PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=175-68-3C1)

Interfaces in PDB 5lmv

STRUCTURE OF BACTERIAL 30S-IF1-IF2-IF3-MRNA-TRNA TRANSLATION PRE- INITIATION COMPLEX(STATE-III)

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		L	`346`	`84`	`9402`	`◊`	A	`429`	`86`	`205667`	`3529.6`	`-63.0`	`0.820`	`60`	`0`	`0`	`0.000`
`2`		D	`347`	`80`	`12274`	`◊`	A	`414`	`69`	`205667`	`3366.3`	`-58.6`	`0.654`	`66`	`0`	`0`	`0.000`
`3`		I	`294`	`60`	`8311`	`◊`	A	`369`	`68`	`205667`	`3129.0`	`-61.5`	`0.625`	`65`	`0`	`0`	`0.000`
`4`		T	`282`	`63`	`7051`	`◊`	A	`346`	`69`	`205667`	`2882.1`	`-61.2`	`0.592`	`47`	`0`	`0`	`0.000`
`5`		Q	`272`	`56`	`7407`	`◊`	A	`352`	`60`	`205667`	`2803.2`	`-48.2`	`0.749`	`40`	`0`	`0`	`0.000`
`6`		P	`258`	`56`	`5741`	`◊`	A	`310`	`59`	`205667`	`2662.2`	`-50.5`	`0.479`	`42`	`0`	`0`	`0.000`
`7`		E	`216`	`57`	`8652`	`◊`	A	`265`	`48`	`205667`	`2191.1`	`-39.9`	`0.620`	`38`	`0`	`0`	`0.000`
`8`		G	`203`	`52`	`10159`	`◊`	A	`273`	`45`	`205667`	`2164.6`	`-28.3`	`0.896`	`40`	`0`	`0`	`0.000`
`9`		M	`215`	`50`	`8607`	`◊`	A	`248`	`43`	`205667`	`2149.9`	`-50.9`	`0.354`	`51`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		J	`197`	`45`	`7295`	`◊`	A	`278`	`50`	`205667`	`2067.8`	`-29.4`	`0.914`	`35`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		K	`200`	`48`	`7253`	`◊`	A	`245`	`44`	`205667`	`2040.0`	`-40.7`	`0.619`	`31`	`0`	`0`	`0.000`
`12`		N	`182`	`39`	`5609`	`◊`	A	`260`	`47`	`205667`	`1996.3`	`-34.5`	`0.841`	`41`	`0`	`0`	`0.000`
`13`		H	`206`	`56`	`8218`	`◊`	A	`242`	`45`	`205667`	`1972.0`	`-34.4`	`0.388`	`34`	`0`	`0`	`0.000`
`14`		O	`199`	`43`	`6578`	`◊`	A	`220`	`40`	`205667`	`1938.2`	`-41.8`	`0.417`	`23`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		C	`182`	`46`	`11685`	`◊`	A	`219`	`38`	`205667`	`1799.1`	`-32.9`	`0.521`	`20`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		S	`163`	`31`	`5905`	`◊`	A	`227`	`39`	`205667`	`1659.0`	`-22.1`	`0.926`	`31`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		V	`128`	`23`	`2388`	`◊`	A	`156`	`37`	`205667`	`1374.2`	`-30.0`	`0.343`	`26`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		B	`132`	`35`	`12175`	`◊`	A	`152`	`29`	`205667`	`1293.0`	`-21.2`	`0.749`	`20`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		R	`110`	`29`	`5614`	`◊`	A	`139`	`26`	`205667`	`1244.7`	`-28.0`	`0.395`	`23`	`0`	`0`	`0.000`
`20`		F	`113`	`26`	`7010`	`◊`	R	`119`	`29`	`5614`	`1124.9`	`-7.9`	`0.082`	`17`	`2`	`0`	`0.000`
`21`		A	`142`	`29`	`205667`	`◊`	Y	`124`	`18`	`4987`	`1059.3`	`-16.8`	`0.941`	`29`	`0`	`0`	`0.000`
`22`		C	`106`	`28`	`11685`	`◊`	N	`89`	`20`	`5609`	`932.6`	`-9.2`	`0.131`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
`23`		a	`92`	`30`	`28567`	`◊`	A	`112`	`22`	`205667`	`892.8`	`-11.2`	`0.867`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
`24`		W	`91`	`27`	`4830`	`◊`	A	`122`	`18`	`205667`	`886.0`	`-7.6`	`0.834`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
`25`		J	`95`	`18`	`7295`	`◊`	N	`84`	`19`	`5609`	`795.4`	`-9.7`	`0.173`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
