  -
foscarnet 2  1  -  6
fosfomycin 1  1  -  12
fulvestrant 1  1  -  1
furazolidone 1  -  -  1
furosemide 2  1  1  3
fusidic acid 3  2  1  16
 

G

  t T TD D
gabapentin 4  1  -  4
galantamine 18  9  1  6
gamma-homolinolenic acid 2  1  -  1
ganciclovir 3  1  1  2
gefitinib 1  1  5  5
gemcitabine 4  3  -  4
gentian violet 1  -  -  2
glutathione 40  32  80  266
glycine 34  8  3  107
granisetron 1  -  -  1
guanidine 8  7  22  52
 

H

  t T TD D
hexachlorophene 3  2  -  1
homoharringtonine 2  2  -  1
hydralazine 2  2  -  1
hydrochlorothiazide 7  6  -  2
hydrocortisone 2  2  1  8
hydroflumethiazide 8  6  -  1
hydroxocobalamin 9  8  -  2
hydroxyurea 1  1  -  2
 

I

  t T TD D
ibandronate 2  1  1  1
ibudilast 5  5  -  1
ibuprofen 8  7  -  10
icosapent 10  4  1  3
idarubicin 2  1  -  5
idoxuridine 2  -  -  1
imatinib 9  6  4  16
imipenem 5  2  -  16
imipramine 14  5  1  1
indapamide 2  2  -  1
indinavir 1  -  -  14
indomethacin 7  5  4  26
iodipamide -  -  -  1
irinotecan 2  1  -  1
isoflurane 7  3  -  2
isoniazid 2  1  -  8
itraconazole 2  1  -  -
ivermectin 2  1  -  5
 

J

  t T TD D
josamycin 1  -  -  1
 

K

  t T TD D
kanamycin 2  1  -  21
ketoconazole 1  -  -  1
ketorolac 2  1  -  1
 

L

  t T TD D
l-alanine 13  3  -  35
l-aspartic acid 24  14  1  1
l-carnitine 11  5  1  16
l-citrulline 13  6  3  12
l-cysteine 14  6  1  67
l-glutamic acid 70  27  -  2
l-histidine 4  2  -  3
l-isoleucine 6  3  -  -
l-lysine 5  1  -  10
l-ornithine 14  5  -  1
l-phenylalanine 7  6  -  18
l-proline 22  9  -  1
l-serine 7  5  -  18
l-threonine 3  1  -  -
l-tryptophan 3  2  8  94
l-tyrosine 4  4  -  39
l-valine 3  1  -  1
lacosamide 3  -  -  1
lactulose 1  -  -  1
lamivudine 3  -  -  1
lapatinib 2  2  1  2
levodopa 5  3  -  4
levofloxacin 3  1  -  3
levonorgestrel 4  3  1  2
levothyroxine 2  2  2  19
lidocaine 4  2  -  2
linagliptin 1  1  1  1
lincomycin 1  -  -  1
linezolid 1  -  -  3
liothyronine 2  2  -  -
lipoic acid 3  -  -  4
lisinopril 2  2  2  4
lithium 4  3  -  52
lopinavir 1  -  -  10
lovastatin 3  3  1  1
lumiracoxib 2  1  -  4
 

M

  t T TD D
maraviroc 1  1  -  1
marimastat 23  12  -  3
masoprocol 1  1  -  1
meclofenamic acid 5  2  -  2
mefenamic acid 2  1  -  4
melatonin 10  6  3  3
meloxicam 2  1  -  2
memantine 5  1  -  1
menadione 13  9  -  1
mercaptopurine 1  1  -  2
meropenem 1  1  -  1
methamphetamine 11  4  -  2
methimazole 1  -  -  1
methotrexate 1  1  -  2
methoxsalen 1  -  -  1
meticillin 6  3  -  1
metocurine 2  1  -  1
metronidazole 3  2  -  1
metyrapone 2  1  -  -
mexiletine 2  1  -  2
midazolam 19  1  -  1
mifepristone 2  2  4  5
miglitol 4  1  1  1
miglustat 1  -  -  1
milrinone 1  1  -  1
minocycline 10  9  -  11
minoxidil 2  -  -  1
mitoxantrone 2  1  -  4
montelukast 2  1  -  1
morphine 3  2  -  1
moxifloxacin 3  1  -  2
mupirocin 1  1  3  4
mycophenolic acid 2  2  -  7
 

N

  t T TD D
n-acetyl-d-glucosamine 8  2  13  3104
nabumetone 2  1  -  1
nadh 144  64  16  157
nafcillin 5  3  -  1
nalidixic acid 1  -  -  1
naproxen 2  1  -  8
nelfinavir 1  -  -  10
neomycin 2  1  -  24
nevirapine 1  -  -  21
niacin 4  2  -  25
nicotine 11  6  -  6
niflumic acid 6  4  -  2
nilotinib 2  2  2  2
nitazoxanide 1  1  -  1
nitric oxide 1  -  -  -
nitrofurazone 4  3  -  2
nitroglycerin 1  -  -  1
nitroxoline 3  1  -  1
norepinephrine 10  6  1  4
norethindrone 1  1  1  2
nortriptyline 12  3  -  1
novobiocin 1  1  1  6
 

O

  t T TD D
ofloxacin 3  1  -  2
omeprazole 1  -  -  3
ouabain 1  -  -  4
oxacillin 6  3  -  1
oxaliplatin 1  -  -  4
oxamniquine 1  -  -  1
oxytetracycline 3  2  -  1
 

