Homologous Superfamily

Structures: Aspartic peptidase domain superfamily (IPR021109)


The Protein Data Bank (PDB) is a repository for the 3-D structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids.

2qmp  4i8w  4y3m  2g26  3t1a  4rcd  5p16  3buh  2qi7  4x2l  3udy  3drs  4jpe  1apw  1gvv  1ebw  3lpj  5he7  1eag  3oxc  5p07  4dqc  2r38  3vcm  5p7p  2ze2  3tpp  5p0s  3o9b  1g35  5c24  5p0n  1kj7  3l5c  3ekx  2cem  1tl3  5kr1  1hte  3dlk  2azc  3pll  4y3w  1rt6  5p6e  4b1d  4zsp  4u7v  5p31  3er3  3klg  4amt  3sa5  1hnv  5p03  5b18  2iqg  5p80  5i3y  1eet  5p8r  3dok  5bry  1t05  2bkt  3vsw  4rw9  3jvy  3lp0  1uh8  4djw  5p7b  1ikx  4eqj  2aoh  2fvq  2xfj  1zbg  5p58  5p0p  3o9a  1d1u  5p1z  1ivp  5sy2  1hmv  3pwr  1a30  3k5f  2zjk  1k6p  4lp9  1qai  2fvs  2ph8  3qip  4lxa  2xfi  1az5  2p8h  3own  3liq  3sqf  5ezz  5hd0  3lzy  3sab  3g72  2qi0  3lal  3vfa  5oyt  5ozi  2g1n  2apr  1s1v  4yob  4y5l  3ohf  3zpu  2hb2  3igb  5p63  3ixj  1w51  5p4y  4hdp  2nph  5p8m  3ekv  3msl  4dfg  5p2d  1k2c  5p02  1vij  2fvr  3tl9  2wf2  3t3c  4bek  3vfb  5p6s  3b80  2wom  4h1e  2hb3  5oz1  4y3e  5p5j  2q55  5p1t  2zga  4m8x  2iku  5p0g  5p1s  4y3n  5p6p  5ozj  2wf4  3udk  4fm6  3pcw  4d85  5p28  1mt7  1c6z  4lc7  2xyf  3gi5  2cen  3ou1  1xl2  2qnp  3wb5  2bbb  2fjx  2qk5  6upj  5p5o  3r4b  5dgu  3zks  2avs  1siv  5p5q  2f3k  5p1v  2qzx  4hdf  1s6p  3mec  5p5t  3ndx  4fe6  1eby  1lv1  1d0e  1npa  4cpq  3cyx  1s1x  3nuo  1yg9  2bqv  4dju  5p1j  3vyf  4y35  3msj  1w5y  2avm  2bpv  2qu2  3zps  5p6g  3k4v  1u8g  5ozb  5p7q  3nu3  3qrv  1hys  5p0w  3s7l  3d1z  5p7a  1dif  5p8v  2pqz  4aa9  5p7t  3hbo  1meu  4djr  5p5c  5p3r  4y3y  2i4q  4gj9  5p6v  3t7p  1zsr  4qj7  4qj9  2vg5  1a8g  3pep  5ozt  3st5  1ec0  1e81  1hpv  1aaq  3o9h  1pso  5p72  2fs4  3kk1  1bxo  1lwc  2fnt  5p83  5p3c  4cms  5p8u  1z1r  4obj  1zap  1qs8  2aoc  1iiq  5p8g  4y5b  5i3v  5p8j  5p4m  4zpf  3sm2  5oz6  3g70  3v6d  4er1  4trz  5p50  5agz  3h0b  1ohr  3pvk  2bju  2fvp  5f01  5cym  3m8p  5p87  1w5v  3t19  1dpj  2qhc  1oew  3qaa  1mrx  3phv  1kjg  1qbu  5sxn  2q64  3tkg  1er8  5p0x  2p3d  3kle  5p5p  4kv8  4i11  5p30  5ozs  3d91  3nls  4djq  3liv  4gmi  2vj7  3rtm  1hvu  4gj7  