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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees
(View summary and phylogenies for PF02706 - Wzz)
FAM  PF02706
PID  Wzz
DES  Chain length determinant protein
IPR  IPR003856
ANO  42
ALN  281
AID  0.207875
APH  ((((((((((Q9XDD5_BRUME/15-186:1.23895,(Q9RJK3_STRCO/15-142:1.25800,EXOP_RHIME/26-208:0.71958):0.28954):0.26457,(((Q9RMD9_ACILW/9-125:0.23528,PTK_ACIJO/12-265:0.09637):0.94200,(((WZC_ECOLI/16-252:0.43562,(ETK_ECOLI/16-252:0.34892,(Q9X4B9_ECOLI/15-254:0.27477,YC06_KLEPN/14-253:0.30341):0.12375):0.20950):0.11711,AMSA_ERWAM/16-252:0.43738):0.13241,EPSB2_RALSO/16-272:0.84073):0.21326):0.35716,Q9WZB2_THEMA/4-172:1.37759):0.21174):0.13497,((P72877_SYNY3/27-177:1.24403,TUAF_BACSU/2-126:1.55913):0.24360,(O52499_BRAJA/22-200:0.98787,(P74824_9SPHN/1-157:0.87177,Q56769_XANCA/2-171:1.31779):0.13817):0.16164):0.17388):0.15039,(((((P95695_STAAU/3-140:0.21673,CAPA_STAAU/3-139:0.22544):0.07150,CAPA_STAAW/3-139:0.39210):0.32773,(YVEK_BACSU/3-139:0.68070,YWQC_BACSU/3-140:0.38823):0.21985):0.06881,O06029_LACLC/7-142:0.62688):0.29944,(((Q9ZFT9_STRPN/8-146:0.12425,Q9S4X7_STRPN/7-145:0.18372):0.13559,Q9X4U6_STRSU/9-144:0.29747):0.17498,(O87930_STRTR/11-148:0.38430,CPSC_STRA3/9-146:0.29809):0.11643):0.38750):0.12540):0.33802,((Q57322_VIBCH/24-219:0.89101,O66795_AQUAE/63-231:1.13030):0.26481,(Q9RHD8_PSEAE/4-148:0.47774,(Q9XC65_PSEAE/5-161:0.77343,P72148_PSEAE/13-169:0.51158):0.00000):0.92092):0.19287):0.20626,((Q57210_YEREN/25-157:1.15842,FEPE_ECOLI/25-175:0.92102):0.17930,Q9RCC2_YERPE/28-180:0.45440):0.69011):0.11717,(Q9ZB25_SHISO/6-125:1.04421,WZZE_ECOLI/16-116:1.05047):0.15179):0.24625,Q9XBT8_VIBAN/11-127:0.72503):0.89449,WZZB_SALTY/16-155:0.04583):0.15189,WZZB_SHIFL/16-155:0.11955,WZZB_ECO11/16-155:0.26922);
ATP  ((((((((((Q9XDD5_BRUME/15-186,(Q9RJK3_STRCO/15-142,EXOP_RHIME/26-208)),(((Q9RMD9_ACILW/9-125,PTK_ACIJO/12-265),(((WZC_ECOLI/16-252,(ETK_ECOLI/16-252,(Q9X4B9_ECOLI/15-254,YC06_KLEPN/14-253))),AMSA_ERWAM/16-252),EPSB2_RALSO/16-272)),Q9WZB2_THEMA/4-172)),((P72877_SYNY3/27-177,TUAF_BACSU/2-126),(O52499_BRAJA/22-200,(P74824_9SPHN/1-157,Q56769_XANCA/2-171)))),(((((P95695_STAAU/3-140,CAPA_STAAU/3-139),CAPA_STAAW/3-139),(YVEK_BACSU/3-139,YWQC_BACSU/3-140)),O06029_LACLC/7-142),(((Q9ZFT9_STRPN/8-146,Q9S4X7_STRPN/7-145),Q9X4U6_STRSU/9-144),(O87930_STRTR/11-148,CPSC_STRA3/9-146)))),((Q57322_VIBCH/24-219,O66795_AQUAE/63-231),(Q9RHD8_PSEAE/4-148,(Q9XC65_PSEAE/5-161,P72148_PSEAE/13-169)))),((Q57210_YEREN/25-157,FEPE_ECOLI/25-175),Q9RCC2_YERPE/28-180)),(Q9ZB25_SHISO/6-125,WZZE_ECOLI/16-116)),Q9XBT8_VIBAN/11-127),WZZB_SALTY/16-155),WZZB_SHIFL/16-155,WZZB_ECO11/16-155);
