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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF05001 phylogeny
for nucleotide alignment


 
((((((((((RPB1_YEAST/1711-1724,((((Q9XZS1_DROGU/1620-1633,Q99367_SOYBN/454-466),O77165_9EUKA/1654-1667),(((((((Q9FI54_ARATH/149-162,Q9FI54_ARATH/135-148),Q9FI54_ARATH/121-134),RPB1_ARATH/1721-1734),O08847_MOUSE/1847-1860),Q9HGZ5_ASPOR/1735-1748),(O04142_PORYE/1579-1592,Q9AXN1_9FLOR/1653-1667)),(RPB1_CAEEL/1759-1772,O09451_9FLOR/1658-1672))),((O96452_ANTLO/1432-1446,(Q9BMP3_MONBE/1498-1511,O08847_MOUSE/1555-1569)),O77375_PLAF7/2393-2406))),(((Q99368_SOYBN/879-891,RPB1_DROME/1625-1638),(((Q25655_PLABE/108-124,O77375_PLAF7/2363-2376),O77375_PLAF7/2257-2270),(O77375_PLAF7/2243-2256,Q25655_PLABE/79-92))),((((Q99368_SOYBN/954-967,RPB1_ARATH/1802-1815),(Q9HGZ5_ASPOR/1722-1734,RPB1_YEAST/1529-1542)),((((Q9C428_9FUNG/1434-1447,Q9BMP3_MONBE/1527-1540),Q9HGZ5_ASPOR/1691-1704),(((O77375_PLAF7/2168-2181,O00820_ACACA/1539-1552),Q9XZS1_DROGU/1856-1869),(((Q9XZS1_DROGU/1801-1813,Q9XZS1_DROGU/1674-1687),Q9XZS1_DROGU/1773-1786),((Q9XZS1_DROGU/1842-1855,((Q9XZS1_DROGU/1743-1756,O00820_ACACA/1511-1524),Q9XZS1_DROGU/1590-1605)),Q9XZS1_DROGU/1730-1742)))),(O77375_PLAF7/2289-2302,O77375_PLAF7/2345-2358))),(((Q9HGZ5_ASPOR/1615-1628,(((Q9AXN0_9EUKA/1545-1556,O04142_PORYE/1595-1608),O04142_PORYE/1631-1644),(((Q9HGZ5_ASPOR/1601-1614,(O04142_PORYE/1550-1563,Q9HGZ5_ASPOR/1587-1600)),(((O96446_9MICR/1461-1474,Q9AXN1_9FLOR/1625-1638),O09451_9FLOR/1625-1638),(Q9BMP3_MONBE/1712-1726,O08847_MOUSE/1903-1916))),((RPB1_CAEEL/1498-1512,Q9XZS1_DROGU/1606-1619),RPB1_CAEEL/1549-1567)))),((O09451_9FLOR/1677-1690,O77165_9EUKA/1500-1513),((Q9XZS1_DROGU/1550-1563,Q9XZS1_DROGU/1634-1647),O00820_ACACA/1525-1538))),(RPB1_CAEEL/1576-1589,O77375_PLAF7/2377-2390))))),(O08847_MOUSE/1587-1600,O00820_ACACA/1483-1496)),((O09451_9FLOR/1574-1587,Q9AXN1_9FLOR/1572-1585),((RPB1_SCHPO/1545-1558,((Q99368_SOYBN/934-947,RPB1_ARATH/1789-1801),(O94231_KLULA/212-229,(O08847_MOUSE/1948-1961,Q9BMP3_MONBE/1513-1526)))),(((Q99368_SOYBN/892-905,(Q9HGZ5_ASPOR/1705-1719,(O08847_MOUSE/1875-1888,((Q9HGZ5_ASPOR/1558-1572,Q99368_SOYBN/920-933),(Q9AXN0_9EUKA/1670-1686,(Q9XZS1_DROGU/1828-1841,Q9XZS1_DROGU/1871-1884)))))),O08847_MOUSE/1805-1818),O08847_MOUSE/1749-1762)))),((Q9XZS1_DROGU/1814-1827,Q99367_SOYBN/440-453),(O09451_9FLOR/1525-1538,(Q9AXN0_9EUKA/1586-1599,Q9BMP3_MONBE/1556-1570)))),(Q9AXN0_9EUKA/1656-1669,Q9C428_9FUNG/1503-1516)),Q9H5H4_HUMAN/74-87),Q9H5H4_HUMAN/109-122),Q9H5H4_HUMAN/95-108),Q9H5H4_HUMAN/39-52,Q9H5H4_HUMAN/53-66);
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