EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF04279 alignment
(13 sequences with 606 bp)


ISPZ_PSEAE/1-187 ATGAAGCAATTCATCGATTTCATCCCACTGATCCTGTTCTTCATCGTCTACAAGATAgaccctcagaacgtcgagTTCGCC---........................GGGTTCAATCTGAGTGGCATCTACGGCGCGACCGCGACCCTGATCCTCGCCTCGGTGATCGTCTACGGCGCCCTCTGGCTCAAGCACCGC---CACCTGGAAAAGAGCCAGTGGTTCACCCTCGGCGCCTGCCTGGTCCTCGGCGGCCTGACCCTGGCCTTCCACGAGGACACCTTCCTCAAGTGGAAGGCGCCGCTGGTCAACTGGCTGTTCGCCCTGGCCTTCGCCGGCAGTCACTTCATCGGCGAC---AAGCCGATGATCCAGCGCATCATGGGCCATGCC......ATCCAG...TTGCCGCAGGGCCTCTGGGTGCGCCTGAACATCGCCTGGGTGGTGTTCTTCCTGGTGTGCGGCTTCGCCAACCTGTACGTGGTCTTCACCTAT---CCGAACTTCTGGGTGGACTTCAAGGTGTTCGGCAGCCTCGGCATGACCTTGCTGTTCCTGATCGGCCAGGGCCTGTTCCTGGCTCGCCACCTGCACGACGCC
ISPZ_PASMU/1-178 ATGAAACAATTATTAGAATTTATTCCACTTATTTTGTTCTTTGCGGTGTACAAGCTC..................GTGGGC---........................------------------ATCCGCGAAGCCGCAATTACCTTGATCATCGCGACCCTCATTCAATTACTGATTCTAAAAATCAAATATGGC---AAAGTTGAAAAACAACAACTGTTCATGGGGATCGCTGTGGTATTTTTTGGTACATTAACGGCGTATTTTAATCAACTTGAATACTTAAAATGGAAAGTGACCATTGTCTATGCCATTTTTGCCTTGGTTTTACTTGTTAGCCAATATGGCTTTAAT---AAAAATCTGATAAAACTAATGTTAGGCAAAGAAgatgcgCTTGAG...TTACCGGAACAGGTATGGAATCGACTCAATCTCGGTTGGGCACTTTTCTTCTTACTCTGCATGTTAATTAATCTTTATATTAGCCAATATTTATCGGACGATTTGTGGGTGGATTTTAAGACGTTCGGTATTCTCGGTATGACTCTCATTGCCACAATAATCACCGGCATCTATATTTACCGCTATCTTCCGCAAACC
ISPZ_HAEIN/1-176 ATGAAACAACTCCTTGACTTTATCCCTTTAATTTTATTTTTTATCACTTACAAACTC..................GGTGGT---........................------------------GTACGTGAAGCAGCCATCGTATTAGTGGTTGCAACAATTTTGCAGATCGTGATTTTAAAATGGAAATACGGA---ATGGTTGAAAAACAACAAAAAATTATGGCAAGTGCGGTCGTTTTTTTTGGACTTTTAACCGCTTACTTTAATGAAATCCGCTATTTGCAATGGAAAGTGACAATTATCAATGGCTTATTTGCTATTGTTTTGCTCGTCGCACAATTTCAATTTAAA---ACCCCATTAATCAAAAAGTTACTTGGTAAAGAG......CTACAA...TTGCCCGAAAAGGCTTGGAATACATTGAATTTTGGTTGGGCAATATTCTTTATTATTTGTATGTTGGTAAATATTTATATCAGCCATAATATGTCGGAAGAGGCTTGGGTTGATTTCAAATCTTTCGGAATTATTGGTATGACAGTGATTGCAACCATTATTTCGGGAGTTTATATTTATCGTTATTTGCCTAAAGAT