`26`		X	`85`	`24`	`10569`	`◊`	A	`92`	`21`	`205667`	`781.4`	`-18.6`	`0.477`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
`27`		a	`71`	`22`	`28567`	`◊`	Z	`73`	`7`	`13117`	`657.3`	`-5.4`	`0.245`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`28`		E	`66`	`16`	`8652`	`◊`	H	`73`	`22`	`8218`	`655.7`	`-1.5`	`0.393`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
`29`		A	`91`	`14`	`205667`	`◊`	Z	`75`	`12`	`13117`	`621.9`	`-10.9`	`0.884`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
`30`		F	`71`	`21`	`7010`	`◊`	A	`71`	`14`	`205667`	`618.3`	`-9.7`	`0.667`	`19`	`0`	`0`	`0.000`
`31`		L	`55`	`15`	`9402`	`◊`	W	`59`	`16`	`4830`	`528.3`	`-2.4`	`0.398`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
`32`		M	`43`	`12`	`8607`	`◊`	S	`59`	`17`	`5905`	`476.2`	`-2.0`	`0.512`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`33`		C	`54`	`17`	`11685`	`◊`	J	`63`	`17`	`7295`	`440.6`	`-3.9`	`0.318`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`34`		D	`44`	`14`	`12274`	`◊`	E	`51`	`15`	`8652`	`430.9`	`0.8`	`0.552`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
`35`		X	`40`	`19`	`10569`	`◊`	Z	`55`	`12`	`13117`	`399.4`	`-3.0`	`0.827`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		L	`38`	`12`	`9402`	`◊`	a	`34`	`11`	`28567`	`397.3`	`-3.1`	`0.183`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
`37`		Z	`56`	`9`	`13117`	`c`	[G7M]Z:46	`24`	`1`	`532`	`379.2`	`1.4`	`0.844`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`38`		K	`39`	`12`	`7253`	`◊`	R	`40`	`11`	`5614`	`365.9`	`-1.9`	`0.399`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
`39`		G	`32`	`8`	`10159`	`◊`	I	`33`	`12`	`8311`	`356.1`	`-2.0`	`0.304`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`40`		Z	`42`	`10`	`13117`	`c`	[4SU]Z:8	`20`	`1`	`447`	`310.2`	`-1.1`	`0.843`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`41`		B	`36`	`10`	`12175`	`◊`	H	`33`	`10`	`8218`	`304.9`	`-1.3`	`0.429`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
`42`		Z	`38`	`6`	`13117`	`c`	[OMC]Z:32	`20`	`1`	`470`	`281.0`	`2.8`	`0.878`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`43`		G	`34`	`10`	`10159`	`◊`	K	`30`	`8`	`7253`	`270.8`	`-1.1`	`0.422`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`44`		G	`21`	`6`	`10159`	`◊`	Y	`33`	`5`	`4987`	`217.6`	`-1.0`	`0.536`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`45`		L	`22`	`6`	`9402`	`◊`	Q	`22`	`5`	`7407`	`201.4`	`-3.6`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`46`		Z	`27`	`4`	`13117`	`c`	[5MU]Z:54	`18`	`1`	`446`	`197.6`	`-1.0`	`0.794`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`47`		Y	`24`	`5`	`4987`	`◊`	Z	`22`	`5`	`13117`	`186.2`	`2.2`	`0.923`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
