PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   6   A6a6b2   A2B2C2[GOL]6[EDO]2   1   2   yes    49560      38920      -261.2    111.4 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 2   6   A6a2b6c2d2   A2B2C2[ZN]2[GOL]6[SO4]2[EDO]2   1   2   yes    49210      39840      -381.9    91.2 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 3   6   A6a2b6c2d2   A2B2C2[ZN]2[GOL]6[SO4]2[EDO]2   1   2   yes    49140      39900      -376.2    88.2 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 4   6   A6a4b6c4d2   A2B2C2[ZN]4[GOL]6[SO4]4[EDO]2   1   2   yes    48790      40820      -496.8    88.2 
 5   6   A6a6b2   A2B2C2[GOL]6[EDO]2   3   –   yes    61020      27450      -189.1    0.6 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 6   6   A6a2b6c2d2   A2B2C2[ZN]2[GOL]6[SO4]2[EDO]2   3   –   yes    60670      28370      -309.8    0.6 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 7   6   A6a2b6c2d2   A2B2C2[ZN]2[GOL]6[SO4]2[EDO]2   3   –   yes    60610      28430      -304.1    0.6 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 8   6   A6a4b6c4d2   A2B2C2[ZN]4[GOL]6[SO4]4[EDO]2   3   –   yes    60260      29350      -424.7    0.6 
 9   3   A3a3b   ABC[GOL]3[EDO]   4   1   yes    31560      12680      -89.5    94.6 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 10   3   A3ab3cd   ABC[ZN][GOL]3[SO4][EDO]   4   1   yes    31380      13140      -149.8    45.6 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
 11   3   A3ab3cd   ABC[ZN][GOL]3[SO4][EDO]   4   1   yes    31350      13170      -146.9    44.1 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 12   3   A3a2b3c2d   ABC[ZN]2[GOL]3[SO4]2[EDO]   4   1   yes    31170      13630      -207.3    44.1 
 13(*)   2   A2a2b2   B2[GOL]2[EDO]2   5   –   yes    25450      4050      -12.0    18.7 
 2   A2a2   AC[GOL]2   5   –   yes    25620      3870      -12.2    13.2 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 14(*)   2   A2a2   C2[GOL]2   6   –   no    27980      1570      -11.4    -0.1 
 2   A2a2b   AB[GOL]2[EDO]   6   –   no    27730      1740      -6.0    -0.8 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    230      50      -13.9    -0.0 
 0   ab   [ZN][SO4]   2   –   yes    240      40      -11.5    -0.0 
  
PQS sets 1 to 14 of total 14 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]