Active Site

Structures: Aspartic peptidase, active site (IPR001969)

PDBe

The Protein Data Bank (PDB) is a repository for the 3-D structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids.

3kdc  1tcw  3vsx  3o99  2zjm  4k4q  2r38  3o9e  4a4q  1z1h  3vf7  3vv8  2va7  4gzf  3vyf  2fmb  1gnn  3wb4  3djk  1tzs  2azc  3zkg  3pj6  3l5e  1tsu  2i4x  4cps  2qu2  2p3a  1fq5  4er1  3hvp  2asi  4i8z  3sab  3l5f  4ivt  1kjg  3ia9  3kn0  1k1u  1hvk  4pzw  3d20  1apw  3slz  4l7h  3uf3  1yt9  1m43  3ogp  1bbs  2v16  3gw5  4gj8  1rne  3q5h  3sfc  3gi6  3t3c  3nyg  3vye  3tof  1smr  1fg6  3ndw  2web  3ekp  4dv9  3pld  4qj8  2zjj  4j0z  1a8g  7hvp  2qzw  1wbm  2ewy  2xfi  2zga  1ym2  1k1t  4l7g  4gjc  2o4p  4k9h  4obz  2o4l  1w6i  1epm  1b6k  3bva  2fns  1apu  2vie  3sa5  4b0q  1e80  1vik  2hvp  4dh6  2idw  3zki  1mt9  4djp  3uqr  4ll3  3kfp  4i0z  4auc  2nmy  1ec3  4djo  1xl2  1cms  3pvk  3mws  1bai  2rsp  4dqg  2v13  4eyr  3nuj  2zdz  1ajv  2jxr  2r43  3cid  4obj  1yx9  4r92  2il2  3b7v  3tpl  4dqb  3lzy  1qdm  4frk  1er8  2zhr  3er3  5er1  3ggu  1dp5  1ebw  2ohr  5fiv  3oqf  2zhu  2qd6  1tw7  2q55  1qbu  3s2o  1bxq  3qi1  2ohs  4a6c  1fqx  4djq  1tqf  4i12  3pll  2r5p  3zpu  3wb5  3s43  3th9  2hs2  1axa  1apv  4lhh  2vij  1bv7  1dif  1iiq  3oxw  2ph6  1d4l  1oex  1oew  1az5  4j1c  4j1k  1k2b  1hvc  3vv7  2a1e  2qd7  1mer  3r0w  2viy  4j0y  2er0  3kmx  2qi7  3prs  1xn3  1fq8  2qu3  3bhe  4mc6  2irz  2mip  2rmp  3lhg  2va5  3ckr  2g1r  3uqx  1hpx  2fs4  1lv1  3pm4  2qnn  4lbt  3urj  1pro  3hbo  3nxn  3bxs  2qi3  3el4  3o9i  3eky  4obf  1lyb  3m9f  2qi6  2oht  3apr  3vfa  3nsh  2hb4  1epq  2b7f  1xdh  3fiv  1k6c  4i0d  3zpt  1eby  4r91  3hau  3sa7  1ym4  2hb2  3kfs  1qrp  1dw6  4fae  4gb2  1lf2  3em6  3s7m  3zl7  2wec  3skg  4ejl  2j9j  3pmy  1xl5  4cku  3rvi  1sme  3i2l  4obd  2i4q  4l7j  1w50  1lee  2sam  2hc0  4cpr  2fgu  3mxd  2nxl  3nu5  4b1d  3in4  1wkr  1c6y  4gye  3oqa  3sm2  2wkz  1kj4  5hvp  6fiv  3veu  4cpx  3in3  3udk  2hah  3url  3q4b  4ep2  2aoj  2bbb  3vsw  1b6l  3h5b  2g22  4i0g  1sip  4rcf  3udj  3t7x  2zjh  4jp9  4jpc  2f3k  1k6t  3ixk  4gj9  3pi5  3igb  3pgi  2h6s  3pbz  3qp0  3n3i  1xe5  1z8c  3qaa  1htr  3ebz  2vj6  1w5y  4dvf  2ren  2ze1  1met  3oq7  2r9b  2bks  4acu  2f3e  2avm  3tpr  2vkm  2wez  3k5d  2g94  4b77  2jjj  1rq9  1miq  3tpj  3q70  3psu  1gvx  1e5o  3hvg  4hdf  4ivs  1lya  4mc2  2iku  2nph  3kt2  4bfb  3ine  3upj  1hwr  3u7s  2p4j  2pk5  1odx  3t6i  4e43  1zbg  1fmx  1yth  3qn8  2j9k  4fe6  2viz  3er5  3km4  3emy  4fm7  4obh  1wbk  4fsl  1ebk  2wf1  3kmy  2qnq  2bqv  3dv1  3gi0  2ohn  4j55  2zjl  1npa  4dpi  3pbd  3nr6  2i4d  3cic  2fgv  1lyw  1d4y  4hdp  2f8g  3app  1psa  3l5c  