PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1(*)   6   ABCDEFa4b   ABCDEF[GOL]4[NA]   1   –   yes    47720      14510      -88.6    13.5 
 2   3   ABC   DEF   2   –   yes    18250      7210      -38.9    13.5 
 2   ABa4   AB[GOL]4   3   –   yes    21150      5080      -29.4    32.7 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 3   3   ABC   DEF   2   –   yes    18250      7210      -38.9    13.5 
 1   Aa3   B[GOL]3   5   –   yes    13350      650      -0.6    -0.0 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 1   Aa   A[GOL]   6   –   yes    12090      150      -1.1    -0.0 
 4   2   ABa4   AB[GOL]4   3   –   yes    21150      5080      -29.4    32.7 
 2   AB   DE   7   –   yes    18590      4770      -25.0    27.5 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 1   A   F   8   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
 5   2   ABa4   AB[GOL]4   3   –   yes    21150      5080      -29.4    32.7 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 1   A   D   9   –   yes    11250      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   10   –   yes    12110      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   8   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
 6   2   AB   DE   7   –   yes    18590      4770      -25.0    27.5 
 1   Aa3   B[GOL]3   5   –   yes    13350      650      -0.6    -0.0 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 1   Aa   A[GOL]   6   –   yes    12090      150      -1.1    -0.0 
 1   A   F   8   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 7   4   ABCDa   CDEF[NA]   11   –   no    27140      8850      -54.7    -1.9 
 2   ABa4   AB[GOL]4   3   –   yes    21150      5080      -29.4    32.7 
 8   3   ABCa4b   ABC[GOL]4[NA]   12   –   no    30170      6600      -49.7    -1.7 
 3   ABC   DEF   2   –   yes    18250      7210      -38.9    13.5 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 9   4   A2B2a8   A2B2[GOL]8   13   –   no    41040      11440      -59.5    -11.3 
 3   ABC   DEF   2   –   yes    18250      7210      -38.9    13.5 
 1   Aa   C[NA]   4   –   yes    10400      130      -10.3    -0.0 
 10   2   ABab   AC[GOL][NA]   14   –   no    21190      1570      -22.1    -0.3 
 3   ABC   DEF   2   –   yes    18250      7210      -38.9    13.5 
 1   Aa3   B[GOL]3   5   –   yes    13350      650      -0.6    -0.0 
 11   5   ABCDEab   ACDEF[GOL][NA]   15   –   no    37920      10300      -66.5    -1.2 
 1   Aa3   B[GOL]3   5   –   yes    13350      650      -0.6    -0.0 
  
PQS sets 1 to 11 of total 11 

PDBe PISA v1.51 [22/09/2014]