PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=683-69-H1K)

Interfaces in PDB 1xpo crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 3.15 Å

STRUCTURAL MECHANISM OF INHIBITION OF THE RHO TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR BY THE ANTIBIOTIC BICYCLOMYCIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`159`	`43`	`20248`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`191`	`50`	`20990`	`1580.7`	`-2.8`	`0.670`	`13`	`15`	`0`	`0.203`
	`2`		F	`140`	`37`	`20589`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`196`	`56`	`20493`	`1486.3`	`2.2`	`0.824`	`15`	`15`	`0`	`0.203`
	`3`		E	`153`	`42`	`20493`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`193`	`52`	`20315`	`1475.9`	`1.9`	`0.825`	`11`	`8`	`0`	`0.203`
	`4`		D	`140`	`38`	`20315`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`186`	`50`	`20210`	`1474.2`	`0.4`	`0.776`	`15`	`12`	`0`	`0.203`
	`5`		C	`151`	`39`	`20210`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`187`	`55`	`20248`	`1471.0`	`-3.8`	`0.601`	`8`	`14`	`0`	`0.203`
	*Average:*													`1497.6`	`-0.4`	`0.739`	`12`	`13`	`0`	`0.203`
2	`6`		A	`148`	`40`	`20990`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`148`	`40`	`20990`	`1304.7`	`-0.8`	`0.737`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		[AGS]F:6600	`30`	`1`	`643`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`56`	`17`	`20589`	`404.8`	`-5.5`	`0.499`	`14`	`0`	`0`	`0.336`
	`8`		[AGS]A:1600	`30`	`1`	`644`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`54`	`16`	`20990`	`399.3`	`-7.4`	`0.355`	`8`	`0`	`0`	`0.336`
	`9`		[AGS]C:3600	`29`	`1`	`643`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`54`	`14`	`20210`	`382.6`	`-6.0`	`0.400`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`10`		[AGS]D:4600	`29`	`1`	`640`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`55`	`15`	`20315`	`373.6`	`-7.2`	`0.333`	`9`	`0`	`0`	`0.336`
	`11`		[AGS]E:5600	`28`	`1`	`653`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`50`	`14`	`20493`	`371.6`	`-7.4`	`0.276`	`6`	`0`	`0`	`0.336`
	`12`		[AGS]B:2600	`29`	`1`	`647`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`53`	`15`	`20248`	`368.7`	`-5.5`	`0.506`	`11`	`0`	`0`	`0.336`
	*Average:*													`383.4`	`-6.5`	`0.395`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
4	`13`		F	`39`	`13`	`20589`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`43`	`13`	`20210`	`380.5`	`-5.0`	`0.197`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
5	`14`		J	`32`	`2`	`780`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`57`	`15`	`20315`	`379.7`	`-5.9`	`0.449`	`7`	`0`	`0`	`0.369`
6	`15`		M	`33`	`2`	`742`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`16`	`20248`	`365.8`	`-2.9`	`0.648`	`4`	`0`	`0`	`0.025`
7	`16`		G	`36`	`2`	`786`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`17`	`20990`	`337.3`	`-4.8`	`0.385`	`3`	`0`	`0`	`0.371`
8	`17`		H	`33`	`2`	`692`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`43`	`12`	`20210`	`315.8`	`-2.9`	`0.552`	`6`	`0`	`0`	`0.027`
9	`18`		K	`29`	`2`	`737`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`47`	`13`	`20493`	`295.8`	`-3.8`	`0.394`	`2`	`0`	`0`	`0.026`
10	`19`		L	`26`	`2`	`668`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`42`	`12`	`20589`	`287.4`	`-0.8`	`0.489`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		C	`26`	`6`	`20210`	`◊`	C	-x,y,-z	`2_555`	`27`	`6`	`20210`	`247.2`	`-1.3`	`0.480`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
12	`21`		F	`22`	`8`	`20589`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`29`	`10`	`20315`	`236.6`	`-1.0`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		[BCM]C:3701	`19`	`1`	`423`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`40`	`13`	`20210`	`235.5`	`-2.4`	`0.413`	`7`	`0`	`0`	`0.036`
14	`23`		[BCM]E:5701	`19`	`1`	`425`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`20493`	`232.1`	`-2.6`	`0.344`	`3`	`0`	`0`	`0.063`
	`24`		[BCM]F:6701	`19`	`1`	`424`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`33`	`13`	`20589`	`230.9`	`-1.6`	`0.454`	`6`	`0`	`0`	`0.063`
	`25`		[BCM]B:2701	`19`	`1`	`421`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`15`	`20248`	`228.2`	`-1.6`	`0.458`	`5`	`0`	`0`	`0.063`
	*Average:*													`230.4`	`-2.0`	`0.419`	`5`	`0`	`0`	`0.063`
15	`26`		[BCM]D:4701	`18`	`1`	`424`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`20315`	`223.2`	`-3.1`	`0.358`	`7`	`0`	`0`	`0.252`
16	`27`		F	`29`	`9`	`20589`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`25`	`7`	`20990`	`217.6`	`2.5`	`0.847`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
17	`28`		B	`19`	`7`	`20248`	`◊`	F	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`19`	`7`	`20589`	`160.3`	`0.1`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`29`		A	`19`	`6`	`20990`	`◊`	C	-x,y-1,-z	`2_545`	`16`	`5`	`20210`	`127.3`	`1.0`	`0.745`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`30`		[AGS]D:4600	`13`	`1`	`640`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`20210`	`118.3`	`-1.6`	`0.602`	`2`	`0`	`0`	`0.255`
	`31`		[AGS]E:5600	`12`	`1`	`653`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`20315`	`113.9`	`-2.1`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.255`
	`32`		[AGS]B:2600	`9`	`1`	`647`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`20990`	`108.2`	`-3.3`	`0.388`	`2`	`0`	`0`	`0.255`
	`33`		[AGS]C:3600	`10`	`1`	`643`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`20248`	`89.3`	`-2.2`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.255`
	`34`		[AGS]F:6600	`10`	`1`	`643`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`20493`	`76.4`	`-2.8`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.255`
	*Average:*													`101.2`	`-2.4`	`0.517`	`1`	`0`	`0`	`0.255`