4er2  3haw  3em3  4gj7  3vuc  2upj  2je4  4n00  3i25  3rsx  4h3g  3bvb  3l3a  3vg1  3vf5  1sgz  2zjk  3l59  3l5d  2f80  2rkf  3mxe  2fxe  2o4n  3liq  3ok9  2cen  2g26  4f75  3tlh  2q11  1k2c  2q3k  2v11  1izh  2qd8  3cyw  3mim  2f3f  1vij  3k5c  4j17  3ttp  4gj6  4ep3  1zsr  1b6m  3jw2  1kjh  2avo  4j0p  3ivh  1zpk  2b8l  4i0j  1ebz  1sdv  2aoe  2g69  3udn  2nmz  3ecg  1bvg  4obk  4flg  2ohl  3uqu  1aaq  1hhp  1flh  4fs4  3so9  2nxm  3ckt  4d8c  4h3f  4l1a  4gjd  1f7a  4d89  4cms  2g1o  4eq0  3cib  2hm1  1t3r  3qrm  3ggv  1fej  3oot  3ogq  1bim  2p3b  4heg  1uh9  3el0  3kt5  1hvi  2cem  1sp5  2iko  3lzv  1rv7  1fq7  1pfz  5er2  2pwc  2wed  3k1w  4u8w  2uy0  1meu  1ppm  4acx  1npv  4aa8  1b5f  4qja  2bpz  3pwm  3rtn  3ekt  1rl8  4i0e  2zji  4fco  3ekx  4tvg  2bju  1hii  3ndu  1g35  3ndx  1t7i  1fmb  1hvl  1fg8  6apr  2f81  1zj7  4pzx  2qhy  3vcm  3oy4  3vfb  1mui  1aid  3d91  2psu  3zov  4djv  3zks  1zap  3lzs  1tsq  4i0i  3dcr  4azy  4amt  3ixo  3oqd  2g1s  3qpj  1hbv  3lzu  4rrn  3gi5  4ewo  1czi  1izi  3o9h  2xfj  1kzk  2v0z  1sdu  2apr  2ph8  3qrv  2g21  2qak  2z4o  4i11  2qk5  2r8n  3rtm  4r8y  2g1y  4nju  4gja  4fl8  1hsg  1ohr  2iqg  1c6x  1q9p  2az9  2psv  3sm1  2i4v  2p3c  1bwb  3st5  3tkg  1a8k  4rrs  2igy  3msk  3vf3  3iaw  4di2  2aog  1jld  1a30  4j1e  3i8w  2avq  1rpi  1heg  2pk6  1epl  4dqe  1t7k  1fq4  4i0h  1w5w  2qci  3nwq  4hzt  3l58  2pc0  2g1n  3oxx  3l38  3bgc  3liv  2wf4  2azb  4j1h  1ida  2wf0  2hpf  3qih  5pep  3hlo  4b78  2o40  1psn  3dv5  3o9l  4dju  3bxr  2bkt  3bc4  2h6t  5apr  3g70  4exg  2bpx  4h3j  1zsf  3tpp  3udp  2aoc  4djr  3buh  1ajx  4ejk  3qs1  1ffi  4aa9  1mtb  1u8g  2pwr  1bdr  3own  2wea  1npw  4mc9  3ru1  4dpf  3nls  4njt  4b05  1fff  2nxd  4dqh  1dmp  3i6o  2q54  4faf  1ent  4gj5  4fse  1ff0  1hxw  4apr  3jvy  3ka2  3ind  1qbs  1apt  3ekw  4dqf  3oxv  4d83  3bug  4i1c  3c9x  1ec0  4qlh  3buf  4coe  2fiv  1hsh  4i0f  2qmg  4q1n  3fsm  1sdt  1ibq  4he9  3duy  2is0  2b8v  2ien  2bb9  3sa9  4j1f  1mrw  3aid  2pyn  1hrn  1daz  4exh  5upj  4dqc  2wf3  3inh  1fb7  4dus  1w5x  3sa4  4f74  3r2f  1hte  1uh8  2hs1  2vnn  2bpy  3r1g  3pmu  4h1e  4b72  3o9b  3ekq  4r93  1g2k  3s45  2wf2  2b60  3uhl  3zkn  3r4b  3s56  2pqz  2pym  2r5q  1bil  3q6y  3ufn  3zkm  1ize  1nso  1bwa  3n4l  2wl0  4mc1  3rsv  3exo  4k4p  2g24  3toh  4npu  4hvp  2avs  2q5k  4b70  3d1x  3phv  3pep  2z54  1z1r  4pyv  1fgc  1k6v  1hps  2qi1  2b7z  4l6b  1ppk  2q64  4npt  1ytg  2ohq  1bdl  1g6l  1e81  3uqp  4upj  4er4  1gvu  2qnp  4lc7  3kdd  3uri  1lzq  4gjb  3hw1  2bpw  1a9m  1gvw  3el9  4h3i  2fnt  1b6p  4i10  3saa  4m8x  3r0y  2g20  2qi5  7upj  1gno  1bdq  3pcz  1sbg  2rkg  3gga  4r5n  1am5  4j5j  