P

  t T TD D
paclitaxel 6  3  -  21
pamidronate 2  1  2  3
papaverine 2  2  1  2
paromomycin 2  1  -  74
paroxetine 8  2  -  4
pemetrexed 4  4  2  7
penciclovir 2  -  -  1
penicillamine 1  -  -  -
penicillin g 1  -  -  5
penicillin v 4  2  2  2
pentamidine 2  1  -  7
pentobarbital 10  4  -  1
pentostatin 1  1  -  2
pentoxifylline 6  5  1  4
phenylbutazone 3  2  -  4
phosphatidylserine 10  2  -  3
phytonadione 2  -  -  14
picrotoxin 4  -  -  1
pilocarpine 3  2  -  -
pioglitazone 1  1  1  2
piperacillin 4  2  -  1
piperazine 1  1  -  1
podofilox 3  1  -  1
polidocanol -  -  -  2
ponatinib 15  14  2  6
posaconazole 1  -  -  -
praziquantel 1  -  -  1
prazosin 6  1  -  1
prednisone 2  2  -  8
primaquine 3  1  1  1
prochlorperazine 1  1  -  1
proflavine 4  3  3  8
progesterone 4  4  4  19
promazine 14  5  -  1
propofol 4  2  -  3
propylthiouracil 1  -  -  1
pyrazinamide 1  -  -  4
pyridoxal 1  1  1  7
pyridoxine 1  1  -  2
pyrimethamine 2  2  2  9
pyruvic acid 14  4  3  132
 

Q

  t T TD D
quinacrine 4  1  -  1
 

R

  t T TD D
rabeprazole 1  -  -  1
raloxifene 2  2  4  5
raltitrexed 2  1  2  10
rasagiline 2  2  1  -
remikiren 1  1  1  1
retapamulin 1  -  -  1
ribavirin 7  4  -  2
riboflavin 3  3  4  25
rifabutin 5  5  -  2
rifampin 3  3  2  7
rifapentine 1  -  -  1
rimantadine 1  -  -  2
risedronate 2  1  5  8
ritonavir 1  -  -  12
rivaroxaban 1  1  2  1
roflumilast 4  4  3  3
rosiglitazone 2  1  8  7
rosuvastatin 1  1  2  1
roxithromycin 2  -  -  1
ruxolitinib 2  2  -  1
 

S

  t T TD D
s-adenosylmethionine 6  6  13  272
salbutamol 2  2  -  1
salicyclic acid 3  2  -  39
salicylamide -  -  -  1
saquinavir 1  -  -  25
saxagliptin 1  1  1  2
sertraline 2  -  -  3
sildenafil 3  2  4  5
sitagliptin 1  1  1  2
sorafenib 10  10  3  6
spectinomycin 1  1  -  5
spermine 4  2  2  105
spironolactone 2  2  3  3
streptomycin 2  1  -  18
streptozocin 3  1  1  1
succinic acid 26  5  1  119
succinylcholine 5  2  -  2
sulfamethoxazole 2  2  -  1
sulfanilamide 1  1  1  4
sulfapyridine 1  -  -    -
sulfasalazine 8  6  -  2
sulfathiazole 1  -  -  1
sulindac 6  4  2  8
sunitinib 8  7  3  7
suramin 7  6  7  12
 

T

  t T TD D
tacrine 2  2  1  5
tacrolimus 1  1  4  18
tadalafil 2  1  2  2
tamibarotene 2  2  -  1
tamoxifen 2  2  -  1
tazobactam 2  -  -  2
telaprevir 1  -  -  4
telbivudine 2  -  -  2
telithromycin 1  -  -  5
telmisartan 2  2  1  1
teniposide 1  1  -  1
tenofovir 1  -  -  -
testosterone 1  1  11  22
tetracycline 7  6  -  11
thalidomide 6  5  -  2
theobromine 3  2  -  1
theophylline 8  6  -  6
thiabendazole 1  1  -  2
thiamine 2  1  1  12
thioguanine 1  -  -  4
thiopental 11  4  -  1
thioridazine 6  3  -  1
ticlopidine 1  1  -  1
tigecycline 6  5  -  5
timolol 3  3  1  1
tiotropium 3  2  -  1
tipranavir 1  -  -  7
tirofiban 2  2  4  2
tobramycin 2  1  -  8
tolcapone 1  1  -  2
tolmetin 2  1  -  1
topiramate 5  3  1  2
topotecan 3  1  1  1
trabectedin 1  -  -  4
tranexamic acid 1  1  2  2
tranylcypromine 2  2  -  -
tretinoin 8  3  2  31
triamterene 4  1  -  2
trifluoperazine 6  4  5  7
trimethoprim 2  2  3  18
trimetrexate 1  1  -  4
troleandomycin 2  2  -  2
 

U

  t T TD D
ursodeoxycholic acid 1  1  1  4
 

V

  t T TD D
valaciclovir 2  -  -  1
valproic acid 5  2  -  -
vancomycin 2  1  -  2
vandetanib 4  4  -  1
vardenafil 3  2  3  4
varenicline 4  3  -  2
vidarabine 4  1  -  2
vildagliptin 1  1  1  1
vinblastine 6  2  -  2
vitamin a 16  2  -  22
vitamin c 26  9  2  23
vitamin e 10  9  -  4
voriconazole 1  -  -  -
vorinostat 6  6  5  9
 

W

  t T TD D
warfarin 1  -  -  2
 

X

  t T TD D
xanthophyll -  -  -  4
 

Z

  t T TD D
zanamivir 3  2  2  19
zidovudine 2  1  -  5
zinc -  -  -  9899
zoledronate 3  2  10  16
zonisamide 31  17  1  1
 
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