ATL  37.1166
DNO  41
DLN  843
DID  0.359708
DPH  (((((((Q9RCC2_YERPE/28-180:0.40411,FEPE_ECOLI/25-175:0.71633):0.05833,Q57210_YEREN/25-157:0.61426):0.25232,(TUAF_BACSU/2-126:0.94458,((((Q57322_VIBCH/24-219:0.57427,(Q9WZB2_THEMA/4-172:0.65011,((((WZC_ECOLI/16-252:0.29664,(ETK_ECOLI/16-252:0.24309,(Q9X4B9_ECOLI/15-254:0.24003,YC06_KLEPN/14-253:0.27145):0.22291):0.16039):0.07565,AMSA_ERWAM/16-252:0.35407):0.07301,(EPSB2_RALSO/16-272:0.27856,((Q56769_XANCA/2-171:0.58918,(P72877_SYNY3/27-177:0.82950,Q9XDD5_BRUME/15-186:0.60332):0.12265):0.09391,((Q9RJK3_STRCO/15-142:0.63998,(P74824_9SPHN/1-157:0.51291,O52499_BRAJA/22-200:0.41364):0.11418):0.05746,EXOP_RHIME/26-208:0.53727):0.09247):0.26134):0.22333):0.23339,(Q9RMD9_ACILW/9-125:0.14172,PTK_ACIJO/12-265:0.30181):0.42790):0.14996):0.19487):0.06349,O66795_AQUAE/63-231:0.62315):0.11275,(Q9XC65_PSEAE/5-161:0.38901,(Q9RHD8_PSEAE/4-148:0.35292,P72148_PSEAE/13-169:0.33727):0.13240):0.45543):0.05296,((((YVEK_BACSU/3-139:0.47114,YWQC_BACSU/3-140:0.32705):0.24857,O06029_LACLC/7-142:0.40914):0.05817,((P95695_STAAU/3-140:0.19948,CAPA_STAAU/3-139:0.21680):0.10783,CAPA_STAAW/3-139:0.26413):0.19847):0.14736,(CPSC_STRA3/9-146:0.27930,(O87930_STRTR/11-148:0.27435,(Q9ZFT9_STRPN/8-146:0.28376,Q9X4U6_STRSU/9-144:0.22227):0.18331):0.06221):0.13703):0.18845):0.07625):0.09615):0.04891,(Q9ZB25_SHISO/6-125:0.60021,WZZE_ECOLI/16-116:0.58557):0.08091):0.11223,Q9XBT8_VIBAN/11-127:0.45082):0.44980,WZZB_ECO11/16-155:0.15810):0.07118,WZZB_SHIFL/16-155:0.17743,WZZB_SALTY/16-155:0.22992);
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RTL  36.873
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LNK  CAPA_STAAW/3-139:Q9RQQ1:AP004831
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DMK  xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...............xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.........xxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxx...xxx...xxx............xxx...xxxxxxxxxxxx...xxxxxx...xxx...xxx...xxx...xxx...xxx...xxx...xxxxxx...xxxxxx...xxxxxx...xxx.........xxx...xxx...xxxxxxxxxxxxxxx...xxx...xxx...xxx...xxxxxxxxxxxxxxx...xxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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DSQ  GATGAAATAGATCTATATGAGCTCTGGGTTGTACTTAAAAAAAGGTTCAGGGTTATACTGCTTACTCTAGTTATCTTTATTGCAGGTGCGGTTGCATATGTA...