PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1(*)   16   A4B4C4D4a8   A2E2B2F2D2H2C2G2[PO4]8   1   3   yes    103020      49680      -267.1    0.8 
 2   4   ABCDa2   EFHG[PO4]2   2   2   yes    28050      10060      -67.2    22.6 
 4   ABCDa2   ABDC[PO4]2   2   1   yes    28050      10190      -57.3    20.1 
 3(*)   12   A4B4C4a8   A2E2B2F2D2H2[PO4]8   3   –   yes    107360      37480      -197.7    0.8 
 1   A   C   4   –   yes    1990      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1930      0      0.0    -0.0 
 4   3   ABCa   EFG[PO4]   5   –   yes    18220      7410      -46.4    40.8 
 3   ABCa   ABC[PO4]   5   –   yes    18120      7540      -39.1    35.2 
 1   Aa   D[PO4]   6   –   yes    12400      180      -5.0    -0.0 
 1   Aa   H[PO4]   6   –   yes    12290      180      -5.1    -0.0 
 5   2   ABa   EF[PO4]   7   –   yes    18740      4960      -29.1    28.8 
 2   ABa   AB[PO4]   7   –   yes    18670      5000      -24.9    25.7 
 1   Aa   D[PO4]   6   –   yes    12400      180      -5.0    -0.0 
 1   Aa   H[PO4]   6   –   yes    12290      180      -5.1    -0.0 
 1   A   C   4   –   yes    1990      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1930      0      0.0    -0.0 
 6   2   ABa   AC[PO4]   8   –   yes    12200      1400      -11.9    7.1 
 2   ABa   EG[PO4]   8   –   yes    12260      1300      -13.0    5.9 
 1   A   B   9   –   yes    12060      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   9   –   yes    12080      0      0.0    -0.0 
 1   Aa   D[PO4]   6   –   yes    12400      180      -5.0    -0.0 
 1   Aa   H[PO4]   6   –   yes    12290      180      -5.1    -0.0 
 7   2   ABa2   EH[PO4]2   10   –   yes    22210      1900      -21.8    5.3 
 2   ABa2   AD[PO4]2   10   –   yes    22280      1910      -19.1    3.3 
 1   A   B   9   –   yes    12060      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   9   –   yes    12080      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   4   –   yes    1990      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1930      0      0.0    -0.0 
 8   2   AB   FG   11   –   yes    12730      1280      -8.7    4.1 
 2   AB   BC   11   –   yes    12810      1240      -5.8    1.5 
 1   Aa   E[PO4]   12   –   yes    11500      120      -4.3    -0.0 
 1   Aa   A[PO4]   12   –   yes    11510      100      -3.4    -0.0 
 1   Aa   D[PO4]   6   –   yes    12400      180      -5.0    -0.0 
 1   Aa   H[PO4]   6   –   yes    12290      180      -5.1    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 9(*)   8   A4B4a8   A2E2D2H2[PO4]8   13   –   no    81470      15110      -103.2    -0.8 
 2   AB   FG   11   –   yes    12730      1280      -8.7    4.1 
 2   AB   BC   11   –   yes    12810      1240      -5.8    1.5 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 10(*)   12   A4B4C4a8   A2E2D2H2C2G2[PO4]8   14   –   no    82170      22260      -143.7    -1.0 
 1   A   B   9   –   yes    12060      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   9   –   yes    12080      0      0.0    -0.0 
 11(*)   8   A4B4a8   A2E2D2H2[PO4]8   13   –   no    81470      15110      -103.2    -0.8 
 1   A   B   9   –   yes    12060      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   9   –   yes    12080      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   4   –   yes    1990      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1930      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 11 of total 11 

PDBe PISA v1.51 [22/09/2014]