PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=353-68-2N4)

Interfaces in PDB 3azf crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.70 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING H3K79Q MUTATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`678`	`145`	`31888`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`667`	`145`	`31985`	`6483.9`	`-71.3`	`0.999`	`346`	`0`	`0`	`0.815`
2	`2`		F	`231`	`53`	`7294`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`262`	`60`	`8590`	`2481.3`	`-44.0`	`0.029`	`26`	`5`	`0`	`0.837`
	`3`		B	`230`	`52`	`6337`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`253`	`59`	`8413`	`2401.3`	`-38.7`	`0.085`	`25`	`4`	`0`	`0.837`
	*Average:*													`2441.3`	`-41.4`	`0.057`	`26`	`5`	`0`	`0.837`
3	`4`		D	`249`	`61`	`7776`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`236`	`59`	`9046`	`2464.4`	`-42.2`	`0.045`	`24`	`13`	`0`	`0.831`
	`5`		H	`254`	`60`	`7487`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`240`	`61`	`8481`	`2430.1`	`-44.4`	`0.030`	`24`	`9`	`0`	`0.831`
	*Average:*													`2447.3`	`-43.3`	`0.038`	`24`	`11`	`0`	`0.831`
4	`6`		I	`100`	`21`	`31985`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`83`	`23`	`8590`	`768.8`	`-7.5`	`0.833`	`11`	`0`	`0`	`0.094`
5	`7`		J	`99`	`23`	`31888`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`76`	`23`	`8413`	`762.9`	`-10.6`	`0.749`	`12`	`0`	`0`	`0.189`
6	`8`		J	`89`	`17`	`31888`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`74`	`22`	`8590`	`709.0`	`-11.6`	`0.678`	`15`	`0`	`0`	`0.236`
7	`9`		I	`86`	`16`	`31985`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`73`	`22`	`8413`	`683.7`	`-14.5`	`0.558`	`15`	`0`	`0`	`0.258`
8	`10`		G	`61`	`16`	`8481`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`20`	`8413`	`660.2`	`-7.2`	`0.334`	`8`	`0`	`0`	`0.153`
	`11`		C	`59`	`16`	`9046`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`62`	`21`	`8590`	`655.5`	`-7.6`	`0.315`	`8`	`0`	`0`	`0.153`
	*Average:*													`657.9`	`-7.4`	`0.325`	`8`	`0`	`0`	`0.153`
9	`12`		E	`56`	`14`	`8590`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`14`	`8413`	`579.0`	`-11.9`	`0.137`	`0`	`2`	`0`	`0.389`
10	`13`		J	`70`	`15`	`31888`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`55`	`19`	`9046`	`548.3`	`-5.7`	`0.749`	`12`	`0`	`0`	`0.143`
11	`14`		I	`73`	`13`	`31985`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`58`	`16`	`9046`	`492.9`	`-8.4`	`0.680`	`7`	`0`	`0`	`0.173`
12	`15`		D	`48`	`13`	`7776`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`52`	`11`	`6337`	`486.6`	`-3.5`	`0.607`	`5`	`3`	`0`	`0.145`
	`16`		H	`50`	`12`	`7487`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`48`	`11`	`7294`	`473.4`	`-2.3`	`0.626`	`4`	`2`	`0`	`0.145`
	*Average:*													`480.0`	`-2.9`	`0.617`	`5`	`3`	`0`	`0.145`
13	`17`		I	`61`	`13`	`31985`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`7776`	`463.7`	`-9.7`	`0.502`	`14`	`0`	`0`	`0.404`
14	`18`		I	`56`	`12`	`31985`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`47`	`17`	`8481`	`426.5`	`-6.2`	`0.650`	`10`	`0`	`0`	`0.130`
15	`19`		C	`43`	`14`	`9046`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`51`	`13`	`7294`	`419.6`	`-3.8`	`0.441`	`5`	`0`	`0`	`0.090`
	`20`		G	`46`	`15`	`8481`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`13`	`6337`	`418.5`	`-3.2`	`0.465`	`6`	`0`	`0`	`0.090`
	*Average:*													`419.0`	`-3.5`	`0.453`	`6`	`0`	`0`	`0.090`
16	`21`		J	`52`	`12`	`31888`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`48`	`12`	`8481`	`369.8`	`-6.4`	`0.635`	`7`	`0`	`0`	`0.139`
17	`22`		J	`46`	`9`	`31888`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`40`	`12`	`7776`	`364.9`	`-6.3`	`0.631`	`4`	`0`	`0`	`0.119`
18	`23`		J	`43`	`8`	`31888`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`40`	`16`	`6337`	`348.4`	`-7.5`	`0.508`	`9`	`0`	`0`	`0.168`
19	`24`		I	`39`	`8`	`31985`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`7294`	`334.8`	`-6.7`	`0.503`	`6`	`0`	`0`	`0.141`
20	`25`		J	`44`	`10`	`31888`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`7294`	`323.9`	`-3.5`	`0.695`	`4`	`0`	`0`	`0.073`
21	`26`		J	`36`	`9`	`31888`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`32`	`12`	`7487`	`303.1`	`-7.0`	`0.453`	`7`	`0`	`0`	`0.139`
22	`27`		F	`26`	`7`	`7294`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`30`	`9`	`7776`	`271.9`	`0.4`	`0.740`	`3`	`3`	`0`	`0.004`
23	`28`		I	`39`	`9`	`31985`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`10`	`6337`	`237.9`	`-0.6`	`0.812`	`3`	`0`	`0`	`0.019`
24	`29`		H	`30`	`10`	`7487`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`6`	`6337`	`226.8`	`-2.4`	`0.535`	`2`	`0`	`0`	`0.086`
	`30`		D	`29`	`9`	`7776`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`7294`	`203.2`	`-1.3`	`0.609`	`3`	`2`	`0`	`0.086`
	*Average:*													`215.0`	`-1.9`	`0.572`	`3`	`1`	`0`	`0.086`
