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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF06821 alignment
(24 sequences with 618 bp)


Q82DP8_STRAW/12-188 TTCCTGCTCCTCCACGGCTGGCAGAACCGCCGCCCCgccGCCCACTGGCAGAGCTGGCTCGCCGACCGCCTCACCGCCCGGGGCCACGCGGTCACCCACCCCCAGCTCCCCGAGCCCGACGACCCCGACCTGGACACCTGGCTGGGCGAACTCCGCACCCACCTCACCGCCTCGCGGCCCCGC.....................---ACCGTCGTCTGCCACAGCCTCGCCTGCCTGCTGTGGCTGCACGCGGCCGCCCGC.........GGTCTCGTCCCCGCC......CCCGTGGACCGGGTGCTGCTCGTCGCCCCGCCGTCCGGC---------...---------..................AGCGTGCTCAAGGGGTACGCGGAGGTCGCGGCCTTCGCTCCCCCTCCCGTGACGCCCGCGCACCTCGCCGCCGCGGCCacgTACACCCGTCTCGTCGCCGCCGACAACGACCCCTACTGCCCGGACGGCGCCGCGGCCGTGTACGCCGAACCCCTCGGCCTGCCCGTCGACGTCCTGCCCGGCGAGGCCCACCTCGACCTGGACGCGGGCTACGGCTCCTGGCCCTCG---------CTCCTCGACTGG
Q6JWT1_9BACT/23-194 GTGCTGGTCATTCCCGGCCTGCGCGACAGCGGCCGC...ACGCATTGGCAAACCTGGTTGCAAGGACAGTACCGGGGCGCG---GTCCGGGTCAAGCAGGCCAACTGG---------GAGCAGCCCGACCTCGACGCCTGGGCCGCCCAGATCGCCCGCACCATCGGACGCGCACCGCCTTCG...............accaccTGGGTGGCCGCCGCGCACAGTTTTGGTTGCCTGGCCCTGGCCCGCTACCTTCAAGGCctcgaacctGCCCTGTCGCCCGCTggtggcGGCATCCGTTCAGCCCTGCTCGTGGCGCCAGCCGACCCGGTC------...---------..................---------------------AAGTTCGGCGTGGTCGAAGCGCTGTCAACGCCCGGCCTCGGCCTGCCCGCC------...------ATGGTGGTCGGCAGCGAGAACGACCCCTGGATGCCCCTGGACAGTGCGCGCCACTGGGCCGATCACTGGGGCGCCCGTTTCCTGAACCTGGGTGCCGCAGGGCACATCAACACCGAATCGGGCTTCGGCCCCTGGCCGCTGGCCCGCTTCCATGTCGACCAG
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Q6F9B1_ACIAD/4-177 ACTGTAATTGTTCCAGGTGTCGGCGGAAGTGAACAG...CATCATTGGCAATCATGGTTACAACGTCAGCTAAGTTCATGC---TCCCGTGTCGAACAAAATGATTGG---------AATTTACCTGTATTAAGCGACTGGGTAAGTCATTTGATTTCTCATGTGCAACAGCTCGAACAACCT.....................GTTCAGATTGTTGCTCACAGTTTTGGCTGCCTTACAACACTGGCAGCATTAGAGCAAcac......CCTCAATTAATCAAT......CAGGTCAAGCATATTACTTTGGTCGCACCAGCCAATCCAGAACGTTTTggcGAA------..................GCTGGCTTTGCTCGCGACAGCCAGACAGATTACCGCGCGTATTTTCATCAATTAAAGCCAAGTATCAAAACA------...------CAGCTCATTATCAGTGAAAATGATCCCTGGCTCGATTTTGAAGAGGCCTTGCAGCTCGCAAAGTCTTGGCAAGTTAGAGCAACCAATCTAGGCAAAGTTGGCCATATCAATGTCGCTTCAGGCTTTGGCCCGTTTCCAGAA---------ATTTTTGATTAT
