PISA Assembly List.


Analysis of the complex represented by the coordinate section only of the PDB entry. help
 
NOTE: In one or more solutions (PQS sets), not all chains appear in their original positions. Such sets are marked with asterisk (*) next to the set number.
Analysis of protein interfaces suggests that the following quaternary structures are stable in solution.  help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 1   6   A2B2C2a4b4   ADBECF[NAG]4[NDG]4   1   1   yes    34290      18650      -54.8    23.8 
 2   3   ABCa2b2   DEF[NAG]2[NDG]2   2   –   yes    18270      8130      -27.7    16.1 
 3   ABCa2b2   ABC[NAG]2[NDG]2   2   –   yes    18290      8260      -27.4    15.6 
 3   2   ABa2b2   AB[NAG]2[NDG]2   3   –   yes    18750      5710      -11.7    29.0 
 2   ABa2b2   DE[NAG]2[NDG]2   3   –   yes    18700      5620      -11.6    27.1 
 1   A   C   4   –   yes    2080      0      0.0    -0.0 
 1   A   F   4   –   yes    2070      0      0.0    -0.0 
 4   2   ABa2b   DF[NAG]2[NDG]   5   –   yes    12430      1830      1.1    4.4 
 2   ABa2b   AC[NAG]2[NDG]   5   –   yes    12410      1890      1.6    4.3 
 1   Aa   B[NDG]   6   –   yes    12050      210      3.3    -0.0 
 1   Aa   E[NDG]   6   –   yes    11920      220      3.8    -0.0 
 5   2   ABa   EF[NDG]   7   –   yes    12750      1460      -5.1    3.7 
 2   ABa   BC[NDG]   7   –   yes    12870      1470      -5.1    3.2 
 1   Aa2b   D[NAG]2[NDG]   8   –   yes    11620      570      8.4    -0.0 
 1   Aa2b   A[NAG]2[NDG]   8   –   yes    11610      600      8.9    -0.0 
  
The following sets of quaternary structures may be formed from crystallographic considerations. However they do not appear to be stable in solution. help
  
 PQS set   mm 
 Size 
 Formula   Composition   Id   Biomol 
 R350 
 Stable   Surface 
 area, sq. Å 
 Buried 
 area, sq. Å 
 ΔGint
 kcal/mol
 
 ΔGdiss
 kcal/mol
 
 NN   «» 
 6(*)   3   ABCa2b2   DEF[NAG]2[NDG]2   9   –   no    20560      5830      -13.2    -6.1 
 2   ABa2b2   AB[NAG]2[NDG]2   3   –   yes    18750      5710      -11.7    29.0 
 1   A   C   4   –   yes    2080      0      0.0    -0.0 
 7   3   ABCa2b2   DBF[NAG]2[NDG]2   10   –   no    23690      2820      2.7    -4.4 
 2   ABa2b   AC[NAG]2[NDG]   5   –   yes    12410      1890      1.6    4.3 
 1   Aa   E[NDG]   6   –   yes    11920      220      3.8    -0.0 
 8   3   ABCa2b2   DBC[NAG]2[NDG]2   11   –   no    23700      2820      1.6    -5.6 
 2   ABa   EF[NDG]   7   –   yes    12750      1460      -5.1    3.7 
 1   Aa2b   A[NAG]2[NDG]   8   –   yes    11610      600      8.9    -0.0 
  
PQS sets 1 to 8 of total 8 

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]