25	`31`		I	`29`	`4`	`31985`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`7487`	`221.6`	`-5.7`	`0.481`	`3`	`0`	`0`	`0.106`
26	`32`		F	`18`	`6`	`7294`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`26`	`6`	`9046`	`180.5`	`-1.5`	`0.520`	`1`	`2`	`0`	`0.007`
27	`33`		G	`17`	`5`	`8481`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`9046`	`133.4`	`0.3`	`0.710`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
28	`34`		J	`14`	`3`	`31888`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`12`	`3`	`8413`	`108.6`	`-1.7`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		J	`14`	`1`	`31888`	`◊`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`14`	`1`	`31985`	`92.9`	`1.4`	`0.812`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		J	`12`	`3`	`31888`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`4`	`7776`	`91.6`	`-2.8`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
31	`37`		I	`13`	`2`	`31985`	`◊`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`14`	`4`	`31888`	`82.5`	`1.6`	`0.831`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		I	`11`	`3`	`31985`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`10`	`3`	`7776`	`75.6`	`-1.2`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
33	`39`		E	`11`	`4`	`8590`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`3`	`9046`	`73.6`	`0.9`	`0.755`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		E	`9`	`2`	`8590`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`5`	`7776`	`68.1`	`0.1`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		H	`7`	`4`	`7487`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`9046`	`63.5`	`-0.4`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
	`42`		D	`4`	`2`	`7776`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8481`	`42.2`	`-0.1`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`52.9`	`-0.3`	`0.606`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
36	`43`		[CL]E:1001	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8590`	`62.1`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.611`
	`44`		[CL]A:1001	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`8413`	`61.0`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.611`
	*Average:*													`61.6`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.611`
37	`45`		J	`7`	`1`	`31888`	`x`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`9`	`1`	`31888`	`57.5`	`-1.6`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`46`		[MN]J:1001	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`31888`	`57.0`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
39	`47`		[MN]J:1003	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`31888`	`56.0`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
40	`48`		[MN]I:1002	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`31985`	`54.4`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
41	`49`		[MN]I:1004	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`31985`	`52.9`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
42	`50`		[MN]I:1005	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`31985`	`51.8`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.091`
43	`51`		[MN]J:1002	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`31888`	`51.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
44	`52`		[MN]I:1003	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`31985`	`51.0`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
45	`53`		[MN]J:1004	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`31888`	`50.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
46	`54`		[MN]J:1005	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`31888`	`50.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
47	`55`		H	`8`	`4`	`7487`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`2`	`31985`	`49.1`	`-2.0`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
48	`56`		E	`11`	`3`	`8590`	`◊`	[MN]D:201	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`47.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
49	`57`		G	`5`	`2`	`8481`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`6`	`2`	`31985`	`46.3`	`-0.2`	`0.627`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`58`		[CL]G:1001	`1`	`1`	`125`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8481`	`45.8`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`59`		[CL]C:1001	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`9046`	`43.9`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`44.8`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
51	`60`		[CL]C:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`7776`	`43.7`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`61`		[CL]G:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7487`	`42.3`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	*Average:*													`43.0`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
