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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF06962 alignment
(19 sequences with 444 bp)


Q9Z6S2_CHLPN/53-191 AGACTTGTTGTCTACGATATCCAAAAAGAAGCGTTGTCCAATGCTTTACTATTGTTTGAAACACAC---...TTGTCAGAGcaaGAAAGAAGTGTTATCGAAATGAAAGAGCAGTCGCACGAGCATATTTTAGAG---------------------AAAGATGTGAAGCTCATTCACTACAACTTGGGCTATCTTCCGAAAGGGAATAAAGAAATCACCACATTGGCAAGAACTACAGAAATAAGCTTAGAATATGCTTTAAACATAGTCCGCCCCGATGGACTCATTACTGTCGTATGCTATCCAGGGCATCCAGAAGGAGAAAAGGAAACACATAGTGTCGAGAGCCTAGCACAACGGTTACATCCTAAGGAATGGTGCGTGAGCTCATTTTATGTAGCGAATCGGTGTCGAGCCCCTAGACTTTTTATTTTTCAGAGACAG
Q9PL90_CHLMU/54-192 CGTTTGGTTGTTTATGATATTCAGCAAGAGGCGTTGGATCGAGCTAAAAATCATTTTGAAAATCATTTA...CTAATTGAA...GAACGAAGGATTATTGAAATGAAGCTCTGCTCGCATGAGTATATTCAAGAG---------GAA------------GGTGCTAAGCTATTTCATTATAACCTCGGATATTTACCCAATGGGGATAAGCAGATTACCACGTGTAGAGCCTCCACAATTGCTAGTATTCAAAAAGCATTAGAGCTTGTATCTCCTTCAGGAGTGGTCAGCATTGTCTGTTATCCTGGGCATGAAGAAGGGGCAGAGGAGTTGCTCTGTGTAGATCAGTTAGCTGTGAATTTGGATCCGAGCAAATGGGAAGTGTGTACGCACTATTCCGTGAATAGAAAGAAAGCCCCACGCTTATTTCTTTTTAGGAAACGC
O84837_CHLTR/54-192 CATTTGGTTGTTTACGATATTCAACAAGAGGCTTTGGATCGAGCAACCGCTAACTTTCAAAGCGGGTTA...TTAGCTGAG...GAACGAGCGATTATTGAGATGAAGCTCTGTTCACATGAATATCTTCAAGAG---------------------CAGGGAGCTAAGCTCTTTCATTATAATTTAGGATATTTGCCTAGCGGAGATAAGCAGATTACTACATGTAGCGAGTCCACAGTTACCAGTATCTACAAAGCATTAGAATTAGTCGCTCCTTCAGGAATAGTCAGTGTTGTTTGTTATCCTGGGCATCAAGAAGGAGCCGCAGAGTTATGTTGTGTGGAGCAAGTGGCTGCGGATCTAGATCCAAGTATGTGGGAAGTATGCACCCACTATTCTGTAAATAGAAGGAATGCTCCTAGGTTATTTCTTTTTCGCAGACGA
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O34614_BACSU/47-188 CATGTATACGCATTCGACATCCAAGAATCAGCCGTGGCCAATACAAAGGAACGGCTCGGTGACATGTAT...CAA------...------GCGCGAACAACGTTATTTCACAAAAGCCATGATAAAATCGCTGAATCCCTCCCGCCTGAAACACATGGCAAAGTGGCGGCCGCGGTATTTAACCTCGGCTATTTGCCGGGCGGGGACAAATCAATTACGACAAACGGCAGTTCTACGATCAAAGCCATTGAACAGCTTCTCAGCATCATGAAAGACGAAGGTCTGATTGTTCTCGTCGTCTATCATGGCCACCCGGAAGGCAAAGCTGAAAAAAACGACGTGCTCGAGTTTTGCCGGGACTTGGACCAGCAAACAGCCCGTGTATTAACATACGGGTTTATCAATCAGCAAAATGACCCGCCATTTATTGTCGCCATCGAAAAA
