spacer Human topoisomerase iibeta in complex with DNA and ametantrone
UniProt sequence   UniProt   CATH   Pfam   SCOP   Secondary structure   UniProt features   FASTA string  

Chain A: DNA topoisomerase 2-beta

1 M A S W S H P Q F E K G A D D D D K V P D P T S V D S V K Y S K I K G I P K L D D A N D A G G K H S L E C T L I L T E G
S V K Y S K I K G I P K L D D A N D A G G K H S L E C T L I L T E G
450
61 D S A K S L A V S G L G V I G R D R Y G V F P L R G K I L N V R E A S H K Q I M E N A E I N N I I K I V G L Q Y K K S Y
D S A K S L A V S G L G V I G R D R Y G V F P L R G K I L N V R E A S H K Q I M E N A E I N N I I K I V G L Q Y K K S Y
121 D D A E S L K T L R Y G K I M I M T D Q D Q D G S H I K G L L I N F I H H N W P S L L K H G F L E E F I T P I V K A S K
D D A E S L K T L R Y G K I M I M T D Q D Q D G S H I K G L L I N F I H H N W P S L L K H G F L E E F I T P I V K A S K
181 N K Q E L S F Y S I P E F D E W K K H I E N Q K A W K I K Y Y K G L G T S T A K E A K E Y F A D M E R H R I L F R Y A G
N K Q E L S F Y S I P E F D E W K K H I E N Q K A W K I K Y Y K G L G T S T A K E A K E Y F A D M E R H R I L F R Y A G
241 P E D D A A I T L A F S K K K I D D R K E W L T N F M E D R R Q R R L H G L P E Q F L Y G T A T K H L T Y N D F I N K E
P E D D A A I T L A F S K K K I D D R K E W L T N F M E D R R Q R R L H G L P E Q F L Y G T A T K H L T Y N D F I N K E
301 L I L F S N S D N E R S I P S L V D G F K P G Q R K V L F T C F K R N D K R E V K V A Q L A G S V A E M S A Y H H G E Q
L I L F S N S D N E R S I P S L V D G F K P G Q R K V L F T C F K R N D K R E V K V A Q L A G S V A E M S A Y H H G E Q
361 A L M M T I V N L A Q N F V G S N N I N L L Q P I G Q F G T R L H G G K D A A S P R Y I F T M L S T L A R L L F P A V D
A L M M T I V N L A Q N F V G S N N I N L L Q P I G Q F G T R L H G G K D A A S P R Y I F T M L S T L A R L L F P A V D
421 D N L L K F L Y D D N Q R V E P E W Y I P I I P M V L I N G A E G I G T G W A C K L P N Y D A R E I V N N V R R M L D G
D N L L K F L Y D D N Q R V E P E W Y I P I I P M V L I N G A E G I G T G W A C K L P N Y D A R E I V N N V R R M L D G
481 L D P H P M L P N Y K N F K G T I Q E L G Q N Q Y A V S G E I F V V D R N T V E I T E L P V R T W T Q V Y K E Q V L E P
L D P H P M L P N Y K N F K G T I Q E L G Q N Q Y A V S G E I F V V D R N T V E I T E L P V R T W T Q V Y K E Q V L E P
541 M L N G T D K T P A L I S D Y K E Y H T D T T V K F V V K M T E E K L A Q A E A A G L H K V F K L Q T T L T C N S M V L
M L N G T D K T P A L I S D Y K E Y H T D T T V K F V V K M T E E K L A Q A E A A G L H K V F K L Q T T L T C N S M V L
601 F D H M G C L K K Y E T V Q D I L K E F F D L R L S Y Y G L R K E W L V G M L G A E S T K L N N Q A R F I L E K I Q G K
F D H M G C L K K Y E T V Q D I L K E F F D L R L S Y Y G L R K E W L V G M L G A E S T K L N N Q A R F I L E K I Q G K
661 I T I E N R S K K D L I Q M L V Q R G Y E S D P V K A W K E A Q E K A A E E D E T Q N Q H D D S S S D S G T P S G P D F
I T I E N R S K K D L I Q M L V Q R G Y E S D P V K A W K E A Q E K A A E E D E T Q N Q H D D S S S D S G T P S G P D F
721 N Y I L N M S L W S L T K E K V E E L I K Q R D A K G R E V N D L K R K S P S D L W K E D L A A F V E E L D K V E S Q E
N Y I L N M S L W S L T K E K V E E L I K Q R D A K G R E V N D L K R K S P S D L W K E D L A A F V E E L D K V E S Q E
781 R E D G A P G F S S I S A H H H H H H H H H H
R E D
1206

Regions

UniProt

Q02880
450 .. 1206 > 445 .. 1201 (PDB)

Pfam

PF00204
445 .. 445 (PDB)
PF01751
472 .. 588 (PDB)
PF00521
729 .. 1185 (PDB)

