PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 3   A3   ABC   1   –   yes    18110      7050      -36.6    30.7 
 1   Aa3   D[NAG]3   2   –   yes    15800      660      9.0    -0.0 
 1   Aa3   E[NAG]3   2   –   yes    15790      670      9.3    -0.0 
 1   Aa3   F[NAG]3   2   –   yes    15770      660      9.0    -0.0 
 1   Aa3   J[NAG]3   2   –   yes    15780      670      9.1    -0.0 
 1   Aa3   K[NAG]3   2   –   yes    15770      680      9.3    -0.0 
 1   Aa3   L[NAG]3   2   –   yes    15770      670      9.4    -0.0 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 2(*)   5   A5a15   DEFJK[NAG]15   3   –   no    75590      6660      46.3    -44.9 
 3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 3   A3   ABC   1   –   yes    18110      7050      -36.6    30.7 
 1   Aa3   L[NAG]3   2   –   yes    15770      670      9.4    -0.0 
 3(*)   4   A3Ba3   ABCL[NAG]3   4   –   no    33580      8040      -26.1    -12.9 
 4   A4a12   DEFK[NAG]12   5   –   no    61160      4650      31.8    -32.2 
 3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 1   Aa3   J[NAG]3   2   –   yes    15780      670      9.1    -0.0 
 4(*)   4   A4a12   DEFK[NAG]12   5   –   no    61160      4650      31.8    -32.2 
 3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 3   A3   ABC   1   –   yes    18110      7050      -36.6    30.7 
 1   Aa3   J[NAG]3   2   –   yes    15780      670      9.1    -0.0 
 1   Aa3   L[NAG]3   2   –   yes    15770      670      9.4    -0.0 
 5(*)   3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 3   A3   ABC   1   –   yes    18110      7050      -36.6    30.7 
 3   A3a9   DFK[NAG]9   6   –   no    45840      3510      23.2    -19.4 
 1   Aa3   E[NAG]3   2   –   yes    15790      670      9.3    -0.0 
 1   Aa3   J[NAG]3   2   –   yes    15780      670      9.1    -0.0 
 1   Aa3   L[NAG]3   2   –   yes    15770      670      9.4    -0.0 
 6   3   A3   GHI   1   –   yes    18130      7030      -36.6    30.7 
 3   A3   ABC   1   –   yes    18110      7050      -36.6    30.7 
 2   A2a6   DK[NAG]6   7   –   no    30970      1940      16.0    -10.3 
 1   Aa3   E[NAG]3   2   –   yes    15790      670      9.3    -0.0 
 1   Aa3   F[NAG]3   2   –   yes    15770      660      9.0    -0.0 
 1   Aa3   J[NAG]3   2   –   yes    15780      670      9.1    -0.0 
 1   Aa3   L[NAG]3   2   –   yes    15770      670      9.4    -0.0 
  
PQS sets 1 to 6 of total 6 

PDBe PISA v1.50 [17/09/2014]