PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
| (View summary and phylogenies for PF01723 - Chorion_1) |
FAM PF01723 PID Chorion_1 DES Chorion protein IPR IPR002635 ANO 7 ALN 203 AID 0.481324 APH (((Q17218_BOMMO/1-174:0.36263,(CHR1_BOMMO/1-173:0.16811,Q17215_BOMMO/1-189:0.10915):0.15207):0.17990,(CHB1_LYMDI/2-191:0.70028,CHCB_BOMMO/1-172:0.61334):0.14345):0.44180,CHB1_BOMMO/2-166:0.11325,CHHB_BOMMO/2-131:0.42972); ATP (((Q17218_BOMMO/1-174,(CHR1_BOMMO/1-173,Q17215_BOMMO/1-189)),(CHB1_LYMDI/2-191,CHCB_BOMMO/1-172)),CHB1_BOMMO/2-166,CHHB_BOMMO/2-131); ATL 3.41369 DNO 7 DLN 609 DID 0.53998 DPH ((Q17215_BOMMO/1-189:0.11034,CHR1_BOMMO/1-173:0.19667):0.13010,((CHHB_BOMMO/2-131:0.30928,CHB1_BOMMO/2-166:0.04625):0.28895,(CHCB_BOMMO/1-172:0.44643,CHB1_LYMDI/2-191:0.43163):0.09648):0.13858,Q17218_BOMMO/1-174:0.33929); DTP ((Q17215_BOMMO/1-189,CHR1_BOMMO/1-173),((CHHB_BOMMO/2-131,CHB1_BOMMO/2-166),(CHCB_BOMMO/1-172,CHB1_LYMDI/2-191)),Q17218_BOMMO/1-174); DTL 2.534 RID 0.481324 RPH (((Q17218_BOMMO/1-174:0.36263,(CHR1_BOMMO/1-173:0.16811,Q17215_BOMMO/1-189:0.10915):0.15207):0.17990,(CHB1_LYMDI/2-191:0.70028,CHCB_BOMMO/1-172:0.61334):0.14345):0.44180,CHB1_BOMMO/2-166:0.11325,CHHB_BOMMO/2-131:0.42972); RTP (((Q17218_BOMMO/1-174,(CHR1_BOMMO/1-173,Q17215_BOMMO/1-189)),(CHB1_LYMDI/2-191,CHCB_BOMMO/1-172)),CHB1_BOMMO/2-166,CHHB_BOMMO/2-131); RTL 3.41369 LNK CHB1_BOMMO/2-166:P08827:X15557 LNK CHB1_LYMDI/2-191:P43515:U04662 LNK CHCB_BOMMO/1-172:P08830:M19075 LNK CHHB_BOMMO/2-131:P05688:K02835 LNK CHR1_BOMMO/1-173:P13532:M19077 LNK Q17215_BOMMO/1-189:Q17215:X58449 LNK Q17218_BOMMO/1-174:Q17218:X58452 AMK xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.xxxxxxxxxxxxxxx.xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx......xxxx.xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx DMK xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx..................xxxxxxxxxxxx...xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx NAM Q17218_BOMMO/1-174 ASQ MAKTVLFVFASALISQGVLSQFTGRIFS---.P-RPGFDSLAYEGLG.Y---G----GWNGRGICGGVRDDITAAGALAASQGGGLAVVTSS-AAPTGLGETLESSYEGTVSICGNAPFLGTADVAGELSTIGGGVVSYECGDGAVGITTEGGVG......-VAP.TATIGSANIPPAVG-------APVGYRGFNRGCGCGS DSQ ATGGCCAAAACTGTTCTATTTGTTTTTGCATCTGCCCTTATTTCCCAGGGTGTCCTTAGCCAATTTACTGGACGCATCTTTTCT---------...CCT---CGTCCTGGTTTCGACAGCCTGGCTTACGAAGGCCTCGGT...TAC---------GGA------------GGTTGGAACGGTCGAGGCATTTGTGGGGGCGTCCGCGACGATATCACCGCAGCAGGCGCTCTTGCCGCATCCCAGGGTGGTGGACTTGCCGTTGTCACCTCCTCG---GCTGCACCTACTGGTCTCGGCGAGACCTTAGAGAGCTCATACGAGGGTACGGTTTCGATTTGCGGCAACGCGCCGTTCCTCGGAACTGCTGATGTTGCTGGCGAGCTTTCCACAATCGGAGGTGGTGTAGTCAGCTACGAATGCGGCGACGGAGCTGTTGGTATAACCACGGAGGGTGGTGTGGGT..................