PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=655-6M-M6N)

Interfaces in PDB 5cpk crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.63 Å

NUCLEOSOME CONTAINING METHYLATED SAT2L DNA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`693`	`139`	`32075`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`665`	`139`	`32451`	`6297.2`	`-69.5`	`0.990`	`280`	`0`	`0`	`1.000`
2	`2`		F	`234`	`56`	`7204`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`254`	`57`	`8553`	`2550.4`	`-42.7`	`0.048`	`22`	`2`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`225`	`53`	`6394`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`243`	`57`	`8684`	`2383.5`	`-42.9`	`0.028`	`18`	`4`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2466.9`	`-42.8`	`0.038`	`20`	`3`	`0`	`1.000`
3	`4`		D	`248`	`61`	`7734`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`242`	`60`	`8724`	`2436.8`	`-42.9`	`0.034`	`22`	`7`	`0`	`1.000`
	`5`		H	`241`	`61`	`7441`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`238`	`61`	`8311`	`2424.4`	`-42.1`	`0.053`	`26`	`6`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2430.6`	`-42.5`	`0.043`	`24`	`7`	`0`	`1.000`
4	`6`		J	`91`	`18`	`32075`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`79`	`21`	`8553`	`718.7`	`-9.5`	`0.716`	`13`	`0`	`0`	`0.670`
5	`7`		I	`87`	`16`	`32451`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`77`	`22`	`8684`	`715.1`	`-10.3`	`0.600`	`13`	`0`	`0`	`0.673`
6	`8`		I	`84`	`16`	`32451`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`75`	`21`	`8553`	`670.6`	`-6.1`	`0.751`	`15`	`0`	`0`	`0.535`
7	`9`		G	`64`	`17`	`8311`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`65`	`21`	`8684`	`670.4`	`-7.6`	`0.322`	`6`	`0`	`0`	`0.142`
	`10`		C	`60`	`16`	`8724`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`59`	`19`	`8553`	`644.2`	`-8.5`	`0.275`	`6`	`0`	`0`	`0.142`
	*Average:*													`657.3`	`-8.1`	`0.299`	`6`	`0`	`0`	`0.142`
8	`11`		J	`78`	`14`	`32075`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`68`	`20`	`8684`	`646.3`	`-8.5`	`0.672`	`12`	`0`	`0`	`0.606`
9	`12`		E	`58`	`14`	`8553`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`56`	`15`	`8684`	`620.2`	`-10.8`	`0.195`	`2`	`5`	`0`	`1.000`
10	`13`		H	`55`	`12`	`7441`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`54`	`12`	`7204`	`511.3`	`-1.4`	`0.701`	`6`	`2`	`0`	`0.035`
	`14`		D	`51`	`12`	`7734`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`10`	`6394`	`476.1`	`-3.1`	`0.615`	`3`	`1`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`493.7`	`-2.2`	`0.658`	`5`	`2`	`0`	`0.035`
11	`15`		J	`61`	`11`	`32075`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`46`	`17`	`8724`	`464.7`	`-5.2`	`0.699`	`9`	`0`	`0`	`0.063`
12	`16`		I	`58`	`10`	`32451`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`50`	`17`	`8311`	`427.8`	`-3.8`	`0.721`	`6`	`0`	`0`	`0.047`
13	`17`		I	`54`	`13`	`32451`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`46`	`13`	`8724`	`416.0`	`-5.5`	`0.625`	`6`	`0`	`0`	`0.104`
14	`18`		I	`50`	`13`	`32451`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`7734`	`415.5`	`-5.8`	`0.562`	`11`	`0`	`0`	`0.136`
15	`19`		G	`42`	`14`	`8311`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`49`	`12`	`6394`	`398.2`	`-3.8`	`0.387`	`5`	`0`	`0`	`0.055`
	`20`		C	`46`	`15`	`8724`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`46`	`11`	`7204`	`386.4`	`-4.7`	`0.356`	`5`	`0`	`0`	`0.055`
	*Average:*													`392.3`	`-4.3`	`0.372`	`5`	`0`	`0`	`0.055`
16	`21`		J	`53`	`10`	`32075`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`44`	`12`	`8311`	`349.3`	`-4.5`	`0.695`	`6`	`0`	`0`	`0.091`
17	`22`		I	`43`	`8`	`32451`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`44`	`15`	`7204`	`344.3`	`-7.2`	`0.487`	`6`	`0`	`0`	`0.065`
18	`23`		J	`38`	`8`	`32075`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`14`	`6394`	`304.1`	`-6.9`	`0.479`	`7`	`0`	`0`	`0.067`
19	`24`		J	`37`	`10`	`32075`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`31`	`12`	`7441`	`293.5`	`-8.5`	`0.378`	`7`	`0`	`0`	`0.148`
20	`25`		J	`39`	`11`	`32075`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`11`	`7204`	`265.7`	`-3.7`	`0.639`	`5`	`0`	`0`	`0.108`
21	`26`		J	`30`	`4`	`32075`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`7734`	`253.5`	`-4.6`	`0.527`	`5`	`0`	`0`	`0.047`
22	`27`		[5CM]J:36	`20`	`1`	`462`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`29`	`2`	`32075`	`247.3`	`2.4`	`0.607`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`28`		D	`29`	`7`	`7734`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`26`	`7`	`7204`	`246.4`	`-1.7`	`0.584`	`2`	`1`	`0`	`0.024`
24	`29`		[5CM]I:93	`19`	`1`	`464`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`30`	`3`	`32451`	`239.9`	`3.6`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		[5CM]J:62	`19`	`1`	`460`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`30`	`2`	`32075`	`238.3`	`3.4`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		H	`32`	`11`	`7441`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`6394`	`238.0`	`-1.9`	`0.603`	`3`	`0`	`0`	`0.023`
	`32`		D	`27`	`9`	`7734`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`7204`	`197.1`	`-2.1`	`0.519`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`217.6`	`-2.0`	`0.561`	`3`	`0`	`0`	`0.023`
