spacer COMPLEX OF THE HUMAN MHC CLASS II GLYCOPROTEIN HLA-DR1 AND THE BACTERIAL SUPERANTIGEN SEB
UniProt sequence   UniProt   CATH   Pfam   SCOP   Secondary structure   UniProt features   FASTA string  

Chain A: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN

1 I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
26
61 A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
121 W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
181 D
D
206

Regions

UniProt

P01903
26 .. 206 > 1 .. 181 (PDB)

Pfam

PF00993
4 .. 84 (PDB)
PF07654
93 .. 175 (PDB)

Chain B: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN

1 G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
30
61 W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
121 G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
181 T S P L T V E W R A R S
T S P L T V E W R A R S
221

Regions

UniProt

P04229
30 .. 221 > 1 .. 192 (PDB)

Pfam

PF00969
13 .. 87 (PDB)
PF07654
103 .. 185 (PDB)

Chain C: ENDOGENOUS PEPTIDE MODEL, POLY-ALA

1 X X X X X X X X X X X X X

Regions

Chain D: ENTEROTOXIN TYPE B

1 S Q P D P K P D E L H K S S K F T G L M E N M K V L Y D D N H V S A I N V K S I D Q F L Y F D L I Y S I K D T K L G N Y
S Q P D P K P D E L H K S S K F T G L M E N M K V L Y D D N H V S A I N V K S I D Q F L Y F D L I Y S I K D T K L G N Y
29
61 D N V R V E F K N K D L A D K Y K D K Y V D V F G A N Y Y Y Q C Y F S K K T N D I N S H Q T D K R K T C M Y G G V T E H
D N V R V E F K N K D L A D K Y K D K Y V D V F G A N Y Y Y Q C Y F S K K T N D I N S H Q T D K R K T C M Y G G V T E H
121 N G N Q L D K Y R S I T V R V F E D G K N L L S F D V Q T N K K K V T A Q E L D Y L T R H Y L V K N K K L Y E F N N S P
N G N Q L D K Y R S I T V R V F E D G K N L L S F D V Q T N K K K V T A Q E L D Y L T R H Y L V K N K K L Y E F N N S P
181 Y E T G Y I K F I E N E N S F W Y D M M P A P G D K F D Q S K Y L M M Y N D N K M V D S K D V K I E V Y L T
Y E T G Y I K F I E N E N S F W Y D M M P A P G D K F D Q S K Y L M M Y N D N K M V D S K D V K I E V Y L T
262

Regions

UniProt

P01552
29 .. 262 > 2 .. 235 (PDB)

Pfam

PF01123
23 .. 121 (PDB)
PF02876
130 .. 235 (PDB)

Chain E: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN

1 I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
I K E E H V I I Q A E F Y L N P D Q S G E F M F D F D G D E I F H V D M A K K E T V W R L E E F G R F A S F E A Q G A L
26
61 A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
A N I A V D K A N L E I M T K R S N Y T P I T N V P P E V T V L T N S P V E L R E P N V L I C F I D K F T P P V V N V T
121 W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
W L R N G K P V T T G V S E T V F L P R E D H L F R K F H Y L P F L P S T E D V Y D C R V E H W G L D E P L L K H W E F
181 D
D
206

Regions

UniProt

P01903
26 .. 206 > 1 .. 181 (PDB)

Pfam

PF00993
4 .. 84 (PDB)
PF07654
93 .. 175 (PDB)

Chain F: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN

1 G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
G D T R P R F L W Q L K F E C H F F N G T E R V R L L E R C I Y N Q E E S V R F D S D V G E Y R A V T E L G R P D A E Y
30
61 W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
W N S Q K D L L E Q R R A A V D T Y C R H N Y G V G E S F T V Q R R V E P K V T V Y P S K T Q P L Q H H N L L V C S V S
121 G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
G F Y P G S I E V R W F R N G Q E E K A G V V S T G L I Q N G D W T F Q T L V M L E T V P R S G E V Y T C Q V E H P S V
181 T S P L T V E W R A R S
T S P L T V E W R A R S
221

Regions

UniProt

P04229
30 .. 221 > 1 .. 192 (PDB)

Pfam

PF00969
13 .. 87 (PDB)
PF07654
103 .. 185 (PDB)

Chain G: ENDOGENOUS PEPTIDE MODEL, POLY-ALA

1 X X X X X X X X X X X X X

Regions

Chain H: ENTEROTOXIN TYPE B

1 S Q P D P K P D E L H K S S K F T G L M E N M K V L Y D D N H V S A I N V K S I D Q F L Y F D L I Y S I K D T K L G N Y
S Q P D P K P D E L H K S S K F T G L M E N M K V L Y D D N H V S A I N V K S I D Q F L Y F D L I Y S I K D T K L G N Y
29
61 D N V R V E F K N K D L A D K Y K D K Y V D V F G A N Y Y Y Q C Y F S K K T N D I N S H Q T D K R K T C M Y G G V T E H
D N V R V E F K N K D L A D K Y K D K Y V D V F G A N Y Y Y Q C Y F S K K T N D I N S H Q T D K R K T C M Y G G V T E H
121 N G N Q L D K Y R S I T V R V F E D G K N L L S F D V Q T N K K K V T A Q E L D Y L T R H Y L V K N K K L Y E F N N S P
N G N Q L D K Y R S I T V R V F E D G K N L L