Q8FZZ3_BRUSU/4-173 ACATTGCTTATCCCCGGTTATAAGGGATCGGAAGCA...GGCCACTGGCAGCGCCAATGGTTGCATGACGATCCATCAGCA---TTGCTCGTCGAACAGGACGACTGG---------CATTATCCGGTGCTGTCCGATTGGATGCATATGCTTGAAGCCACGCTGGCCGAAAATCCCGGCGCG.....................---GTTCTCGTGGCGCATAGTCTTGGCTGTGTGCTGGTGGCACATCTGGCAAGC---.........CGCCCGGCCGCCGCC......CATGTGGCGGGCGCGTTGCTGGTCGCTCCGGCAGACGCCGAA------...---------..................ACCATGGCCCGCAGGGACAGCCGGTTCCAAAGCTTTGCACCCCTGCCCCGCCACGAACTGGGCTTTCCTTCC------...------ATCGTGGTGGCAAGCCGCAACGATGAATATATGAGCTTCGCCAAGGCGGAAGCATTATCGCATGTCTGGGGTTCAGGCTTTGTCGATCTTGGCCACGCCGGACACATCAATGTTGCAAGCGGCTTCGGCCACTGGCCGGACGGAGCCATTCTTGCTTCCTCT
Q8UAE6_AGRT5/4-173 ACCTTGATTGTCCCCGGTCTGAACGGTTCGGATGAG...GGGCATTGGCAGCGGCACTGGTTGCTGGATGATCCTCAGGCC---CGGCTGGTCGATCAGGACAATTGG---------CAATGCCCGGTTCTCGAAGACTGGATTGACCGTCTTGAATCAGCGCTATCCGCAGTTGAAAGCGCC.....................---TATATCGTTGCCCATAGCCTCGGTTGCCCACTCGTGGCGAATATGGCGTCG---.........CGAGCTTCGGCTGCC......AAAATCAGGGGCGCGCTTCTGGTCGCTCCCGCCCATCTCGAT------...---------..................CGGGTGGAGGCAATGCATCCTTGTATCGTCCGGTTCGGCGCGTTTCCGCAGCAGCCGCTTGCTTTTCCCAGT------...------CTCGTGGTGGGGAGCATGAATGACCCCTATATGGACCCTGAAGAACTGGCGCAAACCGCCACCAGCTGGGGAAGCGACCTCGTCAATCTTGGCTCCGTCGGGCACATCAACATCGCCGCCGGTTTTGGTCGGTGGCCCCAAGGTTATGCGCTTTTCGACCGT
Q8XZQ1_RALSO/23-192 ATGCTGACCGTGCCGGGGTTGTACGGCAGCGGTCCG...GGGCATTGGCAGAGCCGCTGGGAAGAGCGCTTTCCCGACTGG---CGCCGCGTGGAGCAGGACGACTGG---------TCCACGCCGGACCTCGCGCGCTGGTCGGCCCGGGTGGGGCAGGCTGCGCGCGCGGCCCAGGCGGAGcggccgcgccatgccccgcgcGCCGTGCTGGTGGCGCACAGCTTCGGCTGCCTGGCGTCGCTGCACTGGGCG------.........GTGCAGGCGCGCGAC......GCGGTGGCGGGCGTGCTGCTGGTCGCGCCGGCCGACCCGGAC------...---------..................---------------------AAGTTCGGCGTGGCGGACCAGCTGCCGCAGCGCGCGCTGCCGTTTCCCGCC------...------GTGCTGGTCGCCAGCCGCAACGACCCCTGGCTGGGCTACGGCCAGGCCTTGGAGTGGGGCGCGCGCTGGGGCGCGGAGGTGGTCGACGCGGGCCATGCCGGCCACATCAACGCGGATTCCGGCCTGGGGGAGTGGGAGCCCGGTCTTGCGCTGCTCGATCGC
Q9RVS7_DEIRA/12-182 CTGGTCATCGTGCCCGGCCTGGGCGACTCCGGGCCG...GGGCACTGGCAAAGCCTTTGGGAACAGAAGTTCGGCGCAGCG------CGGGTACGGCAGGACTACCCA---------GACAGGCCGACGCCCGCAAGCTGGGCTGCCCGCTTGCAGGAAGTCGTGGAGGCGACCCCCGGTGAA.....................CTCATACTCGTCGCCCACTCGTGCGGCGTGCCGACGGTGGCGCACTGGGCGCGGCTC.........TTCGGCGGCCACGAG......CGGGTGCGCGGCGCCCTATTAGTCTCCCCGCCCGACGTGGAG------...---------..................CGGCCCCACCCCGACTTCCCGGCGGTGGCCCAGATGGCGCCGCAACCCCTCGACCCCCTGCCCTTCCCCGCC------...------CTCGTCGTTGCCAGCGAGAACGACCCGTTTTGCACGCCGGAGCGCGCCGAGAGCTTTGCCAACGCCTGGGGTGCCGCATTTGTTATGGCGGGCGAGGCTGGGCATATCAACGTGGACAGCGGCCACGGCGAGTGGCCCGAGGGAGAAGTGCTGCTAAGCGAA
