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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees
(View summary and phylogenies for PF00880 - Nebulin)
FAM  PF00880
PID  Nebulin
DES  Nebulin repeat
IPR  IPR000900
ANO  137
ALN  29
AID  0.306803
APH  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DSQ  ATCACCCCAGCGTATCAGACCGCCAAGAAGGCCAATGAACTTGTTAGTGACATAAAATACCGGCAGGACTTCCATAAGATGAAAGGT
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ASQ  EDLSMELARKCTELISDIRYKEEFKKSKD
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ASQ  DSPINRHFKYATQLMNEKKYRADYEQRKD
DSQ  GACTCTCCGATCAATAGGCATTTCAAGTATGCAACTCAATTGATGAATGAGAAAAAATACAGAGCTGATTATGAGCAGCGGAAAGAT
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ASQ  DAPELVQAVKNTAMFSKKLYTEDWEADKS
DSQ  GATGCCCCTGAACTTGTCCAGGCCGTTAAGAACACCGCCATGTTCAGCAAGAAACTGTACACTGAAGACTGGGAAGCAGACAAAAGT
TRN  11011101101011011
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ASQ  DSLEQVLAKNNALNMNKRLYTEAWDKDKT
DSQ  GACTCTCTGGAACAAGTGCTGGCCAAGAACAATGCTCTCAACATGAATAAGCGTTTATACACAGAGGCCTGGGACAAAGACAAGACT
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DSQ  GACACTCCGGAAATTGTCCTAGCAAAGAATAATGCCCTGACAATGAGCAAGCATTTATACACAGAAGCTTGGGATGCTGACAAAACC
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DSQ  GATTCCATGGACATGGTGCTTGCCAAGCAGAATGCACATACCATGAACAAGCATTTATACACCATTGATTGGAATAAAGATAAGACC
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DSQ  GATACTCCAGAAATTAATCTCGCTAGAGCAAATGCTCTTAATGTGAGCAATAAACTTTACCGTGAGGGCTGGGATGAAATGAAGGCG
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DSQ  GATACTCCAGATATCCTTCTCTCCAGAGTAAACCAAATCACCATGAGTGATAAACTGTACAGAGCTGGCTGGGAAGAGGAGAAGAAG
TRN  10010101100011011
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DSQ  GATACACCAGAAATCATGTTAGCCAAACTCAACCGAATAAACTACAGTGATAAACTCTATAAACTTGCTTTGGAAGAGTCCAAGAAG
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ASQ  DLPQFIQAKVNAYNISENMYKADLKDLSK
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DSQ  GACTCCCCAGTTATGGTCCAGGCAAAACAGAACACGAAGCAAGTCAGTGATATCTTATACAAGGCTAAAGGAGAAGATGTGAAACAT
TRN  11111101111011010
NAM  Q14214_HUMAN/719-747
ASQ  DAPITVQSKINQAQRSDIAYKAKGEEIIH
DSQ  GATGCTCCAATTACAGTACAGTCTAAAATTAACCAGGCCCAGAGGAGTGATATCGCTTACAAAGCCAAAGGAGAGGAAATTATTCAC
TRN  10110101110011011
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ASQ  DTPEMVQARISYTQAVDRLYREQGENVKH
DSQ  GACACTCCGGAGATGGTCCAGGCCAGGATTAGTTATACCCAAGCAGTGGATAGACTGTACAGGGAGCAAGGGGAGAATGTGAAGCAC
TRN  10010101100011011
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ASQ  DTPEMQRVRENQKNFSLLQYQCDLKNSKG
DSQ  GACACTCCAGAAATGCAGAGAGTCCGGGAGAACCAGAAGAACTTCAGCCTTCTGCAATACCAGTGTGACCTTAAAAACAGTAAAGGA
TRN  10010101100011011
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ASQ  DPPELRRIKENQKNISNVHYKEQLCRATP
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TRN  10010101110011011
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ASQ  DPPELKRAKENQKNISNVYYRGQLGRATT
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TRN  10010101100011011
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DSQ  GTTACTCCAGAGATGGAGAGAGCTAAGCGCAACCAAGAAAACATTAGCTCGGTTCTTTATTCTGATAGTTTCCGGAAACAAATACAA
TRN  10010101110011011
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ASQ  ITPEMERVKRNQENFSSVLYKENMGKG--
DSQ  ATCACTCCAGAGATGGAGAGAGTCAAACGCAATCAAGAGAACTTTAGCTCGGTGTTATACAAAGAAAACATGGGCAAGGGA------
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TRN  11111101111011011
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TRN  10110101110011011
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TRN  11111101111011001
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TRN  10110101110011001
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TRN  10110101110011001
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TRN  10010101100011011
