PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1(*)   6   A2B2C2   ADBECF   1   –   yes    33580      16970      -111.4    2.8 
 2   3   ABC   ABC   2   1   yes    17840      7330      -48.3    19.1 
 3   ABC   DEF   2   2   yes    17960      7410      -48.7    18.2 
 3(*)   4   A2B2   ADCF   3   –   yes    22690      4080      -41.0    3.4 
 1   A   B   4   –   yes    11870      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   4   –   yes    11910      0      0.0    -0.0 
 4   2   AB   DE   5   –   yes    18060      5000      -27.0    31.3 
 2   AB   AB   5   –   yes    17950      4890      -26.1    30.6 
 1   A   C   6   –   yes    2320      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   6   –   yes    2320      0      0.0    -0.0 
 5   2   AB   AC   7   –   yes    12150      1140      -13.0    7.5 
 2   AB   DF   7   –   yes    12330      1140      -12.8    6.9 
 1   A   B   4   –   yes    11870      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   4   –   yes    11910      0      0.0    -0.0 
 6   2   AB   BC   8   –   yes    12900      1290      -9.2    3.2 
 2   AB   EF   8   –   yes    12950      1270      -8.8    2.9 
 1   A   A   9   –   yes    10970      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   9   –   yes    11150      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 7(*)   3   ABC   ABF   10   –   no    19630      5530      -32.7    -1.6 
 3   ABC   DEC   10   –   no    19760      5620      -33.4    -1.8 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 8   3   ABC   AEF   11   –   no    23820      1370      -9.6    -11.4 
 2   AB   BC   8   –   yes    12900      1290      -9.2    3.2 
 1   A   D   9   –   yes    11150      0      0.0    -0.0 
 9(*)   2   AB   AF   12   –   no    12650      640      -6.6    -1.5 
 2   AB   DC   12   –   no    12850      620      -6.4    -1.6 
 1   A   B   4   –   yes    11870      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   4   –   yes    11910      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 9 of total 9 

PDBe PISA v1.50 [17/09/2014]