---TTCATAGCTCCTCCGGTTTACAAAACCGAAGCTGTGATATTTCCTATAGGCGGAGAAAAA------------...ACAAATTTACCC---------------TCAATACTGGAAGGTCTTCCAGTACCCCTACCATCTGTT------...............GCAGATAAAGTA---ACCGTTGAGTCCGTTTTAAAAAGCAGAACTTTAAGGGAAAGAGTGATTGAGAAATTAAACCTTATGCCTgtcTTGTTCAAGGATTTATGGGACGAAAGTAGGAATACTTGGAGACAA------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------GATCTTGAACCAGAAGATATTCCCACAATTCTAGATGGAGCCGAATTGTTAGAAGACTTAATTTCTGTT---...TCCTCAAATAAA...AAAACAGGAACTATAACTTTTTCAGTAGAAtttCCAGAAGATCCGCATATGGCGTATAAAATTGCACAGGTTTCCTTGGAAGAG
TRN  10010101100011000
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DSQ  ACCGGCTTCAACGTGCTGGAGCTCGTCAATCTGCTCTGGCGGCGGAAGATCGCGATTGCCGCTGCCGCACTCCTCGGTGCGACGCTTGCCGTCACCGTGGGC...---AAGAGCGTGACGCCCCGCTACACCGCCACCGCCCAGCTCTATGTCGACCCGCGCGAGCTTCAGCTGGTC---...GATCGCGAGCTCACGCCGCGTGCCCAG------------------------GACGTCTCCGGCATGACC---...............ATGGTGGTGGAG---AGCCAGGCCCGCCTGATCACCTCGAACAGCGTGCTGCTCCAGGTGATCCAGCAGGCCGGCCTCGACAAG...---------------GACCCCGAATTCGGCGGCGGTGATGCCAGGAGCCTG.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---ATGTCGTCGCTG...CTCggcCTGATCGGCCTTCAGCCCCGCGCGCCGTCCGCCGCGGAAACCAAGGAAGTGCAGCTCGCGGCGCTCGACGCGCTGAACCGGCACATCACGGTC---...CGCAAGACCGAG...AAGAGCTTCATCGTCGACATCGAGGTCTGG...TCGACCGATCCGGCGAAAGCGGCGATGCTCGCCAACACGCTGACCAGCGCC
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NAM  Q9X4U6_STRSU/9-144
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NAM  YWQC_BACSU/3-140
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TRN  10010101100011000
NAM  YVEK_BACSU/3-139
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NAM  O06029_LACLC/7-142
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NAM  Q9WZB2_THEMA/4-172
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TRN  11011111101111111
NAM  AMSA_ERWAM/16-252
ASQ  IRFELAHLLGQLLDHRWMIVAVSVLFTLMGTLYS.-LFATPIYSADAMVQVEQKNANTV-.------------LNDISQMMPNA-.....QPASAAEIEIITSRMVLGKTVADLGLDVlVQQDHFPLIGAGLSRIIg..QKAQQIaVS.-.-....-.--RLkVPtLwDkReLsVeVdGPdSYtVSkDg.nElFkGKVGQfEqHgD.-VTML.VnSIE-ADAGTRFTVSKLNNLQAIKMISNNLVVA.DMGK.DTGVLGLTYS.GEDPVQISRVLDQVINN
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TRN  10010101100011000
NAM  YC06_KLEPN/14-253
