PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces has not revealed strong indications that the structures
A:, C:, B:, D:, [PBM]B:710and [PBM]D:720of 1efn
may form a complex in solution.
The following results show some quaternary structures that can be formed from symmetry and protein affinity considerations.
The following quaternary structures fall into a grey region of complex formation criteria.
These structures may or may not be stable in solution.
 help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   2   AB   AB   1   –   no    8500      1260      -5.1    -0.1 
 2   ABa2   CD[PBM]2   1   –   no    8620      1680      0.9    -0.8 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 2   2   ABa2   CD[PBM]2   1   –   no    8620      1680      0.9    -0.8 
 1   A   A   2   –   yes    3530      0      0.0    -0.0 
 1   A   B   3   –   yes    6230      0      0.0    -0.0 
 3   2   AB   AB   1   –   no    8500      1260      -5.1    -0.1 
 1   Aa   C[PBM]   2   –   yes    3850      110      1.8    -0.0 
 1   Aa   D[PBM]   3   –   yes    6130      210      3.2    -0.0 
  
PQS sets 1 to 3 of total 3 

PDBe PISA v1.51 [22/09/2014]