20	`35`		E	`10`	`3`	`20493`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`14`	`3`	`20315`	`105.7`	`1.8`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`36`		[BCM]B:2701	`6`	`1`	`421`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`20990`	`84.2`	`2.6`	`0.805`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[BCM]E:5701	`9`	`1`	`425`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`20315`	`83.2`	`1.7`	`0.739`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.7`	`2.1`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`38`		[BCM]D:4701	`6`	`1`	`424`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`20210`	`84.1`	`2.7`	`0.842`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`39`		[BCM]F:6701	`6`	`1`	`424`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`20493`	`81.1`	`1.9`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[BCM]C:3701	`5`	`1`	`423`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`20248`	`68.6`	`2.3`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.8`	`2.1`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`41`		A	`7`	`3`	`20990`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`9`	`4`	`20493`	`61.9`	`1.1`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`42`		[BCM]E:5701	`10`	`1`	`425`	`◊`	[AGS]E:5600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`653`	`54.0`	`-0.1`	`0.556`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
26	`43`		[BCM]B:2701	`7`	`1`	`421`	`◊`	[AGS]B:2600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`647`	`51.0`	`0.2`	`0.602`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
27	`44`		[BCM]D:4701	`6`	`1`	`424`	`◊`	[AGS]D:4600	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`640`	`50.5`	`0.7`	`0.626`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`45`		[BCM]F:6701	`9`	`1`	`424`	`◊`	[AGS]F:6600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`643`	`49.5`	`0.4`	`0.608`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[BCM]C:3701	`8`	`1`	`423`	`◊`	[AGS]C:3600	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`643`	`47.9`	`0.5`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.7`	`0.5`	`0.614`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`47`		G	`6`	`1`	`786`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`10`	`5`	`20990`	`47.2`	`0.7`	`0.725`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`48`		[MG]A:1601	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`20990`	`46.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
	`49`		[MG]B:2601	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`20248`	`39.2`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
	`50`		[MG]F:6601	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`20589`	`37.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
	`51`		[MG]D:4601	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`20315`	`34.8`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
	`52`		[MG]E:5601	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`20493`	`30.5`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
	*Average:*													`37.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.374`
31	`53`		B	`6`	`2`	`20248`	`◊`	E	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`6`	`3`	`20493`	`43.8`	`-0.2`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`54`		[MG]C:3601	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`20210`	`36.4`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
33	`55`		[AGS]A:1600	`4`	`1`	`644`	`◊`	[MG]A:1601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.3`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`56`		[AGS]D:4600	`4`	`1`	`640`	`◊`	[MG]D:4601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`57`		[AGS]F:6600	`4`	`1`	`643`	`◊`	[MG]F:6601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.0`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`58`		[AGS]B:2600	`3`	`1`	`647`	`◊`	[MG]B:2601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`27.4`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`59`		[AGS]E:5600	`3`	`1`	`653`	`◊`	[MG]E:5601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`26.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	*Average:*													`28.7`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
34	`60`		F	`5`	`3`	`20589`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`20990`	`30.6`	`0.2`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`61`		[AGS]C:3600	`3`	`1`	`643`	`◊`	[MG]C:3601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`27.0`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
36	`62`		H	`4`	`2`	`692`	`◊`	H	-x,y,-z	`2_555`	`4`	`2`	`692`	`25.2`	`-0.1`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`63`		[BCM]C:3701	`3`	`1`	`423`	`f`	[MG]C:3601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.1`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`64`		[BCM]B:2701	`5`	`1`	`421`	`f`	[MG]B:2601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`21.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`65`		[BCM]E:5701	`6`	`1`	`425`	`f`	[MG]E:5601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.4`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`66`		[BCM]D:4701	`5`	`1`	`424`	`f`	[MG]D:4601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`67`		[BCM]F:6701	`3`	`1`	`424`	`f`	[MG]F:6601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`18.4`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	*Average:*													`20.5`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
38	`68`		F	`4`	`2`	`20589`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`20210`	`24.1`	`-0.4`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`69`		[MG]E:5601	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20315`	`17.8`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
40	`70`		L	`2`	`1`	`668`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`2`	`2`	`20990`	`14.5`	`0.7`	`0.753`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`71`		C	`1`	`1`	`20210`	`◊`	E	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`20493`	`6.3`	`0.0`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`72`		B	`2`	`2`	`20248`	`◊`	D	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`2`	`1`	`20315`	`4.4`	`0.1`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`73`		E	`1`	`1`	`20493`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`1`	`1`	`20248`	`2.2`	`-0.1`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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