3app  2o4n  2j9k  1m43  3oy4  1rt1  1npv  5ivs  5p5w  4we1  4lsl  5i70  3ebz  5c9f  1tkx  1ppl  3psy  2f3e  3so9  4ybf  3qrm  3utl  3fx5  1r0a  5p57  4pwd  5p5h  2o40  1har  4obd  4y4w  2wf3  2ieo  5fdl  2fmb  5p0q  3kf0  5oyy  3lzv  1t7j  1bwa  3d3t  1msm  4eyr  4ncg  1msn  1sgu  2p3a  5p5e  2ynf  4y4j  4j1f  4gj8  5p3x  5apr  4dg1  3mxe  3tlh  5cok  4bel  5p4b  2xye  2of0  3v4i  5oz8  4tvg  5p17  3pww  2qi1  5p14  2i4u  4f73  1w6i  1d4s  2cej  4y3x  4njs  1rq9  4yd6  4i8z  3vsx  3o9d  5p2f  3inh  4y43  1zp8  1hvi  2qmf  5clm  2ohu  1xs7  2o4l  2ohn  2j9j  2is0  4y3a  3kmy  1zj7  3l3a  3kk2  2r8n  3fkt  1ytg  2qu3  4hdb  5p12  1n49  2ohp  8hvp  2g1s  5p1q  4dqg  5dqc  1hsg  5oyu  4r91  1hvk  5p4s  1b6p  1ody  2er7  1s9g  3ixk  5p4r  3s45  2yni  2bpz  5i3u  2nmy  1upj  4flg  2qzw  2q15  4b0q  1d4y  5p65  3ru1  3dv5  4l6b  3c6u  5dgw  2idw  4exg  1hxb  5j2m  1hii  5p4u  3q4b  3oqk  2qi3  2fgu  4j5j  1mml  3lit  2aog  3kn0  4djp  3skf  2ohl  5hdv  3uqu  5p0h  2i4d  1flh  3jyt  4q1n  3fns  4fm8  3lhg  3is9  5he5  5cop  3pcz  2aqu  1odx  1hvh  4gjd  5k14  3zkq  5p4k  4i1c  2r3t  1fiv  5p6h  5hp1  3nuj  1tvr  5dq2  4f75  2zhr  4frk  5p1e  3sm1  2wjo  5p6o  5p79  4qj8  1xdh  2wec  5ozw  3dol  1b11  5oz4  5p3g  3tpr  3oud  5p38  5hdu  4zsr  5p64  3kyr  4r8y  3em3  1ebz  1fkn  3ecg  1vik  4yd7  2hiz  4rvj  5p1y  1fg6  1dp5  3lam  4h4o  3em4  3u6a  5p1g  5p3m  4kfb  3rfi  4i0i  4cpw  4fs4  2qhz  2qmg  5p5b  3pm4  3ine  1ls5  1rt5  1oex  5p1x  1c1b  3dm6  4fri  5p5u  2f81  4s1g  3o9i  3l5e  3oxv  5p4e  3t11  5i3w  2b8v  3k5d  3rsx  1xn2  2bks  1dtq  5p13  1fq8  7hvp  4he9  5p29  2ops  2qmd  2b6a  5p68  1hiv  5kr2  4zea  5p5x  5dpz  4fm7  4coe  5p51  1hxw  5he4  5p8e  1fg8  5p8f  2psu  2fgv  3pbz  2wez  2a1e  2wed  1qe1  2ykm  3tne  5dq5  1t6e  4q1w  4y5e  1k6v  5p2q  5p49  5oyx  5oz0  2hb4  3nwq  2pc0  4lhh  5p5f  1ec3  2ntr  1b6l  4ivt  1fff  5ozz  1mui  4lxk  1ida  1ec2  5p1i  4cpu  1q9p  4rw6  5p6c  1sdt  4y56  4k8s  3pwm  5ozm  4dv9  5p6b  4j0y  3liz  5kr8  2anl  3hvt  4i0h  5p1u  5dq4  3msk  2hnz  6apr  3ka2  4ify  4y3z  3ekt  3zl7  1hvl  5ezx  4dqh  5oz3  1rt3  3ok9  3liy  1wbk  3v81  5p3p  2ynh  2ph6  3ixo  4d89  5p3v  4djx  2oht  5p4o  