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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF06458 phylogeny
for nucleotide alignment


 
(((((((((((((((((((((Q8Y3L4_LISMO/576-638,(Q8Y3L4_LISMO/506-568,Q92DS2_LISIN/453-515)),((((((Q88Y49_LACPL/860-924,(Q88ZE8_LACPL/505-569,Q88Y49_LACPL/650-714)),Q88Y49_LACPL/790-854),Q88Y49_LACPL/720-784),Q88TA3_LACPL/704-765),(((Q88T60_LACPL/760-822,Q88T60_LACPL/828-890),(Q88T60_LACPL/964-1026,Q88Y49_LACPL/930-992)),Q88Y49_LACPL/508-574)),(Q92E75_LISIN/202-264,Q9CDN9_LACLA/85-148))),((Q8Y4N9_LISMO/454-516,Q928N7_LISIN/454-516),Q928N7_LISIN/794-856)),(Q8YA32_LISMO/1510-1569,(Q8Y5N1_LISMO/391-455,(Q8Y910_LISMO/396-460,Q92DS1_LISIN/394-458)))),(Q8YAF4_LISMO/263-325,(((Q8VMW8_LISSE/276-338,Q8VMW8_LISSE/344-406),Q929J2_LISIN/1032-1094),(Q9CG09_LACLA/429-491,(Q9CG09_LACLA/499-561,(Q88Y49_LACPL/580-644,Q8Y783_LISMO/279-341)))))),((((Q8Y3L4_LISMO/647-709,Q8Y783_LISMO/133-195),Q8Y783_LISMO/205-268),(Q928N7_LISIN/386-448,(Q8Y8R0_LISMO/34-93,Q88T67_LACPL/542-604))),(((Q8Y5N1_LISMO/321-383,Q92CG8_LISIN/944-1006),Q92DS2_LISIN/313-375),(((((Q8YA37_LISMO/1002-1066,((Q92EV6_LISIN/383-447,((Q92EV6_LISIN/659-723,Q92EV6_LISIN/797-861),Q8YA37_LISMO/865-929)),((Q8YA37_LISMO/1071-1135,Q92EV6_LISIN/452-516),(Q8YA37_LISMO/1140-1204,(Q8YA37_LISMO/1209-1273,Q92EV6_LISIN/728-792))))),Q92EV6_LISIN/521-585),Q92EV6_LISIN/316-378),((((Q8YAF5_LISMO/677-739,((Q8Y591_LISMO/1476-1538,Q929J3_LISIN/1664-1726),Q929J4_LISIN/1473-1535)),Q92CG8_LISIN/801-863),(Q92CG8_LISIN/1086-1148,Q92CG8_LISIN/1015-1077)),((Q8Y8R0_LISMO/161-223,Q92DS2_LISIN/527-589),Q929J2_LISIN/964-1026))),(Q92CG8_LISIN/871-933,Q92DS2_LISIN/383-445))))),(((Q92E75_LISIN/270-338,Q9CG97_LACLA/219-287),Q92DS1_LISIN/320-388),Q8YA32_LISMO/1575-1634)),((Q8VMW8_LISSE/208-270,Q88Y49_LACPL/1004-1066),Q88T60_LACPL/692-754)),Q8YA32_LISMO/1644-1705),Q9GL34_BOVIN/137-216),(((Q74HA8_LACJO/675-773,Q74LY6_LACJO/1374-1472),(Q74HA8_LACJO/843-923,(Q74LY6_LACJO/1814-1902,((Q7X0P4_LACFE/2984-3083,((Q7X0P4_LACFE/1905-2018,Q7X0P4_LACFE/2315-2424),Q7X0P4_LACFE/1521-1633)),Q7X0P4_LACFE/3353-3453)))),(Q74HP3_LACJO/482-602,(((Q74LY5_LACJO/663-763,Q74LY7_LACJO/647-747),((Q74LY5_LACJO/303-403,Q74LY7_LACJO/290-388),(Q74LY5_LACJO/483-583,Q74LY7_LACJO/467-567))),(((Q15333_HUMAN/99-197,Q7X0P4_LACFE/4177-4275),Q7X0P4_LACFE/3903-3999),(Q74LY6_LACJO/1093-1197,Q7X0P4_LACFE/1117-1221)))))),(((Q7X0P4_LACFE/1804-1903,Q7X0P4_LACFE/1390-1519),((Q74HP3_LACJO/884-1003,Q74HP3_LACJO/1102-1221),Q74HP3_LACJO/1320-1431)),(Q7X0P4_LACFE/2864-2982,(Q7X0P4_LACFE/2607-2712,Q7X0P4_LACFE/3235-3351)))),((Q74LY6_LACJO/954-1080,Q8CYK3_STRR6/10-108),((Q88TB8_LACPL/808-927,Q88TB8_LACPL/683-807),Q88TB8_LACPL/928-1047))),((((Q74HU0_LACJO/2064-2173,Q7X0P5_LACFE/410-505),(Q74L43_LACJO/3340-3434,Q74KU3_LACJO/3381-3475)),((Q74KU3_LACJO/3755-3854,Q9RGN5_LACRE/3098-3192),Q74L43_LACJO/1353-1483)),(((Q74HU0_LACJO/1629-1734,Q74HU0_LACJO/1939-2056),Q74HU0_LACJO/1740-1854),(Q74HU0_LACJO/1438-1552,(Q74LY5_LACJO/106-204,Q74LY7_LACJO/95-192))))),((Q9RGN5_LACRE/646-754,(Q9RGN5_LACRE/1040-1139,Q9RGN5_LACRE/2882-2986)),((Q9CDN9_LACLA/235-336,(Q9CDN9_LACLA/410-510,Q9CDN9_LACLA/758-858)),(((Q74HP3_LACJO/685-792,Q74HW0_LACJO/513-625),(Q74KU3_LACJO/881-982,Q74HW0_LACJO/1127-1225)),Q74HW0_LACJO/729-825)))),((Q88T70_LACPL/1408-1510,((Q9RGN5_LACRE/1231-1331,Q9RGN5_LACRE/1417-1515),(Q88T70_LACPL/1798-1896,Q88WI9_LACPL/1984-2084))),(Q88XH5_LACPL/600-726,Q88XH5_LACPL/727-825))),Q88T70_LACPL/1205-1305),(Q88T70_LACPL/1615-1717,Q88TB8_LACPL/1075-1174)),Q88WI9_LACPL/1392-1494),(Q88WI9_LACPL/976-1079,Q88WI9_LACPL/1184-1287)),Q88WI9_LACPL/1599-1701,Q88WI9_LACPL/1806-1908);
(((((((((((((((((((((Q8Y3L4_LISMO/576-638:0.23686,(Q8Y3L4_LISMO/506-568:0.36510,Q92DS2_LISIN/453-515:0.32290):0.15669):0.05984,((((((Q88Y49_LACPL/860-924:0.31619,(Q88ZE8_LACPL/505-569:0.74044,Q88Y49_LACPL/650-714:0.17660):0.22861):0.06594,Q88Y49_LACPL/790-854:0.21173):0.08281,Q88Y49_LACPL/720-784:0.33940):0.10818,Q88TA3_LACPL/704-765:0.45510):0.07275,(((Q88T60_LACPL/760-822:0.28848,Q88T60_LACPL/828-890:0.26989):0.04830,(Q88T60_LACPL/964-1026:0.26886,Q88Y49_LACPL/930-992:0.36569):0.18139):0.09406,Q88Y49_LACPL/508-574:0.42710):0.09019):0.15547,(Q92E75_LISIN/202-264:0.34189,Q9CDN9_LACLA/85-148:0.35964):0.14246):0.06499):0.06980,((Q8Y4N9_LISMO/454-516:0.14608,Q928N7_LISIN/454-516:0.09650):0.10546,Q928N7_LISIN/794-856:0.13794):0.19848):0.08670,(Q8YA32_LISMO/1510-1569:0.34523,(Q8Y5N1_LISMO/391-455:0.18158,(Q8Y910_LISMO/396-460:0.16455,Q92DS1_LISIN/394-458:0.09096):0.12690):0.03726):0.08838):0.03101,(Q8YAF4_LISMO/263-325:0.33155,(((Q8VMW8_LISSE/276-338:0.39211,Q8VMW8_LISSE/344-406:0.27848):0.18453,Q929J2_LISIN/1032-1094:0.32078):0.06687,(Q9CG09_LACLA/429-491:0.35639,(Q9CG09_LACLA/499-561:0.34457,(Q88Y49_LACPL/580-644:0.53480,Q8Y783_LISMO/279-341:0.31274):0.10672):0.04589):0.05787):0.06106):0.08539):0.05918,((((Q8Y3L4_LISMO/647-709:0.39611,Q8Y783_LISMO/133-195:0.22529):0.08379,Q8Y783_LISMO/205-268:0.33428):0.10376,(Q928N7_LISIN/386-448:0.36377,(Q8Y8R0_LISMO/34-93:0.39904,Q88T67_LACPL/542-604:0.37509):0.09890):0.05685):0.04648,(((Q8Y5N1_LISMO/321-383:0.26532,Q92CG8_LISIN/944-1006:0.31879):0.08594,Q92DS2_LISIN/313-375:0.33820):0.11223,(((((Q8YA37_LISMO/1002-1066:0.20349,((Q92EV6_LISIN/383-447:0.20911,((Q92EV6_LISIN/659-723:0.19732,Q92EV6_LISIN/797-861:0.14567):0.03590,Q8YA37_LISMO/865-929:0.15136):0.02547):0.04037,((Q8YA37_LISMO/1071-1135:0.17805,Q92EV6_LISIN/452-516:0.24709):0.03841,(Q8YA37_LISMO/1140-1204:0.18002,(Q8YA37_LISMO/1209-1273:0.16369,Q92EV6_LISIN/728-792:0.16199):0.09563):0.05796):0.04635):0.09360):0.03632,Q92EV6_LISIN/521-585:0.30457):0.31880,Q92EV6_LISIN/316-378:0.22892):0.12424,((((Q8YAF5_LISMO/677-739:0.27693,((Q8Y591_LISMO/1476-1538:0.08944,Q929J3_LISIN/1664-1726:0.17643):0.24591,Q929J4_LISIN/1473-1535:0.28507):0.11