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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF05001 phylogeny
for amino acid alignment


 
(((((((((((((((O08847_MOUSE/1749-1762,Q9HGZ5_ASPOR/1691-1704),((((Q9XZS1_DROGU/1842-1855,O08847_MOUSE/1875-1888),((Q9AXN1_9FLOR/1653-1667,O08847_MOUSE/1948-1961),Q9HGZ5_ASPOR/1705-1719)),((O77375_PLAF7/2345-2358,O08847_MOUSE/1903-1916),O77375_PLAF7/2289-2302)),Q9XZS1_DROGU/1856-1869)),(((Q9XZS1_DROGU/1620-1633,RPB1_ARATH/1721-1734),Q9FI54_ARATH/121-134),(((((((RPB1_CAEEL/1498-1512,Q99367_SOYBN/440-453),(Q9BMP3_MONBE/1556-1570,O09451_9FLOR/1525-1538)),((Q9FI54_ARATH/149-162,(Q99368_SOYBN/934-947,RPB1_ARATH/1789-1801)),Q9XZS1_DROGU/1730-1742)),(((O09451_9FLOR/1625-1638,Q9AXN0_9EUKA/1670-1686),Q9XZS1_DROGU/1590-1605),Q9XZS1_DROGU/1674-1687)),(RPB1_CAEEL/1759-1772,Q99368_SOYBN/920-933)),(Q9XZS1_DROGU/1871-1884,(O77375_PLAF7/2377-2390,((((((Q9XZS1_DROGU/1550-1563,(O08847_MOUSE/1555-1569,(Q9BMP3_MONBE/1527-1540,Q9HGZ5_ASPOR/1601-1614))),(Q99368_SOYBN/954-967,RPB1_ARATH/1802-1815)),Q9HGZ5_ASPOR/1735-1748),Q9AXN0_9EUKA/1656-1669),O09451_9FLOR/1658-1672),(O77375_PLAF7/2168-2181,Q9HGZ5_ASPOR/1558-1572))))),O00820_ACACA/1539-1552))),((((Q9HGZ5_ASPOR/1722-1734,((O04142_PORYE/1595-1608,Q9AXN0_9EUKA/1586-1599),RPB1_YEAST/1529-1542)),(O94231_KLULA/212-229,RPB1_SCHPO/1545-1558)),((O04142_PORYE/1550-1563,Q9HGZ5_ASPOR/1587-1600),Q9XZS1_DROGU/1606-1619)),Q9BMP3_MONBE/1513-1526)),Q9FI54_ARATH/135-148),((O77375_PLAF7/2243-2256,Q25655_PLABE/79-92),(O08847_MOUSE/1587-1600,Q9AXN0_9EUKA/1545-1556))),O00820_ACACA/1525-1538),((RPB1_CAEEL/1549-1567,RPB1_YEAST/1711-1724),(((Q9XZS1_DROGU/1743-1756,Q9C428_9FUNG/1503-1516),(((((Q9XZS1_DROGU/1801-1813,((Q9XZS1_DROGU/1773-1786,O08847_MOUSE/1847-1860),O08847_MOUSE/1805-1818)),((Q99368_SOYBN/892-905,RPB1_CAEEL/1576-1589),(Q9C428_9FUNG/1434-1447,Q99367_SOYBN/454-466))),Q25655_PLABE/108-124),(O77375_PLAF7/2257-2270,(O77375_PLAF7/2363-2376,Q9XZS1_DROGU/1828-1841))),O00820_ACACA/1511-1524)),(((O09451_9FLOR/1677-1690,O77165_9EUKA/1500-1513),(((O77375_PLAF7/2393-2406,Q9BMP3_MONBE/1712-1726),Q9XZS1_DROGU/1814-1827),Q9XZS1_DROGU/1634-1647)),(((Q99368_SOYBN/879-891,RPB1_DROME/1625-1638),O04142_PORYE/1631-1644),O00820_ACACA/1483-1496))))),O77165_9EUKA/1654-1667),(((O04142_PORYE/1579-1592,O09451_9FLOR/1574-1587),Q9AXN1_9FLOR/1572-1585),Q9BMP3_MONBE/1498-1511)),(((O96446_9MICR/1461-1474,Q9AXN1_9FLOR/1625-1638),O96452_ANTLO/1432-1446),Q9HGZ5_ASPOR/1615-1628)),Q9H5H4_HUMAN/74-87),Q9H5H4_HUMAN/109-122),Q9H5H4_HUMAN/95-108),Q9H5H4_HUMAN/39-52,Q9H5H4_HUMAN/53-66);
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