PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   3   ABCa2b2   DEF[NAG]2[CA]2   1   –   yes    27540      9130      -76.4    45.8 
 3   ABCa2b3   ABC[NAG]2[CA]3   1   –   yes    27430      8880      -89.3    41.1 
 1   A   G   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 2   2   ABa2b   AB[NAG]2[CA]   3   –   yes    17840      3730      -32.5    24.2 
 2   ABa2b   DE[NAG]2[CA]   3   –   yes    18140      3900      -29.4    23.0 
 1   Aa2   C[CA]2   4   –   yes    14570      180      -23.5    -0.0 
 1   Aa   F[CA]   4   –   yes    14540      90      -11.8    -0.0 
 1   A   G   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 3   2   ABa2b2   EF[NAG]2[CA]2   5   –   yes    27000      4140      -41.0    21.6 
 2   ABa2b3   BC[NAG]2[CA]3   5   –   yes    26730      4250      -52.8    20.8 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 4   2   ABa   DF[CA]   7   –   yes    18560      1590      -25.6    11.9 
 2   ABa2   AC[CA]2   7   –   yes    18580      1490      -34.9    9.5 
 1   Aa2b   B[NAG]2[CA]   8   –   yes    15820      420      -7.4    -0.0 
 1   Aa2b   E[NAG]2[CA]   8   –   yes    16100      420      -7.8    -0.0 
 1   A   G   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 5   4   ABCDa2b3   ABCG[NAG]2[CA]3   9   1   no    27350      9600      -89.4    -0.7 
 4   ABCDa2b2   DEFH[NAG]2[CA]2   9   2   no    27430      9880      -76.6    -1.3 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 6   4   ABCDa2b3   ABCG[NAG]2[CA]3   9   1   no    27350      9600      -89.4    -0.7 
 3   ABCa2b2   DEF[NAG]2[CA]2   1   –   yes    27540      9130      -76.4    45.8 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 7   3   ABCa2b3   BCG[NAG]2[CA]3   10   –   no    26650      4980      -53.0    -0.7 
 2   ABa2b2   EF[NAG]2[CA]2   5   –   yes    27000      4140      -41.0    21.6 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 8   3   ABCa2b3   BCG[NAG]2[CA]3   10   –   no    26650      4980      -53.0    -0.7 
 3   ABCa2b2   EFH[NAG]2[CA]2   10   –   no    26890      4890      -41.3    -1.3 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 9   2   ABa2   CG[CA]2   11   –   no    14490      900      -23.6    -0.7 
 2   ABa   FH[CA]   11   –   no    14430      840      -12.1    -1.3 
 1   Aa2b   B[NAG]2[CA]   8   –   yes    15820      420      -7.4    -0.0 
 1   Aa2b   E[NAG]2[CA]   8   –   yes    16100      420      -7.8    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 10   2   ABa2   CG[CA]2   11   –   no    14490      900      -23.6    -0.7 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 1   Aa2b   B[NAG]2[CA]   8   –   yes    15820      420      -7.4    -0.0 
 1   Aa2b   E[NAG]2[CA]   8   –   yes    16100      420      -7.8    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   Aa   F[CA]   4   –   yes    14540      90      -11.8    -0.0 
 1   A   H   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
 11   2   ABa   FH[CA]   11   –   no    14430      840      -12.1    -1.3 
 1   A   D   6   –   yes    5520      0      0.0    -0.0 
 1   Aa2b   B[NAG]2[CA]   8   –   yes    15820      420      -7.4    -0.0 
 1   Aa2b   E[NAG]2[CA]   8   –   yes    16100      420      -7.8    -0.0 
 1   Aa2   C[CA]2   4   –   yes    14570      180      -23.5    -0.0 
 1   A   A   6   –   yes    5330      0      0.0    -0.0 
 1   A   G   2   –   yes    640      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 11 of total 11 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]