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Q8G175_BRUSU/8-177 ATTCTCATCATTCCCGGCTATACCAATTCCGGCCCC...GACCACTGGCAAACCCGTTGGGAGAGCAAACTCTCCACGGCG---CGGCGCGTGCAGCAGGCCGAATGG---------TCGAAGCCCGTTCGTGAAGACTGGATCGGCGAAGTCGTCAAGGCTGCCAATGCAGCAACCAGGCCT.....................ATCGTGCTTGTGGCCCATTCGCTCGGCGTCGCCACAGCAGTCCAT---GCCATA---.........CCGCATATCCAGCAT......AAGGTGGCAGGCGCGTTTTTCGTCGCGCCACCGGATGTTTCC------...---------..................AATGAGAAGATCAGGCCAAAACATCTGATGACCTTCGGCCCCTACCCGCGTGAACGCCTGCCGTTCCCGACG------...------ATTACGGTGGTAAGCCGAAACGACCCTTTCTCCAGCTTCGAGGCGGCGGAAAGTGTCGTGAAGGATTGGGGGGCACTGTTGATCGATGCGGGCGAAGCCGGACACATCAATGCGGAGTCAGGCCACGGCCCCTGGCCGGAAGGCTCCATGGTCTTTGCGGAA
Q7CYE5_AGRT5/20-189 ATCCTCATCGTACCCGGTTACACCAATTCCGGCCCC...GACCACTGGCAGACCCGCTGGGAGCGCAAGCTATCCACCGCG---CGCCGGGTCGAGCAGGCGGAGTGG---------ACCAAGCCCGTGAAGGCAGACTGGGTGGCGCGGCTGGTTGAAGAGGTGAACGCCGCTACCAAGCCC.....................GTCGTGCTGGTTGCCCATTCGCTCGGTGTGCCGACCGTGATCCAT---GCCTTG---.........CCTGAGATCGCCCAT......AAGGTCGTAGGCGCCGTTTTTGTTGCCCCGCCCGATGTCGCC------...---------..................AATCCGGATATCCGGCCGAAACACCTGATGACCTTCGGCCCCTACCCGCGCGATCCACTGCCGTTTCCGTCC------...------ATCACCATCGCCAGCCGCAACGATCCTTTCGGCACTTACGAACATGCCGACGACATCGCCAGCGCCTGGGGTTCCATGCTGGTGGATGCCGGCATGTCCGGCCACATCAACGCCGAGTCCGGCCATGGCCCGTGGCCCGAAGGCGGCATGGTGTTTGCCCAG
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Q7NQ94_CHRVO/9-194 CTGCTGACGGTGCCCGGCTGGGGCAATTCCGGCGAC...ACGCACTGGCACGGCTACTGGGAAAAAACCTATCCGCTGGCG---CGCCGCGCCGAGCAGCGCGACTGG---------CTATACCCGACCCGCGACGAATGGGTGGCCGGTCTGGCCGCGGCGGTGGCGGAGATTCCGGGGAAA.....................CTGGTGATCGCCGCCCACAGTCTGGGCTGCCATACGACGGTCGCCTGGCTGCTGCAG...gcgacgCTGCTGGAGCAGCGC......AAGGTGAAGGGCGCGCTGCTGGTGGCGCCGCCGGCGATTCCGCTGACCgacGAGCGCGCCcgcgccagcggggaactgCCGGAAGGCGCGCCGCTGCCGACTTTCGCCGGCTTCGAAACGCTGCCGGAGCGCAAGCTGCCGGTGCCGGCG------...------CTGTTGGTGGCCAGCCGCGACGATCCGTTCTGCGAGTTCGAAGAGGCGAGGCGGATGGCCGAGCTGTGGGGCGCGGAATTCGTCGACGGCGGCATGGCCGGCCATATGGGCAGCCACGCCGGCCTCGGCAGCTGGCCAGCCGGGCAGCGCCTGCTGCAGCGG