---GTCGCGCCA...ACCGCTACAATCGGATCTGCTAACATTCCTCCTGCGGTTGGA---------------------GCTCCTGTGGGATACCGAGGCTTTAACCGCGGGTGTGGATGCGGCTCT TRN 10010101100011000 NAM Q17215_BOMMO/1-189 ASQ MAFKAILVFASALFLESALGQCLGRAGPGLG.AYRGGWDGLGYDGLG.Y---DGIGYGWNGRVGCGGFGDDIAAASALGASHGGTLAVVSSS-AAPTGLGVTSENSYEGSVGVCGNLPFLSTAAVAGEFPTAGVGGINSSCGDGAVGITAEGGIGyapavaIAAP.VYNAAPTPVYGAGI-------APAAYSGVNRGCGCGA DSQ ATGGCATTTAAAGCTATCCTAGTTTTCGCTTCAGCACTTTTTCTAGAGTCTGCCTTGGGCCAGTGTCTTGGCCGAGCCGGTCCTGGTCTTGGA...GCATACCGTGGCGGTTGGGACGGCCTTGGCTACGATGGTCTGGGC...TAT---------GATGGTATCGGTTACGGATGGAACGGTCGCGTTGGTTGTGGAGGCTTCGGTGATGATATCGCAGCTGCCAGCGCCCTCGGAGCCTCTCATGGAGGTACTCTTGCTGTCGTATCTTCGTCT---GCAGCTCCTACCGGCCTGGGCGTGACTTCTGAGAATTCTTACGAGGGTTCCGTGGGTGTCTGCGGTAATCTGCCGTTCCTGAGTACAGCAGCTGTCGCCGGTGAATTCCCCACTGCTGGTGTTGGTGGTATTAACTCCAGCTGTGGTGACGGTGCCGTTGGTATAACAGCTGAAGGTGGTATTGGTtacgctccagctgttgccATTGCTGCCCCT...GTCTATAACGCAGCCCCTACCCCTGTCTATGGAGCTGGTATC---------------------GCACCAGCTGCCTACAGCGGTGTGAACCGCGGATGCGGTTGTGGAGCT TRN 10010101100011001 NAM CHR1_BOMMO/1-173 ASQ MAFRGIVVLASALFVQSALSQCVGRAGPGLG.GYRGGWDGFGYDGLG.Y---DGAGYGWNGRLGCGGLGDDIAAASALGASHGGTLAVVTSS-AAPTGLGIASENSYEGGVGICGNLPFLSTASIAGELRTGGTGGIDYGCGNGAVGITVES---......VISP.AINYAP-----AG--------APLGRS-FNRGCGCGA DSQ ATGGCGTTCAGGGGTATTGTGGTCCTTGCTTCAGCACTTTTTGTTCAGTCTGCCTTGAGCCAGTGTGTCGGCCGAGCTGGTCCCGGTCTTGGA...GGGTACCGTGGCGGTTGGGATGGCTTTGGTTACGACGGTCTGGGA...TAC---------GACGGTGCCGGATACGGATGGAATGGTCGCCTCGGCTGTGGTGGTCTCGGAGATGATATCGCAGCGGCCAGCGCTCTTGGAGCCTCTCACGGAGGTACCCTTGCTGTGGTGACTTCTTCT---GCCGCTCCCACTGGCTTGGGCATAGCTTCTGAAAATTCATACGAAGGCGGCGTTGGTATATGTGGTAACCTACCATTCCTGAGTACTGCGTCTATAGCCGGCGAACTCAGAACCGGTGGTACCGGTGGTATCGACTATGGGTGTGGTAACGGAGCTGTTGGGATAACAGTGGAAAGC---------..................GTAATATCTCCT...GCCATTAACTATGCTCCT---------------GCTGGT------------------------GCTCCTTTAGGCAGGAGC---TTCAATCGCGGCTGCGGATGCGGTGCT TRN 10010101100011000 NAM CHHB_BOMMO/2-131 ASQ AAKLIVFVCAIALVAQSVLGTGCGCCCRG--.---------------.---------CGCGCGGCG--------CGCCENFR-----VCSNS-AAPTGLSICSENRYKGDVCVCGEVPFLGTADVCGNMCSSGCGCIDYGCGNGCVGITR-----......--S-.-CGGCGCGCGGCG--------------CGCGGCGC-C DSQ GCCGCTAAACTCATTGTCTTCGTCTGCGCCATCGCCCTCGTGGCTCAGTCCGTTTTGGGCACTGGTTGTGGCTGCTGCTGTAGAGGT------...---------------------------------------------...---------------------------TGTGGCTGCGGTTGTGGAGGTTGTGGC------------------------TGTGGATGTTGTGAAAATTTCCGT---------------GTATGTTCCAATTCG---GCTGCTCCTACTGGTCTAAGTATATGTTCCGAGAACAGGTACAAGGGTGATGTCTGTGTCTGCGGTGAAGTGCCTTTCCTTGGTACCGCTGATGTCTGTGGCAACATGTGCAGCTCGGGTTGTGGTTGTATCGACTACGGATGCGGAAACGGTTGCGTCGGTATCACCCGA---------------..................------AGC---...