Q99TA5_STAAM/46-185 CATGTTTATGGTTTCGACATTCAAGATTTAGCTTTGGAAAATACACGTGATAAAGTTAAGGATTTC---...---------...------AATCATGTTTCTTTAATAAAAGATGGACATGAAAATATTGAACATCATATAAATGATGCACATAAAGGTCATATTGATGCAGCCATCTTTAACCTAGGTTATTTGCCTAAAGGTGATAAATCTATCGTGACAAAGCCTGACACGACAATCCAAGCTATTAATTCATTGCTATCATTAATGTCAATTGAAGGTATTATTGTACTTGTTATATATCATGGTCATAGCGAAGGACAAATTGAGAAGCATGCATTGCTTGATTACTTGAGTACTTTGGATCAAAAGCATGCGCAAGTTTTGCAATATCAATTTTTAAACCAACGTAATCATGCTCCATTCATTTGTGCCATAGAAAAA
Q8CS36_STAEP/46-185 TTTGTCTATGGATTCGATATACAAGAACAAGCAATTTTGAATACGCACAAAAAAACAAAAGATTAT---...---------...------TCGAATGTAAAATTAATCCAATCTGGTCATGAAAATGCTAAATTGCACATTCCCGCCCAACATCACGGTTGCATAGATGCTGCTATTTTTAATTTAGGTTATTTACCGAAAGGTAACAAAGAAATTGTCACTAAACCTGAAACAACAATTATGGCTATTAATGAAATCTTTGATATCTTAAGTATTGAAGGAATTATTATATTAGTTATATATCACGGTCATGAAGAAGGTAAAGTAGAAAAAGAAGCACTACTTGAATTTTTACAAAACTTTGATCAAAATAAAGCTCATATATTACAATATCAATTCATAAATCAAAAGAATAACGCTCCTTTTATCTGTGCTATTGAAAAA
Q8EP11_OCEIH/52-190 CATGTTTATGCATTTGACATACAACAACAAGCTATTCAAAACACAAAACAAGCACTGGAAAAGTATCAT...AACAACAAT...------------GTTACATTAATACACGGAAGTCACGCGCTAATCGAGGATTATGTACAA---------CACGATGTTATTGGAGGAGCTATTTTCAATTTAGGATACTTACCACGAAGCGATAAATCAATTATAACGAAACCAGACTCAACAATAGAAGCTATTCAAAAAATATTAACAAAGTTGAAGAAAGATGGAATCATTGTAATTGTCGTATATTACGGTCATGATGGAGGTACTAGTGAAAAAGAGGCAGTATTAAAGCATGTGGCTAATTTAGATCAAAAACTGTACAACGTCTTACAATATGGTTTTGTAAATCAAAAAAATTACCCACCCTTTATTTTAGCTATCCAAAAA
Q8Y6M2_LISMO/47-185 CATGTGCTTGGATTTGATATTCAGCAACTGGCGATTGATGCGACGAACACTCGGTTAGAAAACGCGGGT...GTCAGTTCG...---------CAAGTAGAACTCGTATGCGCTAGCCATGCGCGCATTCCGGAATATACATCCAAA------------CCGGTTCGCGCCGCTATTTTTAATCTTGGCTATTTACCAGGTGGCGACAAAGAAATTACAACAACCGCTGATTCGACGCTAGAAAGCATTGGTCATTTAATGGAGCTGCTCGAAGTTGGTGGCGTCATTATTCTTGTTATTTATCACGGCCACCCTGCTGGAAAGCAAGAAAAAGATGCTGTCATGACTTTTTGCGAAGCTATCCCGCAACAAGATTTTCACGTATTATCTTACAACTTTATTAATCAAAAAAATGATGCCCCGTTCGTTATTATCATCGAAAAA
Q88XB1_LACPL/56-196 CACGTCGACGGGTTCGACATTCAATCAGCGGCCATTGAAGCGACGACAACTGCCTTAGATAAAGCAGCG...CTCACCCAT...---------CAAGTCACTCTGTGGCAAACGGGCCATGAACACATCGCAGATAAGATTGCCGCTGAT------CAACCTATCAAGTGTGCCGTCTTTAACCTGGGCTATTTACCAGGTGGCGATAAACAAATCATTACGAAACCAACGACAACGTTAACGGCCATAAAAGCCATTCAGGAACGCCTCGTCACCAACGGACTCATTATCCTGCTAGTCTATGCTGGTCATCCCGGTGGTGCGACAGAAGCACAAGCCGTTTTGGATTACGTAACGAATTTAGACCAGCATCAATTCCAAGTCCTACAATATCAGTTTATTAATCAAGTCCATGTGCCGCCATATTTGTTGGCCATTCAGAAA
