PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1(*)   8   A2B2C2D2   C2A2B2D2   1   –   yes    46680      20160      -108.1    2.4 
 2   3   ABC   ABD   2   –   yes    18060      7380      -39.6    15.4 
 2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 3(*)   6   A2B2C2   C2A2B2   4   –   yes    47560      15120      -76.5    2.5 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 4   3   ABC   ABD   2   –   yes    18060      7380      -39.6    15.4 
 1   A   C   6   –   yes    7980      0      0.0    -0.0 
 5   2   AB   AB   7   –   yes    18500      4860      -23.8    28.5 
 2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 6   2   AB   AB   7   –   yes    18500      4860      -23.8    28.5 
 1   A   C   6   –   yes    7980      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 7   2   AB   AD   8   –   yes    12170      1250      -7.0    3.7 
 1   A   C   6   –   yes    7980      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12020      0      0.0    -0.0 
 8   2   AB   BD   10   –   yes    12830      1270      -8.8    3.6 
 2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 1   A   A   11   –   yes    11340      0      0.0    -0.0 
 9   2   AB   BD   10   –   yes    12830      1270      -8.8    3.6 
 1   A   A   11   –   yes    11340      0      0.0    -0.0 
 1   A   C   6   –   yes    7980      0      0.0    -0.0 
 10   2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 1   A   A   11   –   yes    11340      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   9   –   yes    12020      0      0.0    -0.0 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 11(*)   4   ABCD   CABD   12   –   no    24660      8750      -47.6    -0.7 
 12(*)   2   AB   CA   13   –   no    18220      1100      -6.7    -1.3 
 2   AB   BD   10   –   yes    12830      1270      -8.8    3.6 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 13   4   A2B2   A2B2   14   –   no    34770      11960      -47.8    -6.2 
 2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 14   4   A2B2   A2B2   15   –   no    36810      9920      -48.3    -13.1 
 2   A2   C2   3   –   yes    14170      1780      -8.1    0.5 
 1   A   D   5   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 15(*)   3   ABC   CAD   16   –   no    19040      2350      -13.7    -1.4 
 1   A   B   9   –   yes    12020      0      0.0    -0.0 
  
PQS sets 1 to 15 of total 16 

PDBe PISA v1.51 [22/09/2014]