spacer CRYSTAL STRUCTURE OF THE TERNARY COMPLEX BETWEEN HUMAN T CELL RECEPTOR, STAPHYLOCOCCAL ENTEROTOXIN H AND HUMAN MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS II
UniProt sequence   UniProt   CATH   Pfam   SCOP   Secondary structure   UniProt features   FASTA string  

Chain A: T CELL RECEPTOR ALPHA CHAIN C REGION

1 M Q L L E Q S P Q F L S I Q E G E N L T V Y C N S S S V F S S L Q W Y R Q E P G E G P V L L V T V V T G G E V K K L K R
61 L T F Q F G D A R K D S S L H I T A A Q P G D T G L Y L C A G A G S Q G N L I F G K G T K L S V K P N I Q N P D P A V Y
P N I Q N P D P A V Y
1
121 Q L R D S K S S D K S V C L F T D F D S Q T N V S Q S K D S D V Y I T D K C V L D M R S M D F K S N S A V A W S N K S D
Q L R D S K S S D K S V C L F T D F D S Q T N V S Q S K D S D V Y I T D K T V L D M R S M D F K S N S A V A W S N K S D
181 F A C A N A F N N S I I P E D T F F P S P E S S
F A C A N A F N N S I I P E D T F F P S P E S S
95

Regions

UniProt

P01848
1 .. 95 > 110 .. 204 (PDB)

Pfam

PF09291
117 .. 200 (PDB)

Chain B: T CELL RECEPTOR BETA-1 CHAIN C REGION

1 M V D G G I T Q S P K Y L F R K E G Q N V T L S C E Q N L N H D A M Y W Y R Q D P G Q G L R L I Y Y S Q I V N D F Q K G
61 D I A E G Y S V S R E K K E S F P L T V T S A Q K N P T A F Y L C A S S S R S S Y E Q Y F G P G T R L T V T E D L K N V
E D L N K V
1
121 F P P E V A V F E P S E A E I S H T Q K A T L V C L A T G F Y P D H V E L S W W V N G K E V H S G V C T D P Q P L K E Q
F P P E V A V F E P S E A E I S H T Q K A T L V C L A T G F F P D H V E L S W W V N G K E V H S G V S T D P Q P L K E Q
181 P A L N D S R Y S L S S R L R V S A T F W Q N P R N H F R C Q V Q F Y G L S E N D E W T Q D R A K P V T Q I V S A E A W
P A L N D S R Y C L S S R L R V S A T F W Q N P R N H F R C Q V Q F Y G L S E N D E W T Q D R A K P V T Q I V S A E A W
241 G R A D
G R A D
130

Regions

UniProt

P01850
1 .. 130 > 115 .. 244 (PDB)

Pfam

PF07654
129 .. 222 (PDB)

Chain C: ENTEROTOXIN H

1 E D L H D K S E L T D L A L A N A Y G Q Y N H P F I K E N I K S D E I S G E K D L I F R N Q G D S G N D L R V K F A T A
E D L H D K S E L T D L A L A N A Y G Q Y N H P F I K E N I K S D E I S G E K D L I F R N Q G D S G N D L R V K F A T A
25
61 D L A Q K F K N K N V D I Y G A S F Y Y K C E K I S E N I S E C L Y G G T T L N S E K L A Q E R V I G A N V W V D G I Q
D L A Q K F K N K N V D I Y G A S F Y Y K C E K I S E N I S E C L Y G G T T L N S E K L A Q E R V I G A N V W V D G I Q
121 K E T E L I R T N K K N V T L Q E L D I K I R K I L S D K Y K I Y Y K D S E I S K G L I E F D M K T P R D Y S F D I Y D
K E T E L I R T N K K N V T L Q E L D I K I R K I L S D K Y K I Y Y K D S E I S K G L I E F D M K T P R D Y S F D I Y D
181 L K G E N D Y E I D K I Y E D N K T L K S D D I S H I D V N L Y T K K K V
L K G E N D Y E I D K I Y E D N K T L K S D D I S H I D V N L Y T K K K V
241

Regions

UniProt

P0A0M0
25 .. 241 > 1 .. 217 (PDB)

Pfam

PF01123
13 .. 100 (PDB)
PF02876
108 .. 212 (PDB)

Chain D: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN, DR ALPHA CHAIN,

1 I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
26
61 A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
121 W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
181 D A
D A
207

Regions

UniProt

P01903
26 .. 207 > 1 .. 182 (PDB)

Pfam

PF00993
4 .. 84 (PDB)
PF07654
93 .. 175 (PDB)

Chain E: MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS II BETA CHAIN

1 G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
30
61 W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
121 G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
181 T S P L T V E W R A
T S P L T V E W R A
219

Regions

UniProt

P04229
30 .. 219 > 1 .. 190 (PDB)

Pfam

PF00969
13 .. 87 (PDB)
PF07654
103 .. 185 (PDB)

Chain F: HEMAGGLUTININ

1 P K Y V K Q N T L K L A T
P K Y V K Q N T L K L A T
327 339

Regions

UniProt

Q03909
327 .. 339 > 1 .. 13 (PDB)

Pfam

PF00509
1 .. 13 (PDB)
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