PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   12   A6B6a6bc2d2   ACEGIKBDFHJL[RCO]6[GOL][ZN]2[SCN]2
 
 
 1   1   yes    12880      19890      -214.8    113.4 
 2   4   A2B2a2   AIBJ[RCO]2   2   –   yes    6740      4170      -30.4    30.6 
 4   A2B2a2   EKFL[RCO]2   2   –   yes    6640      3790      -32.4    29.5 
 4   A2B2a2b   CGDH[RCO]2[GOL]   2   –   yes    6670      4200      -30.1    29.1 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.7    -0.0 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.5    -0.0 
 3   2   ABa   AB[RCO]   4   –   yes    4110      1260      -12.8    16.6 
 2   ABab   GH[RCO][GOL]   4   –   yes    4200      1310      -12.3    15.9 
 2   ABa   EF[RCO]   4   –   yes    4180      1060      -11.7    15.1 
 2   ABa   KL[RCO]   4   –   yes    4100      1100      -12.4    15.0 
 2   ABa   IJ[RCO]   4   –   yes    4340      1200      -11.6    15.0 
 2   ABa   CD[RCO]   4   –   yes    4220      1140      -11.6    14.1 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.7    -0.0 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.5    -0.0 
 4   6   A6a6bc2d2   BDFHJL[RCO]6[GOL][ZN]2[SCN]2   5   –   yes    11120      9130      -125.6    24.2 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   6   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 1   A   I   6   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 5   3   A3a3bcd   HJL[RCO]3[GOL][ZN][SCN]   7   –   yes    8610      1690      -51.8    25.3 
 3   A3a3bc   BDF[RCO]3[ZN][SCN]   7   –   yes    8700      1250      -51.1    23.8 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   6   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 1   A   I   6   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 6   2   A2a2   FL[RCO]2   8   –   yes    4750      1520      -8.7    3.2 
 2   A2a2b   DH[RCO]2[GOL]   8   –   yes    4920      1790      -7.1    3.1 
 2   A2a2   BJ[RCO]2   8   –   yes    5040      1670      -6.7    1.7 
 1   A   G   6   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 1   A   I   6   –   yes    2100      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.7    -0.0 
 0   ab   [ZN][SCN]   3   –   yes    240      40      -7.5    -0.0 
  
The following quaternary structure falls into a grey region of complex formation criteria.
This structure may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 7(*)   12   A6B6a6bc2d2   ACEGIKBDFHJL[RCO]6[GOL][ZN]2[SCN]2
 
 
 9   –   no    19870      12900      -196.5    -0.5 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 8(*)   4   AB3a3bc   IBDF[RCO]3[ZN][SCN]   10   –   no    9850      2200      -55.0    -1.3 
 2   A2   G2   11   –   no    3820      310      -3.1    -4.3 
 3   A3a3bcd   HJL[RCO]3[GOL][ZN][SCN]   7   –   yes    8610      1690      -51.8    25.3 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 9(*)   4   AB3a3bc   IBDF[RCO]3[ZN][SCN]   10   –   no    9850      2200      -55.0    -1.3 
 3   A3a3bcd   HJL[RCO]3[GOL][ZN][SCN]   7   –   yes    8610      1690      -51.8    25.3 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   6   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 10(*)   7   AB6a6bc2d2   IBDFHJL[RCO]6[GOL][ZN]2[SCN]2   12   –   no    12280      10070      -129.5    -1.1 
 1   A   C   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   E   6   –   yes    2110      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   6   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    2090      0      0.0    -0.0 
 1   A   K   6   –   yes    2060      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 10 of total 10 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]