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DSQ  GAGACCCGGGATACTGTTCACGTCAAGAAAGTGACCAAGCATGTCAGTGATACCAATTACAAAAAGAAGTTTGTCAAGGAGAAAGGG
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DSQ  GACACTCCTGAAATCCTCCATGCCAAGCATGCTTATGATCTACGTGATGATATCAAGTATAAAGCTCACATGTTGAAAACAAGGAAT
TRN  10010101110011011
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DSQ  GATACACCCCAAATCCTCCATGCCAAGAAATCATACGACCTTCAGAGTCAGCTACAATATACAGCAGCAGGTAAAGAAAATCTACAA
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DSQ  GATACCCCTGATTTCACTCTGGCTGAAAAGAACAAGACTCTCTACAGCAAGTATAAGTATAAAGAAGTATTTGAAAGGACAAAGTCA
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DSQ  GATAATCTGGAGCAGCTTCACCTAAAAGAGGCTACAGAATTACAGAGCATAGTGAAATACAAAGAAAAGTATGAAAAGGAACGGGAA
TRN  10010101100011010
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ASQ  ENPQLRQLKAAGDALSDKLYKENYEKTKA
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ASQ  ETPEYKMNKKAGVAASKVKYKEDYEKNKG
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ASQ  RYIPIVGAKHADLVNSELKYKETYEKQKG
DSQ  CGCTACATTCCCATTGTTGGAGCCAAGCATGCTGATCTGGTGAACAGTGAGCTTAAATACAAAGAGACATATGAGAAGCAGAAAGGT
TRN  11011101101011011
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DSQ  GATGCTGTGCCATTTGTTCATGCCCATCACTGCAATGACGTTCAGAGTGAGCTGAAATACAAAGCTGAACATGTGAAGCAAAAAGGT
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DSQ  GACTCCTTGGCATTCCTGACAGCCAAAGCCAAGAGAGACCTGGCTAGTGAGGTGAAATACAAAGAGGACTATGAAAGGTCCAGAGGG
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ASQ  DAIPIRAAKAARQAASDVQYKKDYEKAKG
DSQ  GATGCGATTCCCATCAGAGCTGCCAAAGCTGCCAGGCAGGCGGCGAGTGACGTTCAGTACAAAAAAGACTATGAAAAGGCTAAAGGG
TRN  10110101110011011
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ASQ  DAISVQLAKASRDIASDYKYKQGYRKQLG
DSQ  GATGCAATTTCTGTACAGCTAGCTAAAGCTTCAAGAGACATTGCTAGTGATTATAAATACAAACAAGGCTACCGAAAGCAACTTGGC
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ASQ  DAIPIKAAKASREIASEYKYKEGFRKQLG
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DSQ  GATGCCATCCCCATCCAGGCTGCCAAGGCCTCCAGGGAGATTGCCAGTGACTATAAATATAAGCTTGACCATGAGAAGCAGAAGGGA
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ASQ  DEPRHLLAKTAGDQISQIKYRKNYEKSKD
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ASQ  EEPNVIRVRNAQEILSDNVYKDDLN-WLK
DSQ  GAAGAACCCAATGTTATACGCGTCCGAAACGCCCAGGAGATCTTGAGTGATAATGTGTATAAAGATGACCTGAAT---TGGTTGAAA
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ASQ  DAMNIELTRNMNRIQSDNEYKQDYNEWYK
DSQ  GATGCAATGAACATTGAGCTGACCAGGAATATGAATCGCATACAGAGTGATAATGAATATAAGCAAGATTACAATGAATGGTACAAA
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NAM  Q14214_HUMAN/1626-1654
ASQ  DAMSFELAKNMMQIQSDNQYKADYADFMK
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TRN  11111101111011011
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ASQ  DQNDIIQAKKAYELQSDSVYKADLE-WLR
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ASQ  DQNDVVQAKKVYELQSENLYKSDLE-WLR
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NAM  Q14214_HUMAN/650-678
ASQ  DSINVDLAKKAYALQSDVEYKADYNSWMK
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ASQ  DRPDFIQAAKSSLQQSDFEYKLDRE-FLK
DSQ  GACCGACCGGACTTCATCCAGGCTGCCAAGTCATCCCTGCAGCAAAGCGATTTTGAATATAAGCTCGACCGGGAG---TTCCTCAAG
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ASQ  DTPDLIRVKNAAQILNEKQYKKDLETEIK
DSQ  GATACGCCAGATTTGATTAGAGTTAAAAATGCGGCTCAGATACTAAATGAGAAACAATACAAGAAAGACCTGGAAACTGAAATTAAA
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DSQ  GATACACCTGACATGCTGAGAGCAAAGAATGCCACCCAGATCCTCAATGAGAAAGAATATAAGAGAGACCTGGAGCTGGAAGTCAAA
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ASQ  DTPDIQRAKKASEIVSQKEYRKDLETEII
DSQ  GATACCCCTGATATACAACGAGCAAAGAAAGCTTCTGAAATTGTAAGCCAGAAAGAATATAGAAAAGATCTGGAGACTGAAATTATA
TRN  10010101100011011
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