`48`		I	`20`	`7`	`8311`	`◊`	J	`29`	`8`	`7295`	`184.4`	`-1.6`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`49`		I	`14`	`3`	`8311`	`◊`	Z	`22`	`4`	`13117`	`179.5`	`-4.9`	`0.433`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`50`		Z	`22`	`5`	`13117`	`c`	[PSU]Z:55	`19`	`1`	`439`	`177.2`	`-4.0`	`0.608`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`51`		C	`16`	`7`	`11685`	`◊`	E	`17`	`6`	`8652`	`167.7`	`1.7`	`0.632`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
`52`		K	`23`	`6`	`7253`	`◊`	Y	`20`	`4`	`4987`	`166.6`	`-4.6`	`0.397`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`53`		W	`15`	`5`	`4830`	`◊`	a	`14`	`6`	`28567`	`128.9`	`-2.8`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`54`		[5MU]Z:54	`15`	`1`	`446`	`c`	[PSU]Z:55	`12`	`1`	`439`	`119.5`	`0.7`	`0.729`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`55`		W	`15`	`2`	`4830`	`◊`	Y	`12`	`1`	`4987`	`107.9`	`-2.2`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`56`		M	`12`	`4`	`8607`	`◊`	Z	`11`	`2`	`13117`	`107.6`	`-3.1`	`0.318`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`57`		H	`14`	`5`	`8218`	`◊`	Q	`12`	`4`	`7407`	`97.0`	`-0.3`	`0.500`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`58`		R	`7`	`2`	`5614`	`◊`	Y	`13`	`4`	`4987`	`88.1`	`-1.3`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`59`		I	`10`	`3`	`8311`	`◊`	[OMC]Z:32	`9`	`1`	`470`	`86.4`	`-1.8`	`0.387`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`60`		I	`7`	`2`	`8311`	`◊`	N	`14`	`3`	`5609`	`78.5`	`1.2`	`0.706`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`61`		H	`12`	`4`	`8218`	`◊`	L	`6`	`2`	`9402`	`68.7`	`-1.4`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`62`		A	`8`	`2`	`205667`	`◊`	[OMC]Z:32	`6`	`1`	`470`	`62.8`	`-0.8`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`63`		B	`4`	`1`	`12175`	`◊`	C	`7`	`3`	`11685`	`59.6`	`1.0`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`64`		[4SU]Z:8	`6`	`1`	`447`	`◊`	[G7M]Z:46	`7`	`1`	`532`	`57.5`	`-1.4`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`65`		W	`11`	`6`	`4830`	`◊`	[MG]W:101	`1`	`1`	`98`	`56.6`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`66`		Z	`9`	`4`	`13117`	`◊`	[MG]Z:102	`1`	`1`	`98`	`54.6`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`67`		M	`6`	`2`	`8607`	`◊`	V	`6`	`3`	`2388`	`48.6`	`0.3`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`68`		O	`5`	`2`	`6578`	`◊`	Q	`5`	`2`	`7407`	`35.2`	`0.2`	`0.651`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`69`		F	`2`	`2`	`7010`	`◊`	O	`3`	`1`	`6578`	`29.5`	`0.2`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`70`		A	`2`	`2`	`205667`	`◊`	[MG]W:101	`1`	`1`	`98`	`17.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`71`		C	`4`	`2`	`11685`	`◊`	D	`1`	`1`	`12274`	`17.1`	`0.7`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`72`		B	`2`	`1`	`12175`	`◊`	E	`2`	`1`	`8652`	`14.4`	`0.1`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`73`		A	`3`	`1`	`205667`	`◊`	[ZN]N:101	`1`	`1`	`98`	`10.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`74`		[MG]Z:102	`1`	`1`	`98`	`◊`	[OMC]Z:32	`1`	`1`	`470`	`9.8`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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