PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   24   A12B12a12b12c24
 
 A2B2C2D2E2F2M2N2O2P2Q2R2[FE]12[BME]12
 [DHB]24
 
 1   1   yes    160710      149590      -790.4    216.6 
 2(*)   4   A2B2a2b2c4   ADMP[FE]2[BME]2[DHB]4   2   –   yes    32320      19380      -122.7    20.7 
 4   A2B2a2b2c4   B2N2[FE]2[BME]2[DHB]4   2   –   yes    32390      19440      -119.6    20.4 
 4   A2B2a2b2c4   CFOR[FE]2[BME]2[DHB]4   2   –   yes    32330      19380      -122.1    20.3 
 4   A2B2a2b2c4   E2Q2[FE]2[BME]2[DHB]4   2   –   yes    32250      19410      -121.0    19.7 
 3   2   ABabc2   AM[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17820      8080      -46.5    49.0 
 2   ABabc2   DP[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17720      8080      -44.0    47.5 
 2   ABabc2   EQ[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17730      8100      -44.9    47.4 
 2   ABabc2   CO[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17770      8090      -45.8    46.8 
 2   ABabc2   FR[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17760      8090      -44.4    45.3 
 2   ABabc2   BN[FE][BME][DHB]2   3   –   yes    17810      8100      -43.8    45.3 
 4   12   A12a12b12c24   M2N2O2P2Q2R2[FE]12[BME]12[DHB]24   4   –   yes    123910      49120      -373.2    151.5 
 1   A   B   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   5   –   yes    11400      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   5   –   yes    11420      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   5   –   yes    11470      0      0.0    -0.0 
 5(*)   2   A2a2b2c4   MP[FE]2[BME]2[DHB]4   6   –   yes    23950      4880      -57.1    21.7 
 2   A2a2b2c4   N2[FE]2[BME]2[DHB]4   6   –   yes    24020      4910      -59.1    21.4 
 2   A2a2b2c4   OR[FE]2[BME]2[DHB]4   6   –   yes    23970      4870      -57.5    21.4 
 2   A2a2b2c4   Q2[FE]2[BME]2[DHB]4   6   –   yes    23880      4890      -56.2    20.7 
 1   A   E   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   5   –   yes    11420      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   5   –   yes    11470      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   5   –   yes    11400      0      0.0    -0.0 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 6(*)   2   A2   AB   7   –   no    22330      590      -0.8    -9.7 
 2   A2   CD   8   –   no    22480      380      0.1    -10.7 
 12   A12a12b12c24   M2N2O2P2Q2R2[FE]12[BME]12[DHB]24   4   –   yes    123910      49120      -373.2    151.5 
 1   A   F   5   –   yes    11420      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 7(*)   2   A2   AB   7   –   no    22330      590      -0.8    -9.7 
 12   A12a12b12c24   M2N2O2P2Q2R2[FE]12[BME]12[DHB]24   4   –   yes    123910      49120      -373.2    151.5 
 1   A   D   5   –   yes    11400      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   5   –   yes    11420      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 8(*)   2   A2   CD   8   –   no    22480      380      0.1    -10.7 
 12   A12a12b12c24   M2N2O2P2Q2R2[FE]12[BME]12[DHB]24   4   –   yes    123910      49120      -373.2    151.5 
 1   A   A   5   –   yes    11470      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   5   –   yes    11420      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   5   –   yes    11450      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 8 of total 8 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]