PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   4   AB2Cab   ACDE[MN][112]   1   –   yes    21970      5770      -51.3    0.8 
 2   ABab   BF[MN][112]   2   –   yes    14180      2770      -22.6    14.1 
 2   4   AB2Cab   BCDF[MN][112]   3   –   yes    22020      5620      -53.0    0.8 
 2   ABab   AE[MN][112]   2   –   yes    14180      2880      -21.5    13.3 
 3   3   ABCab   BCF[MN][112]   4   –   yes    18640      3630      -26.7    0.5 
 3   ABCab   ADE[MN][112]   5   –   yes    18690      3730      -24.8    0.3 
 4   2   A2   CD   6   –   yes    8830      1860      -25.3    15.7 
 2   ABab   BF[MN][112]   2   –   yes    14180      2770      -22.6    14.1 
 2   ABab   AE[MN][112]   2   –   yes    14180      2880      -21.5    13.3 
 5   3   ABCab   BCF[MN][112]   4   –   yes    18640      3630      -26.7    0.5 
 2   ABab   AE[MN][112]   2   –   yes    14180      2880      -21.5    13.3 
 1   A   D   7   –   yes    5370      0      0.0    -0.0 
 6   2   ABab   BF[MN][112]   2   –   yes    14180      2770      -22.6    14.1 
 2   ABab   AE[MN][112]   2   –   yes    14180      2880      -21.5    13.3 
 1   A   C   7   –   yes    5320      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   7   –   yes    5370      0      0.0    -0.0 
 7   2   AB   BC   8   –   yes    18920      860      -4.1    0.5 
 2   AB   AD   9   –   yes    19000      860      -3.3    0.3 
 1   Aab   E[MN][112]   10   –   yes    2240      320      -6.5    -0.0 
 1   Aab   F[MN][112]   10   –   yes    2160      330      -6.7    -0.0 
 8   2   A2   CD   6   –   yes    8830      1860      -25.3    15.7 
 1   A   B   11   –   yes    14460      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   11   –   yes    14490      0      0.0    -0.0 
 1   Aab   E[MN][112]   10   –   yes    2240      320      -6.5    -0.0 
 1   Aab   F[MN][112]   10   –   yes    2160      330      -6.7    -0.0 
 9   2   AB   BC   8   –   yes    18920      860      -4.1    0.5 
 1   A   A   11   –   yes    14490      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   7   –   yes    5370      0      0.0    -0.0 
 1   Aab   E[MN][112]   10   –   yes    2240      320      -6.5    -0.0 
 1   Aab   F[MN][112]   10   –   yes    2160      330      -6.7    -0.0 
 10   2   AB   AD   9   –   yes    19000      860      -3.3    0.3 
 1   A   B   11   –   yes    14460      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   7   –   yes    5320      0      0.0    -0.0 
 1   Aab   E[MN][112]   10   –   yes    2240      320      -6.5    -0.0 
 1   Aab   F[MN][112]   10   –   yes    2160      330      -6.7    -0.0 
  
The following quaternary structure falls into a grey region of complex formation criteria.
This structure may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 11   6   A2B2C2a2b2   ABCDEF[MN]2[112]2   12   1   no    35160      9540      -79.0    -1.2 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 12(*)   3   ABCab   BCF[MN][112]   13   –   no    20810      1460      -11.9    -6.7 
 2   AB   AD   9   –   yes    19000      860      -3.3    0.3 
 1   Aab   E[MN][112]   10   –   yes    2240      320      -6.5    -0.0 
  
PQS sets 1 to 12 of total 12 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]