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PDBe Entry: 3df4
Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with hygromycin B. This file contains the 50S subunit of the second 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes.
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| Summary |  |
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| Header |
RIBOSOME
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| Method | X-RAY DIFFRACTION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experiment | Resolution: 3.5 Å, R-factor: 26.9%, Free R-factor: 31.8%, Spacegroup: P 21 21 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Released | 19/08/2008, deposition: 11/06/2008, last revision: 03/11/2009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Authors |
Borovinskaya, M.A.; Shoji, S.; Fredrick, K.; Cate, J.H.D.
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| Primary citation |
Structural basis for hygromycin B inhibition of protein biosynthesis RNA vol:14, pag:1590-1599 (2008) [PubMed ID 18567815 ]
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| Keywords |
RNA-protein complex, RIBOSOME
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| Organism |
Escherichia coli 562(A B V C D E F G H J K L M N O P Q R S T U W X Y Z 0 1 2 3 4 I)
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| UniProt |
50S ribosomal protein L25 P68919 (V) 50S ribosomal protein L2 P60422 (C)50S ribosomal protein L3 P60438 (D)50S ribosomal protein L4 P60723 (E)50S ribosomal protein L5 P62399 (F)50S ribosomal protein L6 P0AG57 (G)50S ribosomal protein L9 P0A7R1 (H)50S ribosomal protein L13 P0AA10 (J)50S ribosomal protein L14 P0ADY5 (K)50S ribosomal protein L15 P02413 (L)50S ribosomal protein L16 P0ADY9 (M)50S ribosomal protein L17 P0AG46 (N)50S ribosomal protein L18 P0C018 (O)50S ribosomal protein L19 P0A7K6 (P)50S ribosomal protein L20 P0A7L3 (Q)50S ribosomal protein L21 P0AG49 (R)50S ribosomal protein L22 P61175 (S)50S ribosomal protein L23 P0ADZ2 (T)50S ribosomal protein L24 P60624 (U)50S ribosomal protein L27 P0A7L8 (W)50S ribosomal protein L29 P0A7M6 (X)50S ribosomal protein L30 P0AG53 (Y)50S ribosomal protein L28 P0A7M2 (Z)50S ribosomal protein L32 P0A7N4 (0)50S ribosomal protein L33 P0A7N9 (1)50S ribosomal protein L34 P0A7P5 (2)50S ribosomal protein L35 (Ribosomal protein A) P0A7Q1 (3)50S ribosomal protein L36 (Ribosomal protein B) P0A7Q6 (4)50S ribosomal protein L11 P0A7J7 (I)
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| Solvent | 2, B, C, D, L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Related entries | 3df1, 3df2, 3df3, 3df4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymers |
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| Heterogens |
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