PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF06929 alignment |
| VP3_ROTPC/1-691 | MRVLGLFERGNNLNFADTYIYTWNKQYSYHENAFLISNQVATTIIIYLSDTIVNEVDKAFTLLNSNGIPALV-IRKDHIGIFTSSNFTYDWQHKIVYFHEYTYYKNNEFIVSDEFWL-HTNIHE-LLP-YKLLY--YERGMRKLYDGEEYTLYNTATDDDILYKYIYEKDAIMSGDDYSELYDDKNFRNFVHFMRLLRMRFAVPFDQLSNRVTRSRAFF------KSKIHIGLRNESIPQALDNINSQWINYSANGIMISELKGSGSYSEKRISEFDIGQFKNYMNFLTLMFYIKN-MKKRPSCTIIGAAPGYWIPSMKRY--FTIITYDDKIVD-STEHHNRYFSEEDITKVRTNGV-YIDVRSDFDKSDWKKRRQLVEEETKRWLEISYRLLEGKYVEAVLLKMTAMDIEIP-DGYFVHFPTTYRKSEYYLLIDKQIIKKQKVKVTKSLMYNAINTIYSDNVFISGKYTLRGKT-EGVVALYCLSNTINQKDKVIQYANSFSGTCMTVRLNNTYEVNKVINLNNA-DYTFLPSDFVCPVNTVLTSYRGYAGVFGYAITKDLKSDGNNHIYIIPNARDENNFDTFASHLGLSRYSHSKRFSESATTMSGYLFRDMVSGKEDMGDTDKANYASGHVFNAIAHYRFDYTYDIVGWLRLHKNKQFRVKSDIYEEHTSDEVRNAIEAAYTYYLLDGDRVGKEYAKKIMEIWEAQ |
| VP3_ROTS1/1-688 | MKVLAL-RHSVAQVYADTQVYVHDDIKDSYENAFLISNLTTHNIL-YLNYSI-----KTLEILNKSGIAAIALQSLEELFTLIRCNFTYDYELDIIYLHDYSYYTNNE-IRTDQHWITKTNIEEYLLPGWKLTYVGYNGSETRGHYNFSFKCQNAATDDDLIIEYIYSEAL--------------DFQNFMLKKIKERMTTSLPIARLSNRVFRDKLFPSLLKEHKNVVNVGPRNESMFTFLNYPTIKQFSNGAYLVKDTIKLKQERWLGKRISQFDIGQYKNMLNVLTAIYYYYNLYKSKPIIYMIGSAPSYWIYDVRHYSDFFFETWDPLDTPYSSIHHKELFFINDVKKLKDNSILYIDIRTDRGNADWKKWRKTVEEQTINNLDIAYEYLRTGKAKVCCVKMTAMHLELPISAKLLHHPTTEIRSEFYLLLDTWDLTNIRRFIPKGVLYSFINNIITENVFIQQPFKVKVLNDSYIVALYALSNDFNNRSEVIKLINNQKQSLITVRINNTFKDEPKVGFKNIYDWTFLPTD-FDTKEAIITSYDGCLGLFGLSISLASKPTGNNHLFILSGTDKYYKLDQFANHTSISRRSHQIRFSESATSYSGYIFRDLSNNNFNLIGTNIENSVSGHIYNALIYYRYNYSFDLKRWIYLHSIDKVDIEGGKYYEHAPIELIYACRSAKEFATLQDDLTVLRYSNEIENYINTV |
| O55592_9REOV/1-684 | MKVIAL-RRDLVSSYADTQVYEHDVGKDYYENAYLISNITAHNVL-YVDYSV-----QVIEILNKSGIASLIAVNKDELEILIKSNYTYDYYKNIVYLHDYSYYNLNE-LRTDQYWLTTTNIEEYILPGWKLTYVGQLGIKTRGHYTYSFICQNTATDDDIIYDYIYSSEV--------------DFLPFLLQALNKRLTTALNFHRLSNRIFREYLYS---KVPKDTINIGPRNESMFTLLRYPYIMNYAANEFKVSDLIRLTQEKWVGTENSQFDVGQFKNMCNVLSTIYYYYNKYHAYPRIYMLGSAPSYWLYDLLQVHDFDIETWDPLDTPFSKRHHKAMFTTSDTAKLSDNSILYIDIRSDRNGVDWREWRQRVEDETKVNLEIMYKYLQHGKNRICCCKITAMDIELPVTSILLHFPTTKIQSECYVICTQEMLQDKKRFVPKGAFYSFINNTKTDNVFISPVYKVKPTN-KFVVALYSLSNENNDRDKVIDFTQKQKRGVITLRMNNTFNYEYRLQFKSTYDYLYLPSE-VSREGTIVTSYDGYIAMHNLSLSLESKATGNNHLFISFSDTNYDQIDSYCNHMGISRRSHSVRFSEAATTLSGYMFRDITNGKFNLINTNVENAVSGHVYNALVYFRYNYRFDLLRWINLHAKDEVMIQGGRYYEHAPPELLYACQSALVFAKSQNDLTLIEYVNSVNRHILTK |