52	`62`		[MN]I:1006	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`31985`	`40.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
53	`63`		[MN]I:1001	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`31985`	`38.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
54	`64`		[MN]I:1006	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`31888`	`37.9`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
55	`65`		[MN]I:1001	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31888`	`36.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
56	`66`		[MN]D:201	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`7776`	`35.8`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
57	`67`		I	`9`	`2`	`31985`	`◊`	[MN]J:1005	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`123`	`35.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`68`		[MN]I:1004	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`31888`	`33.4`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
59	`69`		C	`6`	`3`	`9046`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`8413`	`22.1`	`1.1`	`0.850`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		G	`4`	`2`	`8481`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8590`	`13.1`	`0.6`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.6`	`0.9`	`0.842`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`71`		J	`5`	`2`	`31888`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`3`	`2`	`31985`	`21.9`	`-1.6`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`72`		I	`6`	`2`	`31985`	`◊`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`3`	`2`	`31888`	`20.9`	`-0.5`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`73`		[MN]D:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`9046`	`20.2`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
63	`74`		[MN]I:1002	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`31888`	`18.5`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
64	`75`		[MN]I:1004	`1`	`1`	`123`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`7776`	`18.5`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
65	`76`		[MN]J:1005	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31985`	`17.3`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
66	`77`		[MN]J:1001	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31985`	`17.1`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
67	`78`		[CL]C:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`31888`	`16.5`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
68	`79`		[CL]G:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31985`	`16.3`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
69	`80`		H	`2`	`1`	`7487`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`31888`	`16.1`	`-0.1`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`81`		F	`3`	`2`	`7294`	`◊`	[MN]D:201	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`14.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
71	`82`		I	`3`	`1`	`31985`	`x`	I	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`31985`	`14.3`	`-0.7`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`83`		[MN]J:1002	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31985`	`13.1`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
73	`84`		I	`2`	`1`	`31985`	`x`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`31985`	`11.1`	`0.5`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`85`		[CL]E:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`7294`	`10.4`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`86`		[CL]A:1001	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6337`	`10.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`10.2`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
75	`87`		J	`2`	`1`	`31888`	`x`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`31888`	`9.4`	`-0.2`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`88`		J	`2`	`2`	`31888`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`9046`	`8.5`	`-0.3`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
77	`89`		[MN]I:1005	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`31888`	`6.3`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
78	`90`		[MN]I:1003	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31888`	`5.7`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`91`		[MN]J:1004	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31985`	`5.6`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`92`		[MN]J:1003	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`31985`	`3.9`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
81	`93`		I	`1`	`1`	`31985`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`1`	`1`	`8590`	`3.1`	`0.0`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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