3pb5  3ou1  3d1z  2igx  3uqw  4ape  3tog  1xs7  3l5b  2cej  1nh0  4i8w  4bek  2aqu  2hb3  3nu9  2g27  2zhv  2i4w  3fkt  3kfr  1gvt  1d4k  1avf  3dox  1lf3  3oxc  3udq  2qmp  1pso  3sac  2fxd  2q15  3b80  3skf  4dfg  1epo  1bve  1lf4  3qbf  4d85  1eag  2aid  4lap  2qmd  2vj9  1xn2  3vyd  3ekv  3gi4  3k5f  3nu4  3psg  3ooz  3ou3  4njs  3nu3  4rce  3utl  3nxe  3zlq  3el1  3qro  3tl9  3msl  4j1i  3spk  1siv  3ouc  1hsi  2i0a  4b1e  3t11  2qi4  3hzc  3o9a  4cpt  1epp  1t7j  3q3t  2v10  4j0v  3oua  3lnk  3ec0  2qmf  1ivq  1ztz  4f76  1ody  3oag  3fx5  4x7i  3k4v  1izd  2qzx  4phv  1d4i  3bra  1ls5  1fiv  2hpe  4jpe  4ke1  3t7q  1cpi  4nkk  1dpj  4lp9  1ec2  3fv3  2qzk  1mt7  3qbh  2vnm  1hvs  4rro  1j71  1ppl  1mpp  4kup  4qj6  1xe6  1mrx  2xfk  4m8y  3pi0  2p3d  1yti  1ytj  4pep  1zlf  2o4k  1m0b  1hpo  1msm  2o4s  1sgu  1d4s  1a94  4b1c  1w51  4ha5  2zjn  2v12  1qbt  2whh  2qhc  3cms  1me6  2ntr  1msn  1zpa  4qj9  1hef  4fiv  1gvv  1mvp  1mes  4fgx  1c6z  3cyx  1fmu  3ohh  3udy  3sa6  3rth  1bv9  1idb  3tne  2p8h  3oty  4bel  3g6z  3inf  1mt8  3o9g  3o9c  4lxk  3s54  2i4u  3i7e  1k6p  3lix  3ckp  3jvw  1epr  3d3t  1bxo  4njv  1hvh  3tkw  3ucb  1w6h  1b11  3em4  3lpk  3nuo  3g72  3u71  3sa8  1n49  4od9  3dk1  3kfn  2ohu  4tvh  3f9q  1epn  3zmg  3el5  4djx  2qhz  4bfd  4obg  1c70  4k4r  2bpv  3liy  3o9d  2qp8  4fm6  4hla  1eed  3sqf  4lxm  3bgb  1uh7  1qbr  3msj  1hih  1d4h  2fdd  1sh9  3nwx  1b6j  3s85  2uxz  1upj  3lpi  4eqj  1f34  9hvp  2nnp  1kjf  8hvp  1mtr  1htg  3nu6  1ec1  4cpu  3zps  4cpw  1gnm  4cp7  1w5v  1hos  1d4j  4cpq  1htf  3ndt  4qgi  3sa3  3dck  3wsj  3lin  3lit  4frj  4gmi  3s7l  2wjo  2qzl  4djw  3ohf  2vj7  3udm  3lpj  3vv6  3h0b  4j0t  4fri  4djy  3u6a  2oah  4frs  4r95  4ke0  4d88  3ivi  3udr  3udh  3ixj  1hxb  1odw  2fde  1hvr  3zkx  3zkq  2ohp  2ohk  2p83  2hiz  2ohm  2fdp  2of0  6upj  1ivp  3s53  4kb9  2nnk  3d1y  2r3w  2aof  1hvj  2aod  1hpv  2avv  2aoi  2r3t  2fle  2xyf  4ej8  4ejd  3kf0  1zp8  1e82  2er6  2er7  3psy  1od1  2er9  3pww  3pcw  3t7p  2anl  4qj2  1g0v  3pwr  3a2o  2q63  4hdb  4j54  2i0d  3ots  4a6b  3oud  3ou4  4fm8  3hdk  2aoh  2psg  3oub  3ggx  1m4h  3dm6  2jji  2va6  2xye  3o9f  2zhs  3oad  2a4f  3kdb  3oqk  2zht  4qj7  2qi0  4gid  1qs8  2az8  4joo  3ufl  4lxa  4epj  4oc6  2ieo  1fkn  4k8s  3kyr  1hiv  4b00  3qrs  3k5g  4f73  1kj7  1fq6  2v00  1tcx 

CATH

CATH is a hierarchical classification of protein model structures.

2.40.70.10 

SCOP

The Structural Classification of Proteins (SCOP) database is a largely manual classification of protein structural domains based on similarities of their amino acid sequences and three-dimensional structures.

b.50.1.1  b.50.1.2