ISPZ_VIBCH/1-175 ATGAAACAACTGCTCGACTTTATTCCACTGATCATTTTTTTCGCTTTATATAAGTTT..................TATGAC---........................------------------ATCTACGTAGCAACAGGGGCGCTGATCGCCGCCACAACGGTTCAAGTGATTGTCACTTATGCTATGTACAAA---AAAGTGGAGAAAATGCAGCTCATCACATTCGTGATGGTTGCTCTGTTTGGTGGCATGACCTTAGCCCTGCATGACGATAACTTCATCAAATGGAAAGTGACGATTGTGTATGTGGTTTTTGCGCTCGGTCTAACCATCAGCCAGATCATGGGTAAG------CCTGCGATCAAAGGGATGCTCGGTAAAGAG......CTCACC...TTGCCGGATGCGGTATGGTCAACCATTAACTGGGCATGGGTGATGTTTTTCAGCGGCTGCGCTGCACTCAATCTTTATGTTGCCTACCACCTACCGCTTGATGTCTGGGTCAATTTCAAGGTATTTGGTCTGTTGGCGGCAACCTTAGTGTTTACTCTGCTCACGGGAGGCTACATCTACAAACACCTTCCCCATGAA
ISPZ_ECOLI/1-176 ATGAAGCAGTTTCTTGATTTTTTACCGCTGGTTGTCTTTTTCGCGTTTTACAAGATT..................TATGAC---........................------------------ATCTATGCGGCGACTGCGGCGCTGATCGTCGCCACGGCGATTGTGCTTATCTATAGCTGGGTTCGCTTTCGT---AAGGTTGAGAAGATGGCCCTGATCACTTTTGTTCTGGTGGTCGTCTTCGGTGGCTTGACGCTGTTCTTCCACAATGATGAGTTTATTAAATGGAAGGTTACTGTCATTTATGCTCTATTTGCGGGAGCCCTGTTAGTCAGCCAATGGGTGATGAAA---AAGCCGCTAATTCAGCGGATGCTGGGTAAAGAA......CTCACG...CTGCCGCAACCGGTATGGTCGAAGCTGAATCTGGCCTGGGCTGTTTTCTTTATCCTTTGCGGTCTGGCAAACATCTACATCGCATTCTGGCTGCCGCAAAATATTTGGGTCAACTTTAAAGTCTTTGGCCTGACCGCCCTTACCTTAATCTTCACATTGTTAAGCGGTATCTATATCTACCGCCACATGCCGCAGGAA
ISPZ_BUCAP/1-176 ATGAAAAAAATACTAAATTTATTACCGATATTTACTTTCTTCATATTTTATAGATTT..................TATGAT---........................------------------ATTTTTATAGCATCGAAATCTTTAATTTTTATATCAGGTTTAACTTGTTTACTTTATTGGATTATTTATAAA---GAAATAGATAAAATTAATTTATTTAGTTTTATTACAATTGCTATTTTTGGTTCTTTAACAATAATCTTTCATAACAGTCAATTTATTAAATGGAAAATAACAATAATTTATATGATATTTTCTGTAATATTATTTATTAGTCAATTTTTCATGAAA---AAACCTATAATACAAAGATTTTTAGAAAAAGAT......ATAAAA...ATTTCTGATTTGTATTGGAAAAAAATTAATTTTTTTTGGGCATTGTTTTTTTTATTTTGCAGTATCTTAAATATTTATGTAGCACTTTGTTTACCAGAAAAAATTTGGGTAAATTTTAAAGTCTTTGGACTTTCATTTTTAATGTTTCTTTCAATTTTAATTACAAGTATTTATATAAATTTCAAAATGTTAAAAGAA
ISPZ_BUCAI/1-175 ATGAAACAAATATTAAATATATTACCAATGTTCATATTTTTCATATTTTATAAATTT..................TATGAT---........................------------------ATTTTTATAGCTTCTGGTTCGCTAATTGTTATATCGGGATTAATATGTATAATCCATTGGATTTTTTATAAT---GAAATAGATAAAATTAGTTTATTTAGTTTTCTTTCAGTCTTTTTTTTTGGTTCTCTAACAATCTTTTTTCATAACAGTCAATTTATTAAATGGAAAATAACAATTATTTATATAATTTTTTCTTTAGTATTATTAATTAGTCAATTTTTTACAAGA---AAACCAATGATACAAAGATTTTTAGAAAAAGAT......ATAAAA...ATATCTAATATTTATTGGCGCAAAATTAATTTTATCTGGTCTTTATTTTTTTTATTTTGCGCTATTTTAAACATTTATATAGCATATTATTTTTCAGAAACTATATGGGTAAATTTTAAAGTTTTTGGTTTTACATCTTTAACATTTTTTTTAATTTTAATAACAAGTATCTATATCAAT---TGTAAAATATCAAAA
ISPZ_NEIMB/1-175 ATGAAATTCGTCAGCGACCTTTTGTCCGTCATCCTGTTTTTCGCCACCTATACCGTT..................ACCAAA---........................AAC---------------ATGATTGCCGCAACGGCGGTCGCATTGGTTGCCGGTGTGGTTCAGGCGGCTTTTCTGTATTGGAAATATAAA---AAGCTGGATACGATGCAGTGGGTCGGATTGGTGCTGATTGTGGTATTCGGCGGCGCAACCATTGTTTTGGGCGACAGCCGCTTCATTATGTGGAAGCCGAGCGTTTTGTTTTGGCTGGGCGCGCTGTTCCTGTGGGGCAGCCACCTCGCCGGTAAA---AAC---GGCTTGAAGGCGAGTATCGGCAGGGAG......ATTCAG...CTTCCGGATGCCGTATGGGCGAAATTGACGTATATGTGGGTCGGTTTCCTGATTTTTATGGGTATCGCCAACTGGTTTGTGTTTACCCGGTTC---GAGTCGCAATGGGTCAACTATAAAATGTTCGGCTCGACTGCACTGATGCTTGTTTTCTTTATTATTCAGGGTATTTATCTGAGTACCTGTCTGAAAAAGGAG
ISPZ_VITS1/9-191 ATCAAGCCGTTTTTGGATTGGATTCCATTAATTGTCTTTTTTTACATTTATAAAACG..................ACTGAG---........................GGCGAGGGCAGCGAGCATATTATTGCAGCGACGACAGGCTTATTAATTGCTACTTTGATTGTGTATGGCTTGATGTTTGTGTTGCAAAAATTCACATTGGAAAAACGCCAGTGGTTGGTGGTGGTGTTGACGGTGGTGTTTGGTGGCTTGACGATGGCATTCCAAGACGATTTTTACATTCGTTTGAAAGCACCGATTATCAATGCGGTGTTTGCGTTTGGCTTGGCGATGAGTCCATTGTTTTTAGGCGGTACTCCGGGCATCCAAAAAATGTTAGGTCCAATT......TTTGAG...ATGACGCCGAAACAATGGATGAAACTCAATTGGGTCTGGGTTGGATTTTTCACACTGATGGCGGTTTTACAAGCGTTGTTTGCCTTTGTATGG---GTGGAATATTGGGCGATGTTCACCGCTTTTGGTGACATGATTGTGATGGTGGTGTTTATGGTGGCGCAATTTTGGTTTTTGCGTGGTTTTATGCGCAAAGAC
ISPZ_RICPR/2-177 TTAAAACTTTTATCAGAAATTGGACCAGTAATAGCATTTTTTGCAGGTTTTTTTTAT..................GGAGGT---........................GGT---------------ATACAAAACGCTACCCTTTATATGCTTATTACATCTATTATTTGTATTACCCTTTGTTATATTATAGATAAG---AAAGTCTCTAAGCTCTCTATTATTTCTTCAACTGTTTTATTCATTTCGGGAATTATTACTTTAATTAGTGGCGATTCAATGTATATAAAAATTAAACCGACTATATTATATGTTATTTTTGGAATAATATTTCTCATGAGCGGTATAAAGAAAAAT------CCTTTTATCAAATATGCTTTAGAGAGCATA......GTACGT...CTTAAAGAAGAAAGTTGGATAATTTTAAGCTATAGAACAGCCGCTTTTTTCTTTTTCATGGCGGTAGTGAATGAAGTAGTTTGGCGTAATTTCTCAGATGAAACATGGGTAAAATTTAAAGTATTCGGTGTAATACCTATCACTTTTATATTTATTTTACTGCAATTACCTCTTTTATTAAAAAATAAATTACCGGAT
ISPZ_RHILO/25-214 CTCAAGCTGGTGCTGGAGCTAGGGCCGCTGCTGGTCTTCTTCTTCGCCAATGCGCGC..................GGCGAGTGGctggtgcagaaattccctgttttgGGCGAATTCGGCGGCCCGATCTTCGTCGCCACCGGCCTGTTCATGGCCGCCACGGCCATCGCGCTGATCGCCTCATGGCTGCTGACGCGC---ACGCTGCCGATCATGCCGATGGTGTCGGGCGTCGTCGTCTTCATCTTCGGCGCGCTGACGCTCTATCTGCAGGATGACATCTTCATCAAGATGAAGCCGACCATCGTCAACACGCTGTTCGGCGGCGTGCTGCTCGGCGGCCTCTACTTCGGCAGA------TCGCTGCTTGGCTATGTCTTCGATTCGGCC......TTCAGG...CTCGATGCCGAAGGCTGGCGCAAGCTCACCTTCCGCTGGGGCCTGTTCTTCCTTTTCCTGGCCGTCGTCAACGAAGTGGTGTGGCGCAATTTTTCCACCGACGCCTGGGTTACCTTCAAGGTCTGGGGCATCATGCCGATCACGCTTCTGTTCACTTTCAGCCAGATGCCGCTGATCCTGCGCCATTCGCTGGACGAC
ISPZ_BRAJA/11-184 ---AAGCTTGCGACCGAACTCGGTCCGCTGCTCGTCTTCTTCTTCGTGAATGCGAAG..................TTCAAT---........................------------------CTGTTCGCCGCGACCGGCGCGTTCATGGTCGCGATCGTGGCGGCGATGATCGCCTCCTATGTGGTGACGCGC---CATATCCCGATCATGGCGATCGTGACGGGCGTGATCGTGCTGGTGTTCGGCACGCTGACGCTGGTGCTGCACGACGAGACCTTCATCAAGGTCAAGCCGACCATCATCTACGGCCTGTTCGCCGCAATCCTCGGCGGCGGGCTGCTGTTCGGCCGC------TCCTTCATCGCCGTGATGTTCGACCAGATG......TTCAAC...CTGACGCCGCAGGGCTGGCGTATCCTGACGCTGCGCTGGGCGCTGTTCTTCGCCGGCATGGCGGTGCTGAACGAGATCGTCTGGCGCACCCAGAGCACGGATTTCTGGGTGAACTTCAAGGTGTTCGGCGTGACGCCGATCACGATGATCTTCGCCATCGCCCAGATGCCGCTGACCAAGCGCTATCACCTCGAGCCG
Q9RNK8_ZYMMO/20-195 GTCAAAATGGCGATAGATTTACGCCCGCTTGTGATCTTCTCTTTGGCCTATAAAATG..................ACAGGA---........................------------------TCCTTTATAGGTACCATCGCTTTTATGGTCTCGATGATCGTAGCTATAGGGGTTTCCCGTTACAAGCTGGGA---CGGGTCTCACCGACCTTGTGGCTCTCTTTTGTCTTGATTATGTTCTTTGGCGGTCTGACCTTATGGTTTCATGACCAACGTTTCATTCAGCTTAAGCCCACTATCATCTACAGTTATTTTGCCGTCATGCTGTTAGGCGGGCGCTTATTAAACAAG------CCGATGCTGAAATATATTATGGAAