Active Site

Structures: Aspartic peptidase, active site (IPR001969)


The Protein Data Bank (PDB) is a repository for the 3-D structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids.

4djo  4gzf  4jp9  2zjh  3t7x  2aoj  1b6l  4cpx  3ixo  1zap  3zks  2az9  4gja  4nju  2igy  4amt  2g1y  1w5x  3sa9  4azy  3pgi  4obd  3i2l  1sme  3rvi  4fgx  1izh  1hxw  2xfk  1mrx  3ebz  3rtm  3jvy  1hbv  1c6x  2fiv  5upj  2qmg  3qpj  3dcr  2bb9  4b1c  1ohr  4qj6  4kup  1bwb  1czi  1hsg  1ff0  3zov  2avo  1kjh  1mrw  3toh  2g24  1zsr  1fb7  1hrn  4j1f  1qbs  4dpf  3veu  3qrv  2p3c  1sdu  2v0z  2wf3  3duy  4ewo  4djv  1zpk  3ivh  3gi5  3ekw  1apt  1mpp  1ppl  3tlh  4d83  4m8y  4q1n  2whh  3ru1  3iaw  3vf3  2is0  4he9  4i1c  2r8n  2qk5  2hc0  2sam  4i0j  3ind  4j0p  4dqc  4apr  1ent  3skg  4f75  3ok9  1jld  2q3k  1fff  4b05  2g26  1q9p  4fl8  3rsv  4mc1  2wl0  3n4l  1bwa  3tne  1hiv  3kyr  3zkn  3uhl  2pqz  1ebw  1ec3  3bc4  2a1e  2ohs  1oex  2bkt  3bgc  3ufn  4j1h  2r5q  2irz  1er8  1yx9  3q6y  4b72  4i0h  1iiq  2o40  2bks  1oew  3udp  3tpp  3l38  3oxx  4k4p  3exo  3b7v  2il2  2avq  2b60  3uqx  4mc6  3bhe  2qu3  1fgc  4pyv  1z1r  3lzs  2aog  4j17  3qaa  3jw2  1b6m  4dqg  1cms  3pmu  1pro  3urj  1vik  5pep  3bxr  3vv7  1hvc  1k2b  4j1k  1ida  3s45  4h1e  2zhr  1fq8  4j1c  3nwq  1bil  3s56  3sa8  7hvp  3r4b  4ejk  2qd7  4dv9  3ekp  2az8  4hzt  3ekv  1ajx  1axa  2hs2  3th9  4fm8  2pk6  1heg  1rpi  3o9b  1zsf  4lbt  3oxw  5apr  2h6t  4h3j  2bpx  3zpu  2r5p  4r92  3pll  1w6h  2p8h  2pc0  4ivt  2jxr  4a6b  3oud  3ou4  3ots  1ajv  2zdz  3nuj  3gi6  4gj8  2v16  3sfc  1rne  1bbs  3q5h  3gw5  3qp0  3pbz  3url  2hah  5hvp  1xl5  3pmy  2j9j  3em6  1lf2  2r43  2i4q  1xl2  2vj6  3vsw  2nxl  3udk  3in3  1w50  4l7j  3sa3  3dck  2rsp  1bai  2wec  4ep2  3q4b  3h5b  3t3c  3tof  4gb2  4eyr  3uf3  3kn0  4l7h  3d20  1kjg  3vye  3o9h  4fae  1lee  1qrp  4cku  1k6c  3fiv  2fle  3zpt  3igb  2ren  1k6t  2f3k  1z8c  1xe5  4i0g  2g22  1apw  1yt9  4pzw  1hvk  1k1u  3l5f  2v13  3slz  3ia9  1htr  3n3i  3kfs  4i0d  4ejl  3pi5  4gj9  3ixk  3udj  4rcf  1sip  1kj4  2wkz  3in4  4b1d  3pvk  4joo  1eag  2fdd  1d4h  4j0y  2azb  2nmy  1ls5  3l58  2wf4  2hvp  1smr  3kdc  3qrs  3bra  2qi4  3buh  2hpf  2idw  3ggv  3qrm  2wf0  4ll3  3uqr  1d4l  2qi0  1m4h  2qzw  2qci  1w5w  1b6k  4k9h  3o99  3vsx  3q3t  3nu3  3ou3  3ooz  2pym  2a4f  3kdb  2vnm  4f76  1ztz  2g1n  2vnn  1sdv  3psg  1k1t  1d4i  3oag  3ggx  3oub  1apu  2jji  4j1i  2hs1  1uh8  1fg6  1tcw  4d85  1hte  4djp  1mt9  3zki  3ekq  1a8g  1ivq  2qmf  4auc  4i0z  1tcx  3o9l  3dv5  1psn  3ndx  4acx  4nkk  1e80  4b0q  3sa5  2fns  3bva  4obj  1kj7  4qj7  2zht  3oqk  4lxm  1mt7  2qzk  4b78  3kfp  2o4p  1gvt  1cpi  1xn2  2vj9  4gjc  4l7g  4lxa  3ufl  2psg  2aoh  3hdk  2wed  4exg  3qih  3vyd  2zhs  3ndw  4k4q  1me6  3cms  3inf  3lzy  3cid  1hsh  1dp5  3ggu  2r9b  3oq7  3g6z  4bel  2aoc  3lhg  2rmp  2mip  4dqh  1qbu  2q55  1tw7  3g70  3i8w  2qhc  1az5  4dqe  4j1e  1a30  2z54  4i12  4fse  4dju  4fiv  1hef  5fiv  1lv1  1xn3  3prs  2qi7  3kmx  4b70  2q5k  2ohr  5er1  1met  1nso  1ize  3zkm  4r93  3tpl  3pep  3phv  3jvw  3ckp  3s43  3wb5  2o4s  2o4k  1zlf  1sgu  1msm  1m0b  1hpo  1d4s  1a94  3nyg  2bbb  4r91  1eby  4gye  3nu5  3mxd  1vij  2v11  3oxv  3k5c  3cyw  2qd8  2i4v  3sm1  2psv  3hlo  4frk  1qdm  3oty  2avs  4hvp  4npu  1bxo  2er0  2g1r  2vij  4a6c  3inh  2viy  3r0w  1mer  3d3t  1fq4  1apv  3r2f  4qlh  1ec0  3c9x  3qi1  1bxq  2qd6  1k6p  3ckr  2va5  2ph6  2zjn  3u71  1epr  1mt8  1mvp  4djr  1epl  4dus  4exh  1hvh  1t7k  2wf2  4gj5  2nxd  2fs4  1hpx  1g2k  3liv  3er3  4dqb  2ze1  2qnn  3pm4  1dif  1bv7  1n49  1fqx  3r1g  2bpy  2zjk  2nnp  1fmx  1zbg  3nwx  1sh9  2p3a  1psa  3app  2f8g  4hdp  2bqv  2qnq  3kmy  4fsl  3l3a  2bpv  1c70  4obg  3lpi  4ivs  4hdf  2uxz  2fmb  3el5  3zmg  1epn  2va7  2nph  3er5  3ine  4bfb  1b6j  2iku  1sgz  3vf5  3vg1  4j54  4hdb  2q63  3a2o  3pwr  4cpw  4cpu  4cpq  4cp7  3zps  1w5v  1gnm  1htg  1htf  1hos  1ec1  1d4j  3ndt  3nu6  4di2  1c6y  1wkr  2hb2  1ym4  4dqf  4cpr  4rrs  3sa7  3hau  3vfa  3apr  3l5c  3vv8  3t6i  3vf7  1z1h  1yth  3l59  3pj6  3zkg  2ohn  3gi0  3bvb  4h3g  2fgv  2i4x  1tsu  3vyf  3mxe  2rkf  2f80  1lyw  3cic  4fm6  2qp8  4k4r  3nr6  3djk  3wb4  2azc  1tzs  1fq5  1gnn  1wbk  3upj  4fe6  3l5e  1npa  3l5d  1xdh  2g21  4rrn  3lzu  2b7f  4i11  2z4o  6fiv  1kzk  3zl7  4pep  2aoi  2aof  2aod  1hvj  1hpv  4kb9  3s53  2nnk  2r3w  2r3t  3d1y  2avv  2fgu  1dw6  3s7m  1xe6  4r8y  4jpc  1a8k  3tkg  3oqd  3oqa  2g1s  2apr  2qak  2xfj  4i0i  1tsq  4faf  4njv  2q54  4njt  1ebz  3dk1  3nls  2ien  1ibq  2cen  2p3d  3o9g  3cyx  1c6z  1sdt  4f74  3d1x  1idb  4rro  1j71  1k2c  2q11  3fsm  3rth  3sa6  1qbt  2v12  4qj9  2ntr  2f3f  3mim  3ohh  1fmu  4coe  2iqg  1mes  1bv9  3i7e  1b11  3pi0  1izi  3i6o  1dmp  4ep3  3msk  3ka2  1hvs  1daz  1tqf  3buf  3bug  4lhh  1w51  4tvh  3sa4  2i4u  3st5  3s54  3udy  4ha5  1zpa  3f9q  2pyn  3aid  4i0f  2b8l  1k6v  3kfn  4lxk  3o9c  4djq  3s2o  1gvv  4od9  3g72  3nuo  3lpk  2ohu  2b8v  2zhu  3oqf  3ucb  3tkw  3em4  2ph8  3lix  1msn  2xye  1lf4  1ppm  2pwc  4gjd  1uh7  3qbh  1pfz  1epm  1ym2  2zga  2xfi  2ewy  1wbm  4l1a  1fq7  1ec2  3o9f  2iko  1hih  3msj  3nu4  3k5f  1qbr  4phv  2qzx  1izd  5er2  4b77  4njs  3qro  3el1  3utl  4rce  2va6  2web  4d89  2g94  4dfg  3skf  3b80  1hvl  1fmb  2v00  1fq6  4k8s  1fkn  2ieo  1g35  3oua  