spacer Structure of the D. melanogaster 60S ribosomal proteins
UniProt sequence   UniProt   CATH   Pfam   SCOP   Secondary structure   UniProt features   FASTA string  

Chain A: 60S ribosomal protein L8

1 M G R V I R A Q R K G A G S V F K A H V K K R K G A A K L R S L D F A E R S G Y I R G V V K D I I H D P G R G A P L A V
M G R V I R A Q R K G A G S V F K A H V K K R K G A A K L R S L D F A E R S G Y I R G V V K D I I H D P G R G A P L A V
1
61 V H F R D P Y R Y K I R K E L F I A P E G M H T G Q F V Y C G R K A T L Q I G N V M P L S Q M P E G T I I C N L E E K T
V H F R D P Y R Y K I R K E L F I A P E G M H T G Q F V Y C G R K A T L Q I G N V M P L S Q M P E G T I I C N L E E K T
121 G D R G R L A R T S G N Y A T V I A H N Q D T K K T R V K L P S G A K K V V P S A N R A M V G I V A G G G R I D K P I L
G D R G R L A R T S G N Y A T V I A H N Q D T K K T R V K L P S G A K K V V P S A N R A M V G I V A G G G R I D K P I L
181 K A G R A Y H K Y K V K R N S W P K V R G V A M N P V E H P H G G G N H Q H I G K A S T V K R G T S A G R K V G L I A A
K A G R A Y H K Y K V K R N S W P K V R G V A M N P V E H P H G G G N H Q H I G K A S T V K R G T S A G R K V G L I A A
241 R R T G R I R G G K G D S K D K
R R T G R I R G G K G D S K D K
256

Regions

UniProt

Q9V3G1
1 .. 256 > 1 .. 256 (PDB)

Pfam

PF00181
11 .. 90 (PDB)
PF03947
96 .. 231 (PDB)

Chain B: 60S ribosomal protein L3

1 M S H R K F S A P R H G S M A F Y P K K R S A R H R G K V K A F P K D D A S K P V H L T C F I G Y K A G M T H I V R E A
M S H R K F S A P R H G S M A F Y P K K R S A R H R G K V K A F P K D D A S K P V H L T C F I G Y K A G M T H I V R E A
1
61 D R P G S K I N K K E V V E A V T V L E T P P M I V V G A V G Y I E T P F G L R A L V N V W A Q H L S E E C R R R F Y K
D R P G S K I N K K E V V E A V T V L E T P P M I V V G A V G Y I E T P F G L R A L V N V W A Q H L S E E C R R R F Y K
121 N W Y K S K K K A F T K A S K K W T D D L G K K S I E N D F R K M L R Y C K V I R V I A H S Q I R L I K Q R Q K K A H V
N W Y K S K K K A F T K A S K K W T D D L G K K S I E N D F R K M L R Y C K V I R V I A H S Q I R L I K Q R Q K K A H V
181 M E I Q L N G G S I E D K V K W A R E H L E K P I Q V S N V F G Q D E M I D C V G V T K G K G F K G V T S R W H T K K L
M E I Q L N G G S I E D K V K W A R E H L E K P I Q V S N V F G Q D E M I D C V G V T K G K G F K G V T S R W H T K K L
241 P R K T H K G L R K V A C I G A W H P S R V S T T V A R A G Q K G Y H H R T E I N K K I Y R I G A G I H T K D G K V I K
P R K T H K G L R K V A C I G A W H P S R V S T T V A R A G Q K G Y H H R T E I N K K I Y R I G A G I H T K D G K V I K
301 N N A S T E Y D L T D K S I T P M G G F P H Y G E V N N D F V M I K G C C I G S K K R I I T L R K S L L K H T K R S A L
N N A S T E Y D L T D K S I T P M G G F P H Y G E V N N D F V M I K G C C I G S K K R I I T L R K S L L K H T K R S A L
361 E Q I K L K F I D T S S K M G H G R F Q T P A D K L A F M G P L K K D R L K E E A A A T T A A A A A A T T T S A
E Q I K L K F I D T S S K M G H G R F Q T P A D K L A F M G P L K K D R L K E E A A A T T A A A A A A T T T S A
416

