PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   5   ABCDEa3   CDABE[NAG]3   1   –   yes    34940      15950      -63.6    2.5 
 2   3   ABCa2   ABE[NAG]2   2   2   yes    18760      7290      -25.3    17.3 
 2   ABa   CD[NAG]   3   1   yes    19290      5560      -32.7    37.2 
 3   3   ABCa3   CDA[NAG]3   4   –   yes    28320      8520      -32.8    1.6 
 2   AB   BE   5   –   yes    13100      960      -5.6    1.0 
 4   4   ABCDa3   CDAB[NAG]3   6   –   yes    35310      14140      -52.3    2.5 
 1   A   E   7   –   yes    1440      0      0.0    -0.0 
 5   4   ABCDa3   CDAE[NAG]3   8   –   yes    28900      9380      -38.5    1.5 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 6   3   ABCa2   ABE[NAG]2   2   2   yes    18760      7290      -25.3    17.3 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 1   Aa   C[NAG]   11   –   yes    12080      180      2.9    -0.0 
 7   3   ABCa3   CAE[NAG]3   12   –   yes    22150      3550      -2.8    0.4 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 8   2   ABa   CD[NAG]   3   1   yes    19290      5560      -32.7    37.2 
 2   ABa2   AB[NAG]2   13   –   yes    19130      5470      -14.0    25.1 
 1   A   E   7   –   yes    1440      0      0.0    -0.0 
 9   2   ABa   CD[NAG]   3   1   yes    19290      5560      -32.7    37.2 
 2   ABa2   AE[NAG]2   14   –   yes    12140      1290      1.2    9.2 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 10   2   AB   BE   5   –   yes    13100      960      -5.6    1.0 
 2   ABa3   CA[NAG]3   15   –   yes    21560      2690      2.8    0.4 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 11   2   ABa   CD[NAG]   3   1   yes    19290      5560      -32.7    37.2 
 1   Aa2   A[NAG]2   16   –   yes    11560      430      6.8    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   7   –   yes    1440      0      0.0    -0.0 
 12   2   ABa2   AB[NAG]2   13   –   yes    19130      5470      -14.0    25.1 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 1   Aa   C[NAG]   11   –   yes    12080      180      2.9    -0.0 
 1   A   E   7   –   yes    1440      0      0.0    -0.0 
 13   2   ABa2   AE[NAG]2   14   –   yes    12140      1290      1.2    9.2 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 1   Aa   C[NAG]   11   –   yes    12080      180      2.9    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 14   2   ABa3   CA[NAG]3   15   –   yes    21560      2690      2.8    0.4 
 1   A   D   10   –   yes    12590      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12610      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   7   –   yes    1440      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 15(*)   3   ABCa2   ABE[NAG]2   17   –   no    24090      1950      1.8    -1.6 
 2   ABa   CD[NAG]   3   1   yes    19290      5560      -32.7    37.2 
  
PQS sets 1 to 15 of total 17 

PDBe PISA v1.51 [22/09/2014]