PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   3   ABCa6b2c9def2
gh2ijkl 
 HLM[GOL]6[BCL]4[LDA]9[BPH]2[UQ2][PO4]
 [HTO]2[FE][U10][SPO]
 
 1   1   yes    28690      39770      -204.0    41.2 
 0   a   [CDL]   2   –   yes    1700      0      0.0    -0.0 
 2   3   ABCa6b2c9def2
gh2ijklm 
 HLM[GOL]6[BCL]4[LDA]9[BPH]2[UQ2][PO4]
 [HTO]2[FE][U10][SPO][CDL]
 
 1   1   yes    28580      41580      -218.5    10.3 
 3   2   ABa4b2c7def2g
h2ijkl 
 LM[GOL]4[BCL]4[LDA]7[BPH]2[UQ2][PO4]
 [HTO]2[FE][U10][SPO]
 
 3   –   yes    23330      29100      -173.6    109.9 
 1   Aa2b2   H[GOL]2[LDA]2   4   –   yes    15040      990      0.7    -0.0 
 0   a   [CDL]   2   –   yes    1700      0      0.0    -0.0 
 4   2   ABa3bc5defg   HM[GOL]3[BCL]2[LDA]5[BPH][U10][SPO]
 
 
 5   –   yes    29250      13560      -59.9    19.7 
 1   Aa3bc4defg2hi   L[GOL]3[BCL]2[LDA]4[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 6   –   yes    19640      6010      -30.9    -0.0 
 0   a   [CDL]   2   –   yes    1700      0      0.0    -0.0 
 5   2   ABa3bc5defgh   HM[GOL]3[BCL]2[LDA]5[BPH][U10][SPO]
 [CDL]
 
 5   –   yes    29350      15160      -74.9    10.0 
 1   Aa3bc4defg2hi   L[GOL]3[BCL]2[LDA]4[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 6   –   yes    19640      6010      -30.9    -0.0 
 6   2   ABa5bc6defg2hi
 
 HL[GOL]5[BCL]2[LDA]6[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 7   –   yes    31280      10400      -45.6    8.7 
 1   Aabc3defgh   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 [CDL]
 
 8   –   yes    21130      7350      -54.3    4.5 
 7   2   ABa5bc6defg2hi
 
 HL[GOL]5[BCL]2[LDA]6[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 7   –   yes    31280      10400      -45.6    8.7 
 1   Aabc3defg   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 
 
 8   –   yes    20480      6300      -44.8    -0.0 
 0   a   [CDL]   2   –   yes    1700      0      0.0    -0.0 
 8   2   ABa4b2c7def2g
h2ijklm 
 LM[GOL]4[BCL]4[LDA]7[BPH]2[UQ2][PO4]
 [HTO]2[FE][U10][SPO][CDL]
 
 3   –   yes    23760      30370      -182.4    4.7 
 1   Aa2b2   H[GOL]2[LDA]2   4   –   yes    15040      990      0.7    -0.0 
 9   1   Aa2b2c   H[GOL]2[LDA]2[CDL]   4   –   no    16200      1540      -4.9    -1.9 
 2   ABa4b2c7def2g
h2ijkl 
 LM[GOL]4[BCL]4[LDA]7[BPH]2[UQ2][PO4]
 [HTO]2[FE][U10][SPO]
 
 3   –   yes    23330      29100      -173.6    109.9 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 10   1   Aabc3defgh   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 [CDL]
 
 8   –   yes    21130      7350      -54.3    4.5 
 1   Aa3bc4defg2hi   L[GOL]3[BCL]2[LDA]4[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 6   –   yes    19640      6010      -30.9    -0.0 
 1   Aa2b2   H[GOL]2[LDA]2   4   –   yes    15040      990      0.7    -0.0 
 11   4   A2B2a10b2c12
d2e2f2g4h2i2
 
 H2L2[GOL]10[BCL]4[LDA]12[UQ2]2[PO4]2
 [HTO]4[FE]2[BPH]2
 
 9   –   no    61900      21460      -94.0    -11.9 
 1   Aabc3defgh   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 [CDL]
 
 8   –   yes    21130      7350      -54.3    4.5 
 12   2   ABa5bc6defg2hi
j 
 HL[GOL]5[BCL]2[LDA]6[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH][CDL]
 
 7   –   no    32210      11170      -50.5    -1.8 
 1   Aabc3defg   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 
 
 8   –   yes    20480      6300      -44.8    -0.0 
 13   1   Aa3bc4defg2hi   L[GOL]3[BCL]2[LDA]4[UQ2][PO4][HTO]2
 [FE][BPH]
 
 6   –   yes    19640      6010      -30.9    -0.0 
 1   Aabc3defg   M[GOL][BCL]2[LDA]3[BPH][U10][SPO]
 
 
 8   –   yes    20480      6300      -44.8    -0.0 
 1   Aa2b2c   H[GOL]2[LDA]2[CDL]   4   –   no    16200      1540      -4.9    -1.9 
  
PQS sets 1 to 13 of total 13 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]