Q98JQ9_RHILO/4-172 TTCATCATCCTGCCGGGCAGCGGCGGTTCCGGCCCG...GCGCATTGGCAATCGCGCTGGGAAGACGCCAATCCGGCAATG---CGGCGCTTCCAGCCCTCAAGCTGG---------GACCTGCCGGATTTCGCCGACTGGCTGGCGGCGCTGGAGGCTGCGGTGATCGCGGCGCCCGAGCCG.....................CCGGTGCTGGTCGCGCACAGCCTGTCCTGCCTGCTGATCGCGCATTGGCAG------.........AAGATTTCGCAAAGG......CCCGTCAAGGCGGCCTTGCTGGTCGGCGTTCCCGATCCG---------...---------..................GCGTCGGCGGTCTTTCCCAGATATGGCATGACCTTCGCCGGGATTCCGCAGGGCAAGCTGCGCTTTGCCTCG------...------CTTGTGGTGATCAGTACCGACGATCCCTATGGCTCGGCGGAGTATGCCGAGGCGCGGGCGACGCAATGGGGCAGCCGCCTGGCCGTCATCGGGCCGTTCGGCCATATCAATGCAGAAAGCGGCCTGGGCGACTGGCCGGAAGGTTTGGCGCTGCTCGAGGGG
Q8XX01_RALSO/5-175 GTTCTGATCGTGCCCGGTTACGGCAATTCAGGAGCA...ATGCACTGGCAAAGCATCTGGGAGGCGGCGAAGCCGGGACACTGGCGTCGCATGAAGATCGAAGACTGG---------GATCACGCCGTCTGCGATGAATGGGTAGCGGCAATCGATCGCGAAGTGACGGCTCTCGGTGCCGAT.....................ACGATCATCGTCGCGCATAGTCTCGGGTGCCTCGCGGTTGTGCATTGGGCT------.........GTGCGTCGCGCGGTC......GCCATTCGAGGGGCACTGCTCGTAGCTGTTCCAGACCCATCG------...---------..................GCATCGGCCTTTCCCAGCGCCTTTTGCGACGGGTTCTCGCCCGTGCCGTCAGCAAGATTGCCTTTTCGCAGT------...------ATCGTGGTTGCAAGCAACGACGATCCCTATGGGGCTATCAGCTATGCAAAGTCCTGTGCCCGTACATGGGGCAGCGAATTTCTCGACGTCGGAGCACGTGGACATTTGAATGCCGCGAGCCGACTGGATGACTGGGCTGAGGGATACAAACTCCTACATCAT
Q6D2K4_ERWCT/19-181 ATGGTGCTGGTGCCGGGATTGCGGGACAGCGATGAC...GAGCACTGGCAAAGCCATTGGGAACGGCGTTTTCCTCACTGG---CAGCGTATACGCCAGCGGGAATGG---------TATCAGGCCGATCTGGATCGCTGGGTGTTGGCGATCCGCCGTGAGCTCAGTGTCTGTACACAGCCT.....................GTGATTCTAATCGGCCACAGTTTCGGTGCGCTGGCCGCCTGCCATGTTGTG------.........CAACAAGGGCAGGAA......GGGATCGCGGGTGTTATGCTGGTGGCACCAGCCGAGCCCATG------...---------..................---------------------CGCTTTGAGATTGACGATCGTATTCAGGCCTCACCGCTGTCGGTTCCAACA------...------CTGACATTTGCCAGCCATAACGATCCGCTGATGAGTTTTACTCGCGCCCAATACTGGGCGCAGGCGTGGGATAGCGAACTGGTTGATGTGGGGGAAGCTGGACATATTAATGCAGAAGCGGGATTTGGTCCCTGGGAATATGGCCTGAAAAGATTAGCTGAG
P96671_BACSU/5-183 GTCTATATCATTCATGGCTACAGAGCCTCCTCAACA...AATCATTGGTTCCCTTGGCTGAAAAAACGTCTGCTCGCAGATGGGGTCCAAGCAGACATTTTAAACATGCCTAATCCGCTCCAGCCAAGACTTGAGGATTGGCTGGATACACTCTCTTTATATCAGCACACTTTACATGAAAAT.....................ACGTATTTGGTTGCGCACAGCTTAGGTTGCCCCGCCATTTTGAGATTTTTGGAACAT.........CTTCAATTACGAAAA......CAGCTTGGCGGAATCATACTTGTTTCCGGCTTTGCC------------...---------..................AAATCATTGCCCACTTTACAGATGTTAGATGAATTTACACAGGGATCGTTTGATCATCAAAAAATCATCGAGTCCGCGaagCACCGTGCTGTCATTGCTTCTAAGGACGACCAAATTGTGCCTTTTTCATTCAGCAAGGATCTGGCACAACAAATTGATGCTGCGTTATATGAAGTTCAGCACGGAGGTCATTTTCTAGAAGATGAGGGATTTACTTCTTTGCCTATTGTTTATGATGTTTTAACCTCT