PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   5   ABCDEa2   CDABE[NAG]2   1   1   yes    34750      14970      -68.3    10.8 
 2   3   ABCa2   ABE[NAG]2   2   3   yes    18940      6480      -26.8    10.9 
 2   AB   CD   3   2   yes    19000      5300      -31.5    38.4 
 3   4   ABCDa2   CDAB[NAG]2   4   –   yes    34620      14010      -57.7    6.1 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 4   4   ABCDa2   CDAE[NAG]2   6   –   yes    28710      8750      -42.1    5.1 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 5   4   ABCDa2   CABE[NAG]2   8   –   yes    28450      8570      -34.7    1.2 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 6   3   ABCa2   ABE[NAG]2   2   3   yes    18940      6480      -26.8    10.9 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   10   –   yes    11610      0      0.0    -0.0 
 7   3   ABCa2   CDA[NAG]2   11   –   yes    28090      8290      -36.4    5.3 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 8   3   ABCa2   CAE[NAG]2   12   –   yes    21790      2980      -7.4    1.8 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 9   3   ABCa2   CAB[NAG]2   13   –   yes    28330      7620      -24.1    1.2 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 10   2   AB   CD   3   2   yes    19000      5300      -31.5    38.4 
 2   ABa2   AB[NAG]2   14   –   yes    18810      5520      -16.2    25.8 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 11   2   AB   CD   3   2   yes    19000      5300      -31.5    38.4 
 1   Aa2   A[NAG]2   15   –   yes    11660      420      6.2    -0.0 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 12   2   ABa2   AB[NAG]2   14   –   yes    18810      5520      -16.2    25.8 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   10   –   yes    11610      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
 13   2   ABa2   AE[NAG]2   16   –   yes    12280      880      0.5    5.2 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   10   –   yes    11610      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 14   2   ABa2   CA[NAG]2   17   –   yes    21180      2510      -1.7    1.8 
 1   A   D   9   –   yes    12690      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   7   –   yes    12250      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    1080      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 15   3   ABCa2   CDA[NAG]2   11   –   yes    28090      8290      -36.4    5.3 
 2   AB   BE   18   –   no    12840      490      -4.9    -0.5 
  
PQS sets 1 to 15 of total 15 

PDBe PISA v1.50 [17/09/2014]