3ots  2pym  3s2o  4gye  5p2z  2va7  4ye3  3ogp  4obk  3bxs  1met  3qvi  1ebk  4dpf  1zlf  3n4l  1fmu  2zjl  3dmj  4b05  5oyw  2qak  3zov  3lix  4h4m  4frs  1c70  3gi4  1me6  5p27  1g2k  5p59  1aid  5p7s  1hvr  4zsq  5p1k  2v13  4aa8  2qd7  1pro  1bim  2oah  5p1r  1bil  3ou3  2va6  4q0b  2qi4  5hct  3ig1  5p0b  3meg  5p7j  2avo  2b5j  3ndu  3pmu  5dr3  5ozn  5kos  5ivr  4ep3  5oz2  5kqf  5ie1  1hsi  1tv6  1wkr  4gj5  3el5  1jle  3b7v  1ff0  4phv  5fiv  5p2y  4obz  3el1  5p2l  3urj  4k9h  1a9m  3g6z  3buf  5p6x  4ll3  5p6r  4i0j  5dr4  2pk6  3dcr  1bv7  2ohr  3i0r  3o9c  3i25  5ozc  2pwr  5p2o  4fl8  5jfu  1lw2  3kmx  4mc6  1mes  3nu6  3i0s  1qbs  5p7d  3vuc  5p3w  3oqf  4ryg  5p0d  2jji  3wb4  3qro  2fle  1hpz  1xn3  5p75  2z4o  3di6  2rkg  4b70  3m9f  3uqr  2qci  3nwx  1klm  3ia9  4icl  1z1h  3dm2  3s85  5p47  4wy6  4u7q  3jw2  4yoa  2nmz  3vla  4y44  3c9x  3hzc  4nju  1fq5  3ndw  1ym2  3qn8  3u7s  5ozp  1fko  2hs1  4njt  4y4a  4ejk  2yng  4ivs  5p5m  5p2g  4i0z  5dr7  1lya  4njv  1ztt  2b8l  3r0w  5p3y  3d20  2g27  2g1o  2vkm  2o4k  5p8t  5hlf  5ozd  3ec0  2aid  3oad  1jlq  1nso  5d3g  3q3t  2p4j  1epl  2hm1  4y3r  4upj  2bb9  2zjm  5p7g  3e01  3tof  5p42  5p8a  2sam  3bgr  5p2s  5p7r  3bhe  4faf  4npt  5p00  4gjc  2b60  3gw5  5coo  1k2b  1rl8  1gno  5p5l  5p39  2hs2  4y4x  2wea  3d1y  3bug  2won  2fns  2az8  2igy  4id5  3sa8  4yct  2je4  4mfb  5p8h  3qo9  1tkz  4j55  4a6b  5oza  3em6  1lyw  4idk  5p2u  1ajv  5p15  2vnn  3uf3  4a6c  3o9e  1lf3  1c1c  5p4p  4hzt  3vlb  1tsu  2web  5p09  4obh  1s6q  4djo  3ogq  4tvh  3ekp  2wf0  5bs4  1mrw  3kfn  1t7i  1i6j  2qp8  2a4f  2wl0  3gi6  5p1m  2viy  3nxe  3uqx  1tqf  1bwb  4b3o  5hvp  1mvp  1od1  3pb5  4g1q  1rti  3jsm  5p7l  1z8c  5p86  5p62  3vv6  4j1e  3nxn  5p56  5p8c  2i4x  5p5s  3d1x  3sa3  2b7z  3vye  4y38  1ec1  2nxm  4hvp  1jkh  4qj2  4b78  1b6m  5p8d  4dvf  3qp0  1n4l  4o44  5ozr  3drp  5p7k  1t6g  3udp  2viz  4cku  3i7e  5p7f  4ehc  4fco  1f34  3slz  5p53  5p5a  1lf2  3gi0  4k4q  1zsf  1rtj  9hvp  5p8b  4dus  1qbr  1w50  5p6y  3s7m  4od9  1mpp  4pph  4zsm  4y3l  1dmp  3saa  4l1a  1mer  3vf7  4cpx  1ym4  3s53  3bvb  2zji  4b72  3ggv  5p34  3bc4  5p84  3oqa  1tcw  4j0t  3sa9  