PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   4   A2B2a4   ACBD[HEM]4   1   1   yes    24350      10960      -104.9    3.4 
 4   A2B2a4   EGFH[HEM]4   1   2   yes    24480      11460      -100.9    2.6 
 2   2   ABa2   EF[HEM]2   2   –   yes    13830      4000      -49.0    2.1 
 2   ABa2   CD[HEM]2   2   –   yes    13710      3890      -49.6    1.4 
 2   ABa2   GH[HEM]2   2   –   yes    14030      4070      -49.0    1.4 
 2   ABa2   AB[HEM]2   2   –   yes    13750      3960      -47.0    0.8 
  
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 3   4   A2B2a4   AGBH[HEM]4   3   –   no    26960      8860      -106.5    -0.1 
 4   A2B2a4   CEDF[HEM]4   3   –   yes    26430      9000      -108.2    1.3 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 4   3   AB2a3   CDF[HEM]3   4   –   yes    20970      5590      -76.4    0.0 
 3   AB2a3   GBH[HEM]3   5   –   no    21970      5050      -68.8    -9.3 
 1   Aa   E[HEM]   6   –   yes    7670      1190      -19.0    -0.0 
 1   Aa   A[HEM]   6   –   yes    7620      1180      -18.7    -0.0 
 5   3   AB2a3   CDF[HEM]3   4   –   yes    20970      5590      -76.4    0.0 
 2   A2a2   BH[HEM]2   7   –   no    15110      2900      -46.4    -1.3 
 1   Aa   E[HEM]   6   –   yes    7670      1190      -19.0    -0.0 
 1   Aa   G[HEM]   6   –   yes    7790      1220      -20.6    -0.0 
 1   Aa   A[HEM]   6   –   yes    7620      1180      -18.7    -0.0 
 6   2   A2a2   DF[HEM]2   7   –   no    14760      3110      -46.2    -0.2 
 2   A2a2   BH[HEM]2   7   –   no    15110      2900      -46.4    -1.3 
 1   Aa   E[HEM]   6   –   yes    7670      1190      -19.0    -0.0 
 1   Aa   G[HEM]   6   –   yes    7790      1220      -20.6    -0.0 
 1   Aa   C[HEM]   6   –   yes    7500      1190      -20.5    -0.0 
 1   Aa   A[HEM]   6   –   yes    7620      1180      -18.7    -0.0 
  
PQS sets 1 to 6 of total 6 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]