PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF06321 alignment |
| FIMA5_PORGI/10-366 | IIKAGSPQRETEPNSLLDSDAKITKLTAMVYAGQVQEGIKTVEDADNVLKVEGIKCKSGANKVLVVVANYDKNAGGDAIDFTGKTLDQVKAMTIQLTQDNQSAKFLIMTGESNAFTIKPGTNYYGYPAGTGTTQDNLIETGNALKVTRVHAAMSIQNVTVTFDPQYSSNYYFKPQN--VAGLICKKQSKIFGASLDFGTD-YLGG-VATTAAAYTPTSYDNSV---SWLTKPYA-----AKAGFYIMESVYQVG-NNLRPTILCVYGKLKKTETQDFSQEELDAAVAAGY--CDGNAITYYPVLVNYNGYGYTYTGENTG-LNKILRNNHYKISLTVKGPGTNTPEGPLPEEANLNVNCEVVSWNVVNQSAIW |
| FIMA4_PORGI/9-360 | FIIKSGEGRAV---GDGLADAKITKLTAMVYAGQIQEGIKTVEEADGVLKVEGIPCKSGANRVLVVVANHN-------YELTGKSLNEVEALTTSLTAENQNAKNLIMTGKSAAFTIKPGSNHYGYP--DGTTSDNLVSAGTPLAVTRVHAGISFAGVEVNMATQYQNYYSFNPADAKIAALVAKKDSKIFGNSLVSNTNAYLYG-VQTPAGLYTPDAAGETYELEASLNTNYA-----VGAGFYVLESKYDAS-NELRPTILCIYGKLLDKDGNPLTEPALTDAINAGF--CDGDGTTYYPVLVNYDGNGYIYSGAITQGQNKIVRNNHYKITLNITGPGTNTPENPQPVQANLNVTCQVTPWVVVNQAATW |
| FIMB2_PORGI/2-350 | VLKTSNPNRAF---GNAGDEAKVAKLTVMVYKGEQQEAIKS---AENATKVENIKCSAG-QRTLVVMANTG------GMELAGKTLAEVKALTTELTEGNQEAAGLIMTAEPVEVTLVAGNNYYGY---DGSQGGNQISQDTPLEIKRVRARIAFTKIEVTMSQSYANKYNFAPEN--IYALVAKKKSNLFGASLANNDDAYLTGSLTTFNGAYTPANYTH-V---DWLGRDFTEPSNNAPQGFYVLESTYAQNA-GLRPTILCIKGKLTKHDGTPLSSEEMTAAFNAGWIVANNDPTTYYPVLVNFESNNYTYTGEAVE-KGKIVRNHKFDINLTITGPGTNNPENPITESANLNVNCVVAAWKGVVQNVIW |
| FIMA1_PORGI/2-347 | VLKTSNSNRAF---GVGDDESKVAKLTVMVYNGEQQEAIKS---AENATKVEDIKCSAG-QRTLVVMANTG------AMELVGKTLAEVKALTTELTAENQEAAGLIMTAEPKTIVLKAGKNYIGY---SGTGEGNHIEN-DPLKIKRVHARMAFTEIKVQMSAAYDNIYTFVPEK--IYGLIAKKQSNLFGATLVNADANYLTGSLTTFNGAYTPANYAN-V---PWLSRNYVAPAADAPQGFYVLENDYSANGGTIHPTILCVYGKLQK-NGADLAGADLAAAQAANW--VDAEGKTYYPVLVNFNSNNYTYDSNYTP-KNKIERNHKYDIKLTITGPGTNNPENPITESAHLNVQCTVAEWVLVGQNATW |