320):0.16217,Q92CG8_LISIN/801-863:0.26802):0.02686,(Q92CG8_LISIN/1086-1148:0.29334,Q92CG8_LISIN/1015-1077:0.20092):0.11645):0.08521,((Q8Y8R0_LISMO/161-223:0.48766,Q92DS2_LISIN/527-589:0.41339):0.13856,Q929J2_LISIN/964-1026:0.25702):0.14807):0.06269):0.00999,(Q92CG8_LISIN/871-933:0.27771,Q92DS2_LISIN/383-445:0.17221):0.11516):0.02557):0.03879):0.05514):0.05846,(((Q92E75_LISIN/270-338:0.30658,Q9CG97_LACLA/219-287:0.33829):0.03069,Q92DS1_LISIN/320-388:0.31012):0.09828,Q8YA32_LISMO/1575-1634:0.46806):0.05608):0.10772,((Q8VMW8_LISSE/208-270:0.48267,Q88Y49_LACPL/1004-1066:0.69632):0.03614,Q88T60_LACPL/692-754:0.47673):0.12091):0.09950,Q8YA32_LISMO/1644-1705:0.26252):0.30552,Q9GL34_BOVIN/137-216:0.58535):0.14314,(((Q74HA8_LACJO/675-773:0.19585,Q74LY6_LACJO/1374-1472:0.20665):0.12638,(Q74HA8_LACJO/843-923:0.31223,(Q74LY6_LACJO/1814-1902:0.41597,((Q7X0P4_LACFE/2984-3083:0.29754,((Q7X0P4_LACFE/1905-2018:0.25910,Q7X0P4_LACFE/2315-2424:0.23024):0.06064,Q7X0P4_LACFE/1521-1633:0.23614):0.12022):0.04166,Q7X0P4_LACFE/3353-3453:0.22830):0.12139):0.09232):0.07925):0.07594,(Q74HP3_LACJO/482-602:0.54903,(((Q74LY5_LACJO/663-763:0.23266,Q74LY7_LACJO/647-747:0.23865):0.17302,((Q74LY5_LACJO/303-403:0.30424,Q74LY7_LACJO/290-388:0.36115):0.23209,(Q74LY5_LACJO/483-583:0.19934,Q74LY7_LACJO/467-567:0.31712):0.15521):0.07964):0.09842,(((Q15333_HUMAN/99-197:0.31605,Q7X0P4_LACFE/4177-4275:0.13943):0.23385,Q7X0P4_LACFE/3903-3999:0.29737):0.07213,(Q74LY6_LACJO/1093-1197:0.21204,Q7X0P4_LACFE/1117-1221:0.20819):0.09520):0.04219):0.14111):0.02421):0.03156):0.08290,(((Q7X0P4_LACFE/1804-1903:0.37054,Q7X0P4_LACFE/1390-1519:0.40758):0.05047,((Q74HP3_LACJO/884-1003:0.34662,Q74HP3_LACJO/1102-1221:0.25464):0.12679,Q74HP3_LACJO/1320-1431:0.41467):0.06973):0.07417,(Q7X0P4_LACFE/2864-2982:0.34263,(Q7X0P4_LACFE/2607-2712:0.23684,Q7X0P4_LACFE/3235-3351:0.26812):0.11811):0.18379):0.05744):0.05056,((Q74LY6_LACJO/954-1080:0.39600,Q8CYK3_STRR6/10-108:0.50626):0.10914,((Q88TB8_LACPL/808-927:0.45157,Q88TB8_LACPL/683-807:0.49642):0.09400,Q88TB8_LACPL/928-1047:0.48828):0.21030):0.15114):0.04663,((((Q74HU0_LACJO/2064-2173:0.39376,Q7X0P5_LACFE/410-505:0.48098):0.06939,(Q74L43_LACJO/3340-3434:0.36547,Q74KU3_LACJO/3381-3475:0.28839):0.10057):0.06670,((Q74KU3_LACJO/3755-3854:0.44084,Q9RGN5_LACRE/3098-3192:0.39990):0.14588,Q74L43_LACJO/1353-1483:0.41759):0.07166):0.10859,(((Q74HU0_LACJO/1629-1734:0.39376,Q74HU0_LACJO/1939-2056:0.30088):0.13477,Q74HU0_LACJO/1740-1854:0.36822):0.19164,(Q74HU0_LACJO/1438-1552:0.53216,(Q74LY5_LACJO/106-204:0.21403,Q74LY7_LACJO/95-192:0.46135):0.29232):0.08412):0.05763):0.03512):0.05079,((Q9RGN5_LACRE/646-754:0.12611,(Q9RGN5_LACRE/1040-1139:0.11824,Q9RGN5_LACRE/2882-2986:0.09087):0.20616):0.34468,((Q9CDN9_LACLA/235-336:0.30034,(Q9CDN9_LACLA/410-510:0.16038,Q9CDN9_LACLA/758-858:0.26466):0.04328):0.14797,(((Q74HP3_LACJO/685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