Q9JV79_NEIMA/47-184 AAAGTGTGGGCATTCGACATCCAGCCGCAAGCCCTGAACAACACCCGATGCCGTCTGCAGGAAGCAGGT...TACAGCAAT...------------GTACGGCTCATCTTGGACGGACATGAAAACCTGAAGCAATATATTCCAAAG------------CCGCTGGATGCAGCCATTTTCAATTTCGGCTGGCTGCCCGGCGGGGACAAAAGCCTTACCACCCGCACGGAAACCAGCATTGCCGCCCTTTCCGCCGCCCTATCCCTACTGAAAGAAAACGGTATGCTTATTGCCGTCCTCTACCCCGGGCACGAAAACGGCAAACAGGAGGCAGAAGCAATCGAACAATGGGCAAAAAACCTGCCTCAAGAACAGTTTGCCGTTCTGCGTTACAGCTTTACCAACCGGAAAAACAGCCCACCCTATCTTTTGGCATTTGAAAAA
Q8DQP3_STRR6/44-180 CAAGTCTATGCCTTTGATATTCAGAAGCAAGCCTTGGAAAAGACCCAAGAGCGTTTGCATCAGGCTGGC...TTGACAAAT...------------GCCCAGTTAATCTTGCAAGGCCATGAGACACTGGACCAGTTTGTGACAAAA---------------GCTAAGGCAGGGATTTTTAATTTGGGCTATTTGCCGTCAGCTGATAAGTCTGTCATCACCCGACCGCAGACAACGATTGAGGCATTAGAAAAGCTATGTGGCTTACTTGTCAAGGGTGGACGAATTGCTATTATGATTTACTATGGTCATGAAGGAGGCGACCTCGAGAGAGATGCTGTCTTGGATTTTGTAATCCAGTTGAACCAACAAGAGTACACAGCTGCCATTTACCGAACTTTAAACCAAGTCAACAACCCGCCGTTTTTAGTGATGATTGAAAAA
Q8DYS3_STRA5/43-180 AAAGTTTATGCATTTGATATTCAAGAAGAAGCAATAGCAAAAACGAAAGCAAAGCTCACGGAGCAAGGG...ATCTCTAAC...------------GCTGAACTTATCTTGGATGGGCATGAAAATTTGGAACAATATGTTCATACA------------CCTTTAAGAGCGGCTATATTTAATCTGGGATACTTACCCTCAGCGGATAAAACAGTTATTACAAAACCACACACAACTATCAAGGCAATCAAAAACGTTTTAGACATTTTAGAAGTAGGTGGACGTCTATCACTTATGGTTTATTATGGTCATGATGGTGGAAAAAGTGAGAAAGATGCGGTGATAGCATTCGTGGAACAATTACCACAGAATAATTTCGCTACAATGCTTTATCAACCACTCAATCAAGTTAATACGCCTCCCTTTTTAATTATGGTAGAAAAG
Q8P2C1_STRP3/43-180 AAGGTTTATGCTTTTGATGTGCAAGAACAAGCTATTAGAAAAACAAGTGAGCGGTTAGCGCAGCTAGGA...TTATCGAAC...------------GCTGAGCTGATTTTAGCGGGTCATGAAGCGGTTGATCAGTATGTGACAGAG------------CCGGTGCGCGCAGCGATTTTTAACCTTGGTTATTTGCCCAGCGCAGATAAATCTATTATTACCTTACCAAATACCACACTCCAAGCTTTATCAAAACTACTAACGTTATTAATGGTAGGTGGGCGTATTGCTATTATGGTCTATTATGGGCATGATGGAGGCAGTTTGGAAAAAGATGCTTTATTAGATTTTGTCAAGCAATTAGACCAAAGAAAGGTTTCTGCAATGCTTTATCAGCCTCTTAATCAGGTGAATACCCCACCTTTTTTAATCATGTTGGAGAAA