3o9l  2ohq  5er2  4z22  5p0y  3drr  5oyz  3kfp  1epq  1b6k  3inf  5p1w  4i10  2bpy  4azy  2fdd  2avv  3sa6  5p8i  3qbf  3pi5  3qlh  3ivh  4y4t  4y5g  3o9f  1tkt  5isk  4xx3  1rv7  3sac  1s1u  4cpt  5p1n  3cyw  4acu  4y4g  4y3j  4rvx  4cp7  5p7v  5ahb  2rmp  1w6h  3kfs  4y3t  4y3f  3uhl  5p1f  5p7u  1fmx  4r95  5p6m  1lwe  5p5k  2r5q  5p4c  5p2m  5ozq  2r43  5p4x  1d4h  3s54  2r2r  5p6z  4rz1  4ej8  2rkf  5p6k  5sz9  1bv9  1hni  5ozf  5p2a  4bfd  2qzk  3lpk  1m4h  3udq  5hdz  4fse  5hdx  4fsl  2rsp  2i4w  2i4v  4xxs  5c42  2v0z  2mip  1daz  1epm  3eky  2qnq  1suq  4y5m  1dlo  3mws  3upj  4rw4  2jxr  1kj4  4z50  5j2n  5p4i  2fiv  5ah7  4epj  4j0p  3mxd  3in4  3hau  3lp2  5ah6  5p76  5p7x  4y36  4yck  4jp9  2uy0  1lzq  1t7k  2fdp  4lbt  2b7f  4y41  5p66  4gid  2zjn  2xfk  4y3h  3lin  3tam  4y5k  5p4w  3udm  4q1y  5p4g  5p4v  3apr  3t7q  4y53  5p7i  5p2x  3kt2  5j2q  4b00  3q6y  1ytj  1fq4  1kzk  1hvj  2vie  1avf  5p3t  2uxz  5p7n  5p19  5p2h  5upj  1fq7  2h6t  4y48  2pwc  4zpe  4ape  5ah8  4ryc  5aha  2hc0  4qgi  4y3s  4j1c  1hih  5p77  4e43  1bqm  5p4f  5p1a  3lnk  3nu5  3vv7  3zkx  3udh  1hps  3kt5  5oyv  5p8k  3gga  3klh  4rvi  1kjh  4djv  1psn  5j25  4y5n  3dlg  5p43  3zlq  5p3k  1fgc  1ep4  2nr6  3veu  5i42  1jld  1tcx  1rt4  4mc9  4rgh  2ewy  2nxd  5p2w  3hd8  3el4  1e80  3l5f  1apt  3s43  2aof  3djk  5p85  5p60  2r9b  3dv1  5p8p  2zjh  4y54  4y3d  5p55  3hvg  2g24  5p2e  4i0g  1qdm  2ren  4auc  3fnt  4h3j  4b1c  5ozu  3ou4  5p3f  2er0  1k1t  5pep  4y4e  2r2t  3zki  2psv  4djy  3exo  2ze1  3th9  5p67  2zhv  3aup  1gvw  1odw  3dk1  2hah  2q3k  5jfp  2hpe  5cyq  5p1d  1yt9  2g22  3o9g  5p6t  4er4  5p0v  5p8l  4o4g  2g94  5p73  1sh9  5p2n  5p0m  1axa  3ouc  5p8o  1rev  3udj  5p5d  4y4u  4cpr  5p78  5p11  1d4i  3rtn  7upj  3jvw  3isn  3uqw  3pgi  2zd1  4i0f  5ivq  5p48  5p5z  5p40  4f76  1rpi  3nr6  2opp  4pep  1d4j  3i8w  2whh  2ban  5p7o  1ppm  2jys  2fxd  3sa7  1hpx  1hwr  3mee  3oot  3qvc  5p3s  5p33  1ize  2ykn  3oub  1qaj  1hsh  5p36  3bra  1epn  2r2s  5p6w  4ydg  3pbd  5is4  3r0y  3iaw  4r5p  2r5p  2pk5  1xl5  1d4k  1dtt  2nnk  3l5d  5p3l  3bxr  1cpi  4dpi  1bqn  1fk9  5p1b  1mt9  4j54  5hu1  2nxl  4k4r  3kdc  5p54  1fmb  4exh  