ASQ  DDLDFGRMVGELIDHRKIIIALTSFATLIALLYA.-FFATPIYKADALIQVEQKQANAI-.-----LSNL-------SQMLPDS-.....QPQSAPEIALIQSRMILGKTVDDLNLQAvVSPKYFPIFGRGWARLSg..EHQGNIqLS.-.-....RlYVSSsIGdEeNpPeFtLkVkDSnRYvIEfG..gEeInGKVGElIeKdG.-ITLK.IdEIN-AKPGAEFTIKYVSKLKAIADLQENLSVA.DQGK.DTGILILSYL.GDDPLKIKNIVDSISEN
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NAM  Q9X4B9_ECOLI/15-254
ASQ  DEIDLGRVIGELIDHRKLIISITSVFTLFAILYA.-LLATPIYETDALIQIEQKQGN---.----------AILSSLSQVLPDG-.....QPQSAPETALLQSRMILGKTIDDLNLQIqIEQKYFPVIARGLAGLMg..EKPGNIdIT.-.-....RlYLPDsDDiSnNtPsIiLtVkDKeNYsINsD..gIqLnGVVGTlLnEkG.-ISLL.VnEID-AKPGDQFVITQLPRLKAISDLLKSFSVA.DLGK.DTGMLTLTLT.GDNPKRISHILDSISQN
DSQ  GATGAAATAGATTTAGGTCGCGTTATCGGTGAGCTAATTGATCATCGTAAGCTTATTATATCTATAACATCGGTTTTTACCTTATTTGCAATACTCTATGCA...---TTATTAGCGACTCCTATCTATGAGACGGATGCGCTAATTCAAATAGAGCAGAAGCAAGGTAAT---------...------------------------------GCTATACTAAGCAGTCTAAGTCAGGTTTTACCTGATGGC---...............CAACCCCAATCTGCACCTGAAACAGCTTTGCTACAATCTCGAATGATTCTTGGCAAAACTATAGATGATTTAAACCTTCAGATTcaaATTGAACAAAAATATTTTCCTGTTATTGCCCGTGGGTTAGCAGGATTAATGgga......GAAAAACCAGGTAATATTgatATTACT...---...---............CGGttaTATTTGCCTGATagtGACGATattAGTaatAATactCCTagtATAataTTAacaGTAaaaGATAAAgaaAATTATtcgATCAATagcGAT......ggtATTcaaCTCaatGGGGTTGTAGGGACGttaTTAaatGAAaaaGGG...---ATATCATTACTG...GTTaacGAAATCGAT---GCTAAACCTGGAGATCAATTTGTTATTACACAGTTGCCTCGATTAAAGGCCATTTCTGATCTTTTAAAAAGTTTTAGCGTTGCT...GATTTGGGTAAA...GATACGGGAATGTTAACGTTGACTCTTACT...GGAGATAACCCAAAAAGAATATCTCATATTTTGGACAGTATCAGTCAGAAC
TRN  10010101100011000
NAM  ETK_ECOLI/16-252
ASQ  NEIDLLRLVGELWDHRKFIISVTALFTLIAVAYS.-LLSTPIYQADTLVQVEQKQGN---.----------AILSGLSDMIPNS-.....SPESAPEIQLLQSRMILGKTIAELNLRDiVEQKYFPIVGRGWARLTk..EKPGELaIS.-.-....-.-WMHiPQlNgQdQqLtLtVgENgHYtLEgE..eFtVnGMVGQrLeKdG.-VALT.IaDIK-AKPGTQFVLSQRTELEAINALQETFTVS.ERSK.ESGMLELTMT.GDDPQLITRILNSIANN
DSQ  AATGAGATCGATCTGCTTCGTCTGGTCGGCGAGTTATGGGATCACCGTAAGTTTATTATCAGCGTGACCGCGTTATTCACGCTGATCGCTGTCGCTTACTCG...---CTGTTAAGCACACCAATTTATCAGGCAGATACTCTGGTCCAGGTTGAGCAAAAACAGGGCAAC---------...------------------------------GCCATTCTCAGCGGCCTGAGCGATATGATCCCTAACTCA---...............TCGCCCGAGTCTGCACCGGAGATCCAACTGCTGCAATCGCGCATGATTCTCGGTAAAACCATTGCTGAACTGAATCTGCGCGACataGTTGAGCAGAAGTATTTTCCGATTGTGGGTCGCGGCTGGGCGAGATTAACCaaa......GAAAAACCAGGTGAGCTGgcgATCAGC...---...---............---...---TGGATGCATattCCACAActgAATggtCAGgatCAGcaaCTGacaCTCacgGTTgggGAAAACggcCACTATacaCTGGAAggtGAA......gagTTCaccGTCaatGGTATGGTCGGCCAGcgtCTGgaaAAAgatGGC...---GTTGCGCTGACT...ATCgcgGACATTAAG---GCCAAACCAGGAACACAGTTTGTCCTGAGCCAGCGTACCGAACTGGAAGCGATTAACGCATTGCAGGAAACCTTTACCGTTAGC...GAACGCAGTAAA...GAAAGCGGGATGCTGGAACTTACCATGACT...GGTGATGATCCCCAGTTGATTACTCGTATTCTGAACAGCATCGCTAACAAC