Q8DSS3_STRMU/43-180 AAAGTCTACGCTTTTGATGTACAGGAACAGGCCTTAATCAAGACGAGAGAAAAACTGGAACAATTAAAT...ATTAAAAAT...------------GTCCAACTCATTTTAGATGGACATCAAACTATTAATAAATATGTGACTGAA------------CCTATCCGTGCAGCTATTTTTAATTTAGGTTATCTGCCTTCGGCAGACAAGTCAGTCATTACTCAGCCTGCTACAACCCTGACAGCTATTAAAAAGATTTTAGAGAGATTAGAAATTGGCGGTCGTTTGGCAATTATGGTATATTATGGTCATGAGGGTGGCGATAAGGAAAAAGATGCGGTTCTGAACTTTGTTAAAGAGCTAGATCAACAGCATTTTACAGTCATGCTTTATCAACCCTTAAATCAAATAAATACCCCACCCTTTTTGGTGATGATAGAGAAA
Q97G08_CLOAB/48-186 AGGGTTTATGCCTTTGATATTCAAGAGAAAGCTCTTTTGAGTACAAAAAGAAAATTAGAGGCCTCTGGG...AATATTAAA...---------ATAGTAAAGTTAATAAAAGATGGACATGAAAATCTAGATAAATACATAAGAGAA------------AATATAAAAGCTGCAGTATTTAACTTAGGATATCTTCCAGGAGAAAGCCATATTATAACCACAAAAAGTGAGACCACACTTGAGGCTGTTAAAAAATTATTAAAACTTCTTTATAGAAATGGTGTTATTATCATAAATATCTATCATGGACATGAGGAAGGAAGGGTGGAAAAAGAAGCTCTTTATAAACTATGTTCTAAATTAAATCAAAGGAAATATAATGTTTTTAAGGCCCAATTTATAAATCAAGTAAATTGTCCCCCTGAGCTCCTAGTAATAGAAAGA
Q898J2_CLOTE/53-190 AAAGTGTATTCCTTTGACATACAAATGGAAGCTCTAAAGAGTACTGAAAAGAAACTATACCAAAATAAT...ATACATTGG...------------GCAGAATTAATATTAGATGGTCATGAAAATATGGACAAGTATCTAAAAGAA------------GAGCCTAAAATAATATTATTTAACTTGGGATATTTACCTGGAAATTCTAAGGAAGTAACTACTAAAAAAGATACTACTTTAGAAGCGGTGAAAAAATCCTTAGATCTTATAAAAAAAGAAGGAGTGATAATTTTAGTAATATATCCTGGACATGAAGAAGGTATGTTAGAAAAAAAAGCATTAATAGATTTCTGTAAAGGAATATGTCAAAAACAATTTAATGTGATAAAACTGCAATTCGTCAATCAAATAAATAATCCACCAATGATGATTTGTATAGAAAAA
Q8XLG0_CLOPE/51-185 AAGGTATATGCCTTTGATATACAAGAAGAGGCAGTAAATTCATATAAATCAAAGAATAAAGAA------...---------...---------AATGTTGAAGTTATTTTAGATTCACATGAAAACTTTGAAACCTACATAAAAGAAGAA---------AATGTTGATTGTATAGTTTATAACTTAGGATATCTTCCAGGTAATAATAAGGAAGTAACTACGGTTGCACATAGTACTTTAAAAAGTATAGAAATAGGATTAGATTTATTAGGTGATAATGGGTTAATGATAATAGCCCTTTATAGTGGACATGAGGAAGGTAAAAAAGAGAAAGATGCCGTACTTCAGTTTACAAGTAAATTACCTAAAAATAAATATGGTGTTTTACATACAGAATTTACAAACAGAGCTAAGAGTGCACCTTCTTTAGTTGTTATTGAAAAG
Q8GUP2_ARATH/129-272 TATGTCTATGCTATGGACATTCAAAAAGATGCCATTGAAAGCACTTCATCTTTGCTCGATCAAGCCGTTggtTCAAAAGAG...---AAGGAATGCGTCAAACTTTTTAACCTCTGTCATAGTAAAATGGGAGAGATTGTCCCTGAA------AACGCCCGAGTGAGGATGGTTGCATTCAATCTGGGGTATCTTCCAGGAGGCAACAAGTCGATAATCACTCTCTCGGATACAACATTATCGGCATTGAAAGCTGCTGAGAGAATCTTAAAGCCCGGTGGTCTCATCAGTTTGGTGGTTTACATTGGCCATCCTGGTGGAAGAGAAGAGTTAGAAGTGGTTGAAGCTTTTGGGTCGGGTTTACCGGTCAGTGATTGGATCTGCTGCAAATTCCAAATGTTGAACCGACCGTTAGCTCCAGTTCTTGTTTTCATGTTCAAGAGA