1jla  4eq0  4fgx  4i0e  1fkp  2i1a  4pyv  3k5g  1s1w  1hbv  3t6i  5dr8  4r5n  3sa4  1uh9  2aoj  1hhp  4obf  5p32  4gja  5p3n  3lan  5p7y  1lee  3h5b  4yd4  1hqu  4y5c  1rne  2v12  2ien  1htr  4ke0  5p88  5p4n  1epp  2wf1  2qzl  3url  3zpt  5oz5  5p3j  2o4s  3lzu  3qpj  1gnn  4l7h  2iko  1izh  1gvu  5p2r  1npw  3aid  2er6  1sdu  4yd3  5ozk  3s56  5p37  2p83  1fqx  1lyb  5p6d  5p2v  1rt7  1jlc  5koq  1hos  1e5o  5p61  1heg  2g1r  3ufl  4lsn  5p3q  3cms  3oxw  3o99  4rw8  5p7w  4rce  4puo  4qj6  2zjj  1epr  4ig3  3zkm  5p0r  4zhr  3irx  2psg  2ohm  3r2f  2azb  4ke1  5p6n  1mt8  1mtr  5p69  3duy  3ucb  3nsh  5p5i  3kdb  3rth  1dw6  3udr  1bvg  4kse  5t4s  1hvs  4kup  4h3f  1kjf  1izi  3km4  5tol  4y57  3oty  5p0c  2o4p  5p20  1b6j  5htz  2jjj  5p71  3lpi  3l58  3ggu  1t3r  3rsv  4i2p  3vyd  1bai  4gb2  3ivi  4dqf  2q63  2r3w  4y45  1bdq  4d88  3dox  5p52  4y9w  5p7h  4gj6  5ozy  3prs  1yx9  5p24  5p3o  1rtd  1eed  4j0z  1yti  1qrp  2fjv  1nnd  5sy3  2hpf  1hef  5ivt  1c0t  5oz9  2q11  2hnd  5p4t  4ydf  3dck  2i0a  5p1p  5p89  3oq7  2v00  5ozg  2ic3  4rro  3pi0  2g20  4gzf  5p46  4ko0  1bbs  5p8q  4j0v  4er2  1j5o  4d8c  3hw1  2g69  3fsm  2v16  3n3i  4jpc  1ffi  3skg  1g0v  4y39  1sme  4y3p  1zpk  4y5a  5bwy  3lp1  2er9  5oz7  5p0z  1apv  4b77  5p3a  5p2b  3qrs  3vf3  4y50  4ep2  2opr  1n6q  5p82  5p6a  3q5h  5jod  5p70  5p3i  5p22  2ohk  2fde  5hco  5p81  4q5m  5p10  4y47  2iaj  5p74  2hny  5p7z  4y3q  1fej  4cps  3zmg  3bva  1ajx  2opq  5kr0  1jlg  1nh0  4ya8  4fiv  3wz8  5p7c  5p6i  3hdk  3ohh  4lxm  3emy  3ffi  5enk  2fjw  1gvt  5i3x  1sgz  2zhs  1hpo  3f9q  2g21  1idb  5p44  2b42  5p7e  4zls  5p8n  5oyq  1tl1  1b5f  3rvi  4fae  4j1h  1ppk  4y5p  1pfz  5p25  2aod  5f00  3dya  1xe5  1izd  2qd6  5p6u  3ith  2igx  1psa  4xkx  4i7f  1rt2  4y37  3pld  1uh7  2hmi  2fxe  3nbp  3hvp  4nkk  1g6l  2q54  3l59  5ozh  4i2q  1htg  2vj6  4hla  3el0  1mtb  5p3z  5hro  5p2c  3m8q  3fiv  4wy1  4y4d  1hrn  4ejl  1sdv  4obg  3pj6  1tw7  1jlf  1f7a  1sbg  4r93  5p26  2upj  2r2u  3cic  3qih  5p4l  5p5g  2il2  4j1i  1d4l  4r92  2qnn  2pyn  5p3u  1s9e  3r1g  5p2j  3oqd  4lap  3ggx  3fnu  1m0b  2az9  3tpj  5p5y  3i2l  5p0u  1lwf  5p0k  5p1c  3l5b  3in3  4qlh  