---TGCGGCGGGTGCGGATGCGGCTGTGGAGGCTGCGGA------------------------------------------TGCGGCTGTGGAGGCTGCGGTTGC---TGC TRN 10010101110011011 NAM CHB1_BOMMO/2-166 ASQ AAKLILFVCATALVAQSALGIGCGCGCGGR-.------G---YGGLG.Y---GGLGYGGLGYGGYG--------GGCGRGFSGGGLPVATAS-AAPTGLGIASENRYEGTVGVCGNLPFLGTADVAGEFPTAGIGEILYGCGNGAVGITREGGLG......FGAG.YGGGYGLGYGGYGG-------GYGLGYGGYGGCGCGC DSQ GCCGCTAAACTCATTCTCTTCGTCTGCGCCACCGCCCTCGTGGCACAGTCCGCTTTAGGCATCGGTTGTGGTTGTGGTTGTGGAGGTCGT---...------------------GGC---------TACGGCGGTCTGGGC...TAT---------GGTGGTTTGGGCTATGGTGGTCTGGGCTACGGGGGCTATGGA------------------------GGTGGATGCGGTCGTGGTTTCAGCGGTGGTGGTCTCCCTGTTGCTACTGCCTCT---GCTGCTCCCACTGGGCTTGGGATAGCTTCCGAGAACAGGTACGAGGGTACCGTCGGTGTCTGTGGCAACCTGCCGTTCCTTGGTACTGCTGATGTCGCTGGCGAGTTCCCCACCGCCGGTATTGGTGAAATCCTCTACGGCTGCGGAAATGGTGCCGTTGGTATTACCCGCGAGGGTGGACTCGGC..................TTTGGAGCTGGT...TACGGAGGCGGCTACGGTCTCGGCTATGGAGGCTACGGAGGT---------------------GGCTACGGTCTCGGCTATGGAGGCTACGGCGGATGCGGATGTGGCTGC TRN 10010101100011010 NAM CHCB_BOMMO/1-172 ASQ MTTIVVLICASALFVQLAFSQCLGRDPVIGF.GGAYGSGWGGYDAISpY---DGLGYGVPYSAGFIGLS-----PSNLAASCGGALAVNSLSPTTPTGLTVASENTIEGNLGIFGQLPFLGAVATDGAFSTGGIGAVLYGCGDGAIGIVSEAP--......IVAP.ASIGYGQWPVNAG-------------YKGIGPCGCGG DSQ ATGACCACTATTGTAGTTCTTATTTGCGCCTCAGCTCTCTTCGTGCAGTTAGCTTTCAGCCAATGCTTGGGTCGTGATCCTGTTATAGGATTT...GGAGGTGCCTACGGCTCAGGATGGGGAGGCTATGACGCAATTAGTccaTAC---------GATGGCTTGGGGTACGGCGTACCTTATTCAGCAGGGTTTATTGGCCTGAGT---------------CCTAGCAATTTAGCTGCATCGTGTGGTGGTGCCCTGGCGGTCAACAGTCTCTCTCCCACCACTCCCACGGGGCTGACTGTTGCTTCTGAGAATACAATTGAGGGTAACTTGGGAATTTTCGGTCAGCTACCTTTCCTGGGTGCAGTGGCTACGGATGGTGCGTTCAGTACTGGCGGCATTGGTGCTGTTCTCTACGGTTGTGGTGACGGCGCTATCGGCATAGTTTCAGAAGCTCCT------..................ATTGTTGCACCA...GCCTCCATCGGCTATGGTCAGTGGCCTGTCAATGCAGGC---------------------------------------TATAAAGGAATCGGGCCATGTGGATGCGGCGGG TRN 10010101100011000 NAM CHB1_LYMDI/2-191 ASQ SAKIILVFCAQALFVQSALSQCTSRATVAADrGIIGGYGLGAPYGLA.YGLEAPLGLGYGLGAPCGLAG----PAIDITPTIGGGLPVSSASAIAPVGLVVASENVYEGILAAAGELPFVGTVGVEGVLPTAGAGAVHHSCGDGINAMASRDA--......AFAPgYAGAHGIGLGAYGLGVPALEVPALGYRAGWRGCGCGL DSQ TCTGCTAAGATCATCCTCGTCTTCTGCGCTCAGGCGCTCTTCGTACAGTCCGCACTCAGCCAGTGCACCAGCCGCGCGACAGTAGCCGCTGACcgtGGAATTATTGGAGGATACGGTCTGGGTGCTCCTTATGGTCTTGCC...TACGGTTTAGAGGCTCCTTTGGGTCTTGGTTATGGTTTGGGTGCCCCTTGCGGTTTGGCTGGT------------CCCGCTATTGACATCACCCCTACCATCGGTGGTGGTCTCCCCGTCTCCAGTGCCTCTGCTATTGCTCCCGTCGGTCTTGTTGTTGCCTCTGAGAACGTATACGAGGGTATCTTAGCTGCTGCTGGTGAGCTGCCGTTCGTTGGTACTGTAGGAGTTGAGGGTGTCTTACCTACTGCTGGTGCTGGTGCTGTACACCACTCTTGCGGTGACGGTATCAATGCTATGGCTAGTCGTGATGCT------..................GCTTTCGCTCCTggcTACGCTGGTGCCCACGGTATTGGTCTGGGCGCTTATGGTCTCGGCGTCCCCGCTCTCGAAGTTCCTGCTCTCGGCTATCGCGCCGGATGGAGAGGATGTGGATGCGGCCTG TRN 10010101100011010 //