Chain B: DNA topoisomerase 2-beta

1 M A S W S H P Q F E K G A D D D D K V P D P T S V D S V K Y S K I K G I P K L D D A N D A G G K H S L E C T L I L T E G
S V K Y S K I K G I P K L D D A N D A G G K H S L E C T L I L T E G
450
61 D S A K S L A V S G L G V I G R D R Y G V F P L R G K I L N V R E A S H K Q I M E N A E I N N I I K I V G L Q Y K K S Y
D S A K S L A V S G L G V I G R D R Y G V F P L R G K I L N V R E A S H K Q I M E N A E I N N I I K I V G L Q Y K K S Y
121 D D A E S L K T L R Y G K I M I M T D Q D Q D G S H I K G L L I N F I H H N W P S L L K H G F L E E F I T P I V K A S K
D D A E S L K T L R Y G K I M I M T D Q D Q D G S H I K G L L I N F I H H N W P S L L K H G F L E E F I T P I V K A S K
181 N K Q E L S F Y S I P E F D E W K K H I E N Q K A W K I K Y Y K G L G T S T A K E A K E Y F A D M E R H R I L F R Y A G
N K Q E L S F Y S I P E F D E W K K H I E N Q K A W K I K Y Y K G L G T S T A K E A K E Y F A D M E R H R I L F R Y A G
241 P E D D A A I T L A F S K K K I D D R K E W L T N F M E D R R Q R R L H G L P E Q F L Y G T A T K H L T Y N D F I N K E
P E D D A A I T L A F S K K K I D D R K E W L T N F M E D R R Q R R L H G L P E Q F L Y G T A T K H L T Y N D F I N K E
301 L I L F S N S D N E R S I P S L V D G F K P G Q R K V L F T C F K R N D K R E V K V A Q L A G S V A E M S A Y H H G E Q
L I L F S N S D N E R S I P S L V D G F K P G Q R K V L F T C F K R N D K R E V K V A Q L A G S V A E M S A Y H H G E Q
361 A L M M T I V N L A Q N F V G S N N I N L L Q P I G Q F G T R L H G G K D A A S P R Y I F T M L S T L A R L L F P A V D
A L M M T I V N L A Q N F V G S N N I N L L Q P I G Q F G T R L H G G K D A A S P R Y I F T M L S T L A R L L F P A V D
421 D N L L K F L Y D D N Q R V E P E W Y I P I I P M V L I N G A E G I G T G W A C K L P N Y D A R E I V N N V R R M L D G
D N L L K F L Y D D N Q R V E P E W Y I P I I P M V L I N G A E G I G T G W A C K L P N Y D A R E I V N N V R R M L D G
481 L D P H P M L P N Y K N F K G T I Q E L G Q N Q Y A V S G E I F V V D R N T V E I T E L P V R T W T Q V Y K E Q V L E P
L D P H P M L P N Y K N F K G T I Q E L G Q N Q Y A V S G E I F V V D R N T V E I T E L P V R T W T Q V Y K E Q V L E P
541 M L N G T D K T P A L I S D Y K E Y H T D T T V K F V V K M T E E K L A Q A E A A G L H K V F K L Q T T L T C N S M V L
M L N G T D K T P A L I S D Y K E Y H T D T T V K F V V K M T E E K L A Q A E A A G L H K V F K L Q T T L T C N S M V L
601 F D H M G C L K K Y E T V Q D I L K E F F D L R L S Y Y G L R K E W L V G M L G A E S T K L N N Q A R F I L E K I Q G K
F D H M G C L K K Y E T V Q D I L K E F F D L R L S Y Y G L R K E W L V G M L G A E S T K L N N Q A R F I L E K I Q G K
661 I T I E N R S K K D L I Q M L V Q R G Y E S D P V K A W K E A Q E K A A E E D E T Q N Q H D D S S S D S G T P S G P D F
I T I E N R S K K D L I Q M L V Q R G Y E S D P V K A W K E A Q E K A A E E D E T Q N Q H D D S S S D S G T P S G P D F
721 N Y I L N M S L W S L T K E K V E E L I K Q R D A K G R E V N D L K R K S P S D L W K E D L A A F V E E L D K V E S Q E
N Y I L N M S L W S L T K E K V E E L I K Q R D A K G R E V N D L K R K S P S D L W K E D L A A F V E E L D K V E S Q E
781 R E D G A P G F S S I S A H H H H H H H H H H
R E D
1206

Regions

UniProt

Q02880
450 .. 1206 > 445 .. 1201 (PDB)

Pfam

PF00204
445 .. 445 (PDB)
PF01751
472 .. 588 (PDB)
PF00521
729 .. 1185 (PDB)

Chain C: DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*AP*GP*C)-3')

1 A G C C G A G C






Chain D: DNA (5'-D(P*TP*GP*CP*AP*GP*CP*TP*CP*GP*GP*CP*T)-3')

1 T G C A G C T C G G C T






Chain E: DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*AP*GP*C)-3')

1 A G C C G A G C






Chain F: DNA (5'-D(P*TP*GP*CP*AP*GP*CP*TP*CP*GP*GP*CP*T)-3')

1 T G C A G C T C G G C T






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