4dh6  1w6i  2o4l  4f73  3k5g  1t7i  3k4v  1ody  3t11  2qmd  3dox  2vie  4j0z  2zjj  4qj8  2i0a  1hsi  3oad  3dm6  4obz  1miq  1rq9  2qmp  3udq  2zjm  3lzv  3t7q  3ec0  3msl  3pld  4ke1  4b1e  3zlq  2jjj  3tl9  3qbf  4b00  1hii  4x7i  2aid  2r38  1qs8  4gid  1rv7  2f3e  1f7a  3lnk  1rl8  3sac  1pso  3fv3  4jpe  1bve  1epo  4oc6  4epj  1hhp  4heg  3oot  1fej  4eq0  2g1o  2bju  3own  2ohq  2hpe  2q15  2fxd  3oxc  4fs4  2wf1  1aaq  4j0v  2v10  3ouc  2vkm  2bpz  4qja  1bdq  4lap  1d4k  4obk  2g69  2aoe  3q70  1gno  2j9k  4mc9  1npw  2wea  3uqw  2igx  1am5  1b5f  4aa8  3d91  1t7j  1dpj  3o9a  3hzc  3bgb  4h3f  1bim  3ogq  2avm  1fiv  2f81  3udn  4h3i  3s85  2qu2  1aid  3gi4  1lf3  3k1w  3uqu  2zji  4i0e  3kt5  1mtb  4aa9  1avf  3fx5  2ohl  4flg  3k5d  3ekt  3el0  1siv  3spk  1npv  2p3b  2pwr  2psu  3tpj  4m8x  4l6b  2cej  1nh0  4a4q  3nxe  1sp5  2cem  1hvi  3l5b  3ou1  3pb5  1uh9  1flh  4lp9  1epp  4cpt  3tpr  2i0d  1g0v  1m43  1zp8  2fde  1odw  1hxb  1hvr  3zkx  3zkq  1lyb  4r95  4ke0  4gmi  4j0t  4frs  4frj  4fri  4d88  4djy  4djw  2qzl  3s7l  3vv6  2ohp  2ohm  2ohk  2of0  2oah  2p83  2hiz  2fdp  3lpj  3udr  3udm  3udh  3u6a  3ohf  3ixj  3ivi  2wjo  2vj7  3h0b  4ejd  4ej8  2xyf  3kf0  4qgi  3ogp  6upj  1ivp  3sm2  3mws  2anl  2er7  2er6  2er9  1od1  1e82  3t7p  3pcw  3pww  3psy  3wsj  3lit  3lin  8hvp  1mtr  1kjf  4obf  2qi3  3bxs  3o9i  3nxn  3el4  3eky  3hbo  3m9f  1ytj  1yti  1bvg  3fkt  2aqu  4gj7  3em3  3haw  3vcm  2qhy  4pzx  1zj7  2wez  3sqf  1eed  4hla  4er2  3gga  1t3r  3d1z  4mc2  1e81  1g6l  4cms  4d8c  3ckt  2p4j  4cps  2nxm  4fco  2b7z  4obh  4fm7  2fxe  1lya  1ffi  3qs1  3rtn  2hm1  3cib  2nmz  3hvg  4gj6  3ttp  4dvf  1w5y  2h6s  9hvp  1f34  4eqj  3el9  1gvw  3psu  1bdl  1e5o  2g27  3so9  3vfb  3oy4  3u7s  1gvx  3saa  2bpw  4acu  1ebk  4i10  4bek  3ndu  4tvg  3kt2  3emy  3km4  1u8g  3ekx  2oht  2o4n  6apr  1fg8  3ecg  1meu  3nsh  3o9e  3pwm  2i4w  2zhv  2uy0  4u8w  7upj  1upj  3sab  4i8z  2asi  3hvp  4er1  4er4  4upj  3uqp  1mui  1bdr  2qi5  2g20  3r0y  3rsx  3liy  4j55  2i4d  4npt  2q64  4r5n  2rkg  3hw1  4gjb  3nu9  2hb3  4i8w  3kfr  4bfd  2qhz  2viz  3qn8  1odx  4djx  3dv1  2pk5  1b6p  2qi1  4j5j  1a9m  2hb4  3pbd  1hwr  4e43  3tog  1epq  4ape  1ppk  1hps  4dpi  1sbg  4n00  2je4  2upj  2qi6  3liq  3vuc  2zjl  2fnt  3i25  1d4y  3pcz  1ytg  1xs7  1lzq  3uri  3kdd  4lc7  2qnp  1gvu  3o9d 


CATH is a hierarchical classification of protein model structures. 


The Structural Classification of Proteins (SCOP) database is a largely manual classification of protein structural domains based on similarities of their amino acid sequences and three-dimensional structures.

b.50.1.1  b.50.1.2