Regions

UniProt

O16797
1 .. 416 > 1 .. 416 (PDB)

Pfam

PF00297
50 .. 348 (PDB)

Chain C: 60S ribosomal protein L4

1 M S L G N A R P L V S V Y T E K N E P A K D K N I C L P A V F K A P I R P D V V N E V H Q L L R R N N R Q A Y A V S E L
M S L G N A R P L V S V Y T E K N E P A K D K N I C L P A V F K A P I R P D V V N E V H Q L L R R N N R Q A Y A V S E L
1
61 A G H Q T S A E S W G T G R A V A R I P R V R G G G T H R S G Q G A F G N M C R G G R M F A P T K T F R R W H R K V N V
A G H Q T S A E S W G T G R A V A R I P R V R G G G T H R S G Q G A F G N M C R G G R M F A P T K T F R R W H R K V N V
121 N Q R R Y A L V S A I A A S G V P A L V Q S K G H V I D G V S E F P L V V S D E V Q K V Q K T K Q A V I F L R R L K I W
N Q R R Y A L V S A I A A S G V P A L V Q S K G H V I D G V S E F P L V V S D E V Q K V Q K T K Q A V I F L R R L K I W
181 A D I Q K V Y K S Q R F R A G R G T M R D R R R I A R R G P L V V Y D K D E G L R K A F R N I P G I E T I N V D K L N L
A D I Q K V Y K S Q R F R A G R G T M R D R R R I A R R G P L V V Y D K D E G L R K A F R N I P G I E T I N V D K L N L
241 L K L A P G G H V G R F V I W T E S A F A R L N D L F G T W K K P S T L K K G Y N L P Q P K M A N T D L S R L L K S E E
L K L A P G G H V G R F V I W T E S A F A R L N D L F G T W K K P S T L K K G Y N L P Q P K M A N T D L S R L L K S E E
301 I R K V L R D P R K R V F R S V R R L N P L T N V R Q L I K L N P Y A E V L K R R A A L A A E K R T V A K V L A K A K K
I R K V L R D P R K R V F R S V R R L N P L T N V R Q L I K L N P Y A E V L K R R A A L A A E K R T V A K V L A K A K K
361 Q N V E L A K S H F A N V A T K A A A N R A K L L A A R K K K V A A K K P A A K K
Q N V E L A K S H F A N V A T K A A A N R A K L L A A R K K K V A A K K P A A K K
401

Regions

UniProt

P09180
1 .. 401 > 1 .. 401 (PDB)

Pfam

PF00573
25 .. 266 (PDB)
PF14374
278 .. 356 (PDB)

Chain D: 60S ribosomal protein L5

1 M G F V K V V K N K Q Y F K R Y Q V K F R R R R E G K T D Y Y A R K R L T F Q D K N K Y N T P K Y R L I V R L S N K D I
M G F V K V V K N K Q Y F K R Y Q V K F R R R R E G K T D Y Y A R K R L T F Q D K N K Y N T P K Y R L I V R L S N K D I
1
61 T V Q I A Y A R I E G D R V V C A A Y S H E L P K Y G I Q V G L T N Y A A A Y C T G L L V A R R V L N K L G L D S L Y A
T V Q I A Y A R I E G D R V V C A A Y S H E L P K Y G I Q V G L T N Y A A A Y C T G L L V A R R V L N K L G L D S L Y A
121 G C T E V T G E E F N V E P V D D G P G A F R C F L D V G L A R T T T G A R V F G A M K G A V D G G L N I P H S V K R F
G C T E V T G E E F N V E P V D D G P G A F R C F L D V G L A R T T T G A R V F G A M K G A V D G G L N I P H S V K R F
181 P G Y S A E T K S F N A D V H R A H I F G Q H V A D Y M R S L E E E D E E S