27	`33`		[5CM]I:60	`19`	`1`	`464`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`26`	`2`	`32451`	`234.8`	`3.7`	`0.680`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`34`		[5CM]J:52	`18`	`1`	`459`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`29`	`2`	`32075`	`233.4`	`3.3`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[5CM]I:83	`18`	`1`	`467`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`28`	`3`	`32451`	`231.9`	`3.2`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[5CM]I:119	`19`	`1`	`463`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`31`	`2`	`32451`	`231.3`	`4.1`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		[5CM]I:109	`19`	`1`	`471`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`26`	`2`	`32451`	`227.1`	`3.7`	`0.689`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		[5CM]J:85	`20`	`1`	`449`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`26`	`2`	`32075`	`222.5`	`4.2`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[5CM]I:132	`18`	`1`	`431`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`26`	`2`	`32451`	`220.6`	`2.9`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		[5CM]J:13	`19`	`1`	`463`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`27`	`2`	`32075`	`219.7`	`2.9`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[5CM]J:26	`20`	`1`	`455`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`29`	`2`	`32075`	`217.9`	`2.6`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		I	`25`	`4`	`32451`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`7441`	`202.9`	`-4.5`	`0.513`	`2`	`0`	`0`	`0.039`
37	`43`		I	`24`	`6`	`32451`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`6394`	`178.7`	`-0.0`	`0.746`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
38	`44`		C	`25`	`7`	`8724`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`15`	`5`	`7204`	`175.3`	`-1.0`	`0.564`	`1`	`2`	`0`	`0.015`
39	`45`		G	`16`	`4`	`8311`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`8724`	`122.4`	`0.2`	`0.706`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		I	`15`	`4`	`32451`	`◊`	J	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`19`	`4`	`32075`	`112.9`	`1.2`	`0.795`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		[5CM]I:83	`11`	`1`	`467`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`8553`	`107.9`	`-1.0`	`0.383`	`2`	`0`	`0`	`0.079`
42	`48`		I	`15`	`3`	`32451`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`16`	`5`	`7441`	`100.8`	`-2.1`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
43	`49`		[5CM]I:60	`11`	`1`	`464`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`6394`	`98.2`	`-2.5`	`0.261`	`3`	`0`	`0`	`0.072`
44	`50`		C	`10`	`3`	`8724`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`16`	`5`	`8553`	`98.0`	`0.6`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		J	`15`	`3`	`32075`	`◊`	I	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`15`	`4`	`32451`	`93.5`	`0.0`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		D	`12`	`4`	`7734`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`12`	`3`	`32451`	`80.7`	`-2.0`	`0.498`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
47	`53`		[5CM]I:60	`9`	`1`	`464`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`32075`	`79.9`	`1.6`	`0.604`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		[5CM]J:85	`10`	`1`	`449`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`32451`	`79.8`	`0.2`	`0.429`	`3`	`0`	`0`	`0.007`
49	`55`		[5CM]J:52	`7`	`1`	`459`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`32451`	`76.7`	`0.6`	`0.540`	`3`	`0`	`0`	`0.005`
50	`56`		[5CM]I:109	`6`	`1`	`471`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`32075`	`73.4`	`0.8`	`0.586`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
51	`57`		[5CM]I:93	`6`	`1`	`464`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`32075`	`73.0`	`0.5`	`0.547`	`4`	`0`	`0`	`0.008`
52	`58`		D	`7`	`4`	`7734`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`3`	`8553`	`69.5`	`0.2`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`59`		[5CM]J:13	`5`	`1`	`463`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`32451`	`69.3`	`0.8`	`0.567`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
54	`60`		[5CM]I:119	`4`	`1`	`463`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`32075`	`65.6`	`0.7`	`0.566`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
55	`61`		A	`7`	`2`	`8684`	`◊`	I	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`10`	`3`	`32451`	`65.6`	`-0.7`	`0.612`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
56	`62`		[5CM]I:83	`5`	`1`	`467`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`32075`	`65.1`	`0.7`	`0.555`	`4`	`0`	`0`	`0.006`
57	`63`		[5CM]J:36	`7`	`1`	`462`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`32451`	`62.6`	`0.2`	`0.470`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
58	`64`		D	`6`	`2`	`7734`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8311`	`61.3`	`-0.3`	`0.580`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
	`65`		H	`5`	`2`	`7441`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8724`	`59.8`	`-0.2`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`60.6`	`-0.2`	`0.586`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