1tzs  1a94  2p3c  4yd5  2f3f  1ivq  4try  3med  1t03  4ejd  3s8i  1lw0  1k6c  5p5v  3cid  2vg6  5dq1  2f80  1am5  1iky  1k6t  4rrn  1ikv  5p04  4gjb  1n5y  5p0t  4m8y  3c6t  5p0i  5p4a  1hvc  3k5c  4pzx  5c9b  3er5  5ah9  2z54  3k1w  3kk3  4mc2  1gnm  5p0o  5p05  1a8k  3klf  1czi  5p6l  3oxx  3sfc  5p5n  3ekw  5jg1  1htf  1ikw  5p6j  3fv3  3wsj  3cib  5p18  3kfr  3zkn  1epo  1e82  5p1o  5oys  2i0d  2rf2  3uri  3bgc  5p6q  4joo  5c25  3dle  1xe6  3qi1  5p2t  4ybi  5er1  5p41  3tog  4dqe  3wz7  4b1e  3t7x  4mc1  3u71  4i0d  4k4p  1bdl  5ozv  1c0u  2zht  5enm  5p4h  2zdz  3ckr  4ewo  4kb9  2vg7  2irz  3qs1  4l7j  4kko  2qi5  4f74  5p45  1jlb  2bpx  3kjv  2ohs  1lf4  5kqy  3ckp  4x7i  2aoi  2i5j  3el9  3uqp  4ycy  4z4x  4ifv  5p2k  1rth  4zip  1cms  5p4d  3l38  4xx4  4acx  5p08  1miq  2qi6  5p3b  5ozl  4j17  4pzw  5p3h  5p1h  4dh6  4y4z  4i12  1zpa  4dqb  4oc6  3lzs  5ozx  1vru  2qhy  5p1l  5p6f  3zkg  1ibq  4a4q  1sip  5ahc  5p3d  3udn  3psg  2q5k  1w5w  5p06  5isj  1ztw  2nnp  3tpl  3kdd  1j71  3tkw  3ooz  1ent  1vrt  5p35  2g1y  5p23  3oua  3nu4  5p0l  1w5x  2be2  3vv8  4ha5  1s1t  4h3i  3lak  1yth  4rw7  3i6o  3ufn  4bfb  4npu  3bgb  1tsq  3vf5  2pma  5p3e  4h3g  5kao  1c6y  3ndt  1hqe  4y3g  3toh  1wbm  4y4b  2asi  5oze  4pqu  1bxq  3a2o  3ind  2wkz  4z2z  2va5  2avq  4ig0  5p7m  5p0j  4heg  5p0f  3oag  1gvx  1ztz  5kqx  5j1e  2hvp  5con  3psu  2qd8  1bdr  4ze6  4d83  4wtu  5ozo  2vij  5dr0  6fiv  3haw  1sp5  4rcf  1fq6  2v11  5hbm  5p4z  4n00  2h6s  4u8w  4l7g  3wz6  4apr  3qbh  5kqz  4y51  5c9d  2p3b  4y58  3pmy  1sv5  2v10  4rld  5p01  5p8s  3ttp  3nyg  1apu  3ckt  4rrs  5p0a  4frj  1bve  5p5r  3hlo  3q70  3ekq  2vj9  2zhu  1qbt  1smr  5hu0  4trw  1fb7  2f8g  4di2  5p4j  2aoe  5p0e  2vnm  2rki  5p4q  2bpw  4zpg  4qja  5dr1  5oyr  4yhq  5j2p  1uwb  3spk  1k1u  5p2i  3nu9  3vg1  4q1x  1c6x  4j1k  4y6m  3kli 


CATH is a hierarchical classification of protein model structures. 


The Structural Classification of Proteins (SCOP) database is a largely manual classification of protein structural domains based on similarities of their amino acid sequences and three-dimensional structures.

b.50.1.3  a.64.1.2  e.8.1.2  b.50.1.2  b.50.1.1