PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   3   ABC   EFG   1   –   yes    17790      6800      -35.0    9.4 
 3   ABC   ABC   1   –   yes    17780      6750      -34.7    9.3 
 1   A   D   2   –   yes    10670      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 2   2   AB   EF   3   –   yes    18150      4980      -25.4    29.6 
 2   AB   AB   3   –   yes    18140      4920      -25.2    29.5 
 1   A   D   2   –   yes    10670      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   4   –   yes    1460      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1470      0      0.0    -0.0 
 3   2   AB   FG   5   –   yes    12460      900      -5.9    1.4 
 2   AB   BC   5   –   yes    12410      900      -5.8    1.3 
 1   A   E   6   –   yes    11240      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    11220      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   2   –   yes    10670      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 4   2   AB   AC   7   –   yes    11760      920      -3.7    1.0 
 2   AB   EG   7   –   yes    11780      920      -3.6    0.9 
 1   A   B   8   –   yes    11850      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   8   –   yes    11890      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   2   –   yes    10670      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 5   4   ABCD   EFHG   9   –   no    27120      8120      -40.9    -1.8 
 4   ABCD   ABDC   9   –   no    27110      8080      -40.6    -1.8 
 6   2   AB   EH   10   –   no    20570      1320      -5.9    -1.1 
 2   AB   AD   10   –   no    20550      1330      -5.9    -1.1 
 2   AB   FG   5   –   yes    12460      900      -5.9    1.4 
 2   AB   BC   5   –   yes    12410      900      -5.8    1.3 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 7(*)   5   AB2CD   ABFDC   11   –   no    44860      2220      -9.3    -29.7 
 2   AB   EG   7   –   yes    11780      920      -3.6    0.9 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 8(*)   4   ABCD   ABDC   12   –   no    27990      7210      -37.4    -8.9 
 3   ABC   EFG   1   –   yes    17790      6800      -35.0    9.4 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 9(*)   4   ABCD   EFDG   13   –   no    27580      7680      -36.1    -9.7 
 3   ABC   ABC   1   –   yes    17780      6750      -34.7    9.3 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 10(*)   3   A2B   BFD   14   –   no    33320      1090      -3.7    -18.6 
 2   AB   AC   7   –   yes    11760      920      -3.7    1.0 
 2   AB   EG   7   –   yes    11780      920      -3.6    0.9 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 11(*)   2   AB   AC   7   –   yes    11760      920      -3.7    1.0 
 2   AB   EG   7   –   yes    11780      920      -3.6    0.9 
 2   AB   BD   15   –   no    22060      460      -2.6    -8.5 
 1   A   F   8   –   yes    11890      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    10650      0      0.0    -0.0 
 12   3   ABC   EFH   16   –   no    27480      6300      -31.3    -1.7 
 3   ABC   ABD   16   –   no    27480      6260      -31.1    -1.7 
 1   A   C   4   –   yes    1460      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1470      0      0.0    -0.0 
 13   2   AB   EH   10   –   no    20570      1320      -5.9    -1.1 
 2   AB   AD   10   –   no    20550      1330      -5.9    -1.1 
 1   A   B   8   –   yes    11850      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   8   –   yes    11890      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   4   –   yes    1460      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   4   –   yes    1470      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 13 of total 13 

PDBe PISA v1.48 [24/10/2013]