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NAM  WZC_ECOLI/16-252
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NAM  Q9RMD9_ACILW/9-125
ASQ  DTIDLKELFFALIAQWKLIALCIILSLVFALLYL.-RATPDTYSVDALVQVEDSKGASA-.----------ALLGDLSQMIEQK-.....SPAQ-SEIEILKSRLVLGSVIQALHLDL.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------------------------------.----.-------EIA.SENNTFSHRLLNKTDYE
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TRN  11011101101011000
NAM  EXOP_RHIME/26-208
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DSQ  GGCTTTATCGACCTTGACCGGCTTGTCGCCGCAGTCTTTCGTCGTGCCCGGCTTGTGGCCGCATTCGTCGTGCTCTTCATTGCGCTGGGGGCCGCTTATCTC...---CTGTTTGCCACGCCCTATTACACGTCGATGACGCAGATCCTTCTCGACGAAAACCTGTCCAAATACGCC---...GAGGAAGAGCCTACCCCGGTAAACAGC------------------------CAGATGCTCGAT---------...............ACCCAGATTGCG---AGTGCGGTCGAGATCCTGAAGTCCGGCGAACTCGCGCTGCGCGTCGTAGACAAGCTCAAGCTTTCGGAAaacGATACCATCCTCAATCCGCCGCGCTCCCCGGTCGACATGGTCAAGGAATGG.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---CTGAAGACGGCA...ACCgggCTGTTTTCGGGCGGGCCGGATGTCACGGAGGAGGCAGCGCGCAACGGACGGCGGCAGAAGGCGGCCGCGATCATACAGCAATCGCTCGCGGTC---...GAGCGTGTCTCG...CGCAGCTCGGTCGTGGCCGTTGCCTTTCGC...TCGAGCGACCCCTTGCTCGCGGCGACCATCGCGCGCGGCTACGCAAGTGCC
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TRN  10010101100011011
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ASQ  --MNIIQFFRILWVRRWIILPAFLVCVTTAALVV.-QFLPERYRATTRLVLDTFKPDPV-.------TGQ--------VMNSQFMr....AYVQ-TQTELIEDYATSGRVVDELGWAN.-----DPANI-------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.---AAFNASSSAATGDIRRWLAKQISDNTKA-.DVIE.GSNILEISYS.DSSPERAERIANLIRTA
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TRN  11011101101011011
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ASQ  ----VADLLETIKRRKLMLTLPIIAGVGVGFAGY.-LTAPVSYVSESVLVLDMRRLQAL-.PNESAIT----------PLPQDS-.....PVLR-SELDIINSRMMAQKVIELLQAEN.------IAVPTDVHSRTvlsSQPDRItLS.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.------KNARDFDPAVRERQQIDLLLSRLRV-.SNDG.RSFTIFISYR.APDPVYAARVANAFATA
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TRN  11011101101011000
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