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PDBe Entry: 2r93
Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop
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| Summary |  |
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| Header |
Transferase/RNA
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| Method | X-RAY DIFFRACTION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experiment | Resolution: 4.0 Å, R-factor: 21.65%, Free R-factor: 24.14%, Spacegroup: C 2 2 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Released | 27/11/2007, deposition: 12/09/2007, last revision: 24/02/2009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Authors |
Lehmann, E.; Brueckner, F.; Cramer, P.
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| Primary citation |
Molecular basis of RNA-dependent RNA polymerase II activity. NATURE vol:450, pag:445-449 (2007) [PubMed ID 18004386 ]
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| Keywords |
TRANSFERASE/DNA/RNA, DNA-BINDING, PHOSPHORYLATION, RNA POLYMERASE II, METAL-BINDING, NUCLEAR PROTEIN, TRANSCRIPTION BUBBLE, ELONGATION COMPLEX, TRANSFERASE, TRANSCRIPTION, RNA-DEPENDENT, RNA-DEPENDENT RNA SYNTHESIS, RDRP, DDRP, RNA-BINDING, HEPATITIS DELTA VIRUS, HDV, DNA-directed RNA polymerase, Magnesium, Nucleotidyltransferase, Nucleus, Ubl conjugation, Zinc, Zinc-finger, Polymorphism, Cytoplasm, DNA damage, DNA repair, mRNA processing, Transferase/RNA COMPLEX
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| EC |
2.7.7.6 ExPASy BRENDA (A B)
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| Organism |
Saccharomyces cerevisiae(baker's yeast) 4932(A B C D E F G H I J K L)
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| UniProt |
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 (EC 2.7.7.6) (RNA polymerase II subunit B1) (RNA polymerase II subunit 1) (DNA-directed RNA polymerase III largest subunit) (B220) P04050 (A) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 (EC 2.7.7.6) (RNA polymerase II subunit 2) (DNA-directed RNA polymerase II 140 kDa polypeptide) (B150) P08518 (B)DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 (RNA polymerase II subunit B3) (RNA polymerase II subunit 3) (DNA-directed RNA polymerase II 45 kDa polypeptide) (B44.5) P16370 (C)DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 (RNA polymerase II subunit B4) (DNA-directed RNA polymerase II 32 kDa polypeptide) (B32) P20433 (D)DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 (RNA polymerases I, II, and III subunit ABC1) (DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide) (ABC27) P20434 (E)DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 (RNA polymerases I, II, and III subunit ABC2) (DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide) (ABC23) P20435 (F)DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 (RNA polymerase II subunit B7) (B16) P34087 (G)DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 (RNA polymerases I, II, and III subunit ABC3) (DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide) (ABC14.5) (ABC14.4) P20436 (H)DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 (RNA polymerase II subunit B9) (DNA-directed RNA polymerase II subunit 9) (DNA-directed RNA polymerase II 14.2 kDa polypeptide) (B12.6) P27999 (I)DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 (RNA polymerases I, II, and III subunit ABC5) (DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 8.3 kDa polypeptide) (ABC10-beta) (ABC8) P22139 (J)DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 (RNA polymerase II subunit B11) (DNA-directed RNA polymerase II 13.6 kDa polypeptide) (B13.6) P38902 (K)DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 (RNA polymerases I, II, and III subunit ABC4) (ABC10-alpha) P40422 (L)
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