59	`66`		[5CM]J:62	`5`	`1`	`460`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`32451`	`60.7`	`0.6`	`0.547`	`4`	`0`	`0`	`0.008`
60	`67`		C	`7`	`3`	`8724`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8684`	`54.7`	`1.3`	`0.829`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		G	`2`	`2`	`8311`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`8553`	`25.3`	`0.4`	`0.782`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.0`	`0.8`	`0.805`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`69`		[5CM]I:132	`5`	`1`	`431`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`32075`	`53.7`	`-0.4`	`0.462`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
62	`70`		J	`7`	`1`	`32075`	`x`	J	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`6`	`1`	`32075`	`53.2`	`0.4`	`0.646`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
63	`71`		I	`6`	`2`	`32451`	`x`	I	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`4`	`1`	`32451`	`48.1`	`-4.3`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`72`		[5CM]J:26	`5`	`1`	`455`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`32451`	`45.6`	`0.8`	`0.543`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
65	`73`		J	`7`	`2`	`32075`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`7441`	`43.2`	`-0.7`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
66	`74`		[5CM]I:132	`4`	`1`	`431`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8311`	`36.0`	`0.5`	`0.466`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
67	`75`		I	`4`	`2`	`32451`	`◊`	[5CM]J:26	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`4`	`1`	`455`	`33.0`	`-1.3`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`76`		[5CM]J:36	`3`	`1`	`462`	`◊`	[5CM]I:109	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`471`	`31.4`	`0.1`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`77`		[5CM]J:26	`6`	`1`	`455`	`◊`	[5CM]I:119	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`463`	`29.8`	`0.4`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`78`		[5CM]J:52	`3`	`1`	`459`	`◊`	[5CM]I:93	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`464`	`29.5`	`0.3`	`0.373`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		[5CM]J:62	`4`	`1`	`460`	`◊`	[5CM]I:83	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`467`	`26.1`	`0.2`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`27.8`	`0.3`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`80`		D	`5`	`2`	`7734`	`◊`	[5CM]J:62	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`5`	`1`	`460`	`26.9`	`-0.0`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`81`		[5CM]J:85	`5`	`1`	`449`	`◊`	[5CM]I:60	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`464`	`26.1`	`0.2`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		[5CM]J:13	`2`	`1`	`463`	`◊`	[5CM]I:132	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`431`	`19.8`	`0.1`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`22.9`	`0.1`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`83`		H	`2`	`1`	`7441`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7734`	`21.3`	`0.8`	`0.791`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`84`		A	`1`	`1`	`8684`	`◊`	J	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`5`	`2`	`32075`	`17.5`	`0.5`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`85`		[5CM]I:60	`2`	`1`	`464`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`8684`	`16.3`	`-0.5`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
76	`86`		J	`2`	`1`	`32075`	`◊`	I	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`32451`	`15.1`	`-0.0`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`87`		D	`2`	`2`	`7734`	`◊`	[5CM]J:52	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`459`	`15.1`	`-0.0`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`88`		D	`4`	`2`	`7734`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`5`	`2`	`32075`	`15.1`	`-0.5`	`0.581`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
79	`89`		I	`4`	`1`	`32451`	`x`	I	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`3`	`1`	`32451`	`11.0`	`0.1`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`90`		[5CM]J:62	`1`	`1`	`460`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`7204`	`9.3`	`0.4`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`91`		J	`1`	`1`	`32075`	`x`	J	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`32075`	`4.5`	`-0.5`	`0.187`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`92`		I	`1`	`1`	`32451`	`x`	I	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`32451`	`3.2`	`-0.3`	`0.192`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`93`		I	`2`	`2`	`32451`	`◊`	J	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`32075`	`2.8`	`-0.1`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`94`		J	`1`	`1`	`32075`	`◊`	I	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`32451`	`0.9`	`-0.1`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`95`		[5CM]I:119	`1`	`1`	`463`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8311`	`0.2`	`0.0`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`96`		J	`1`	`1`	`32075`	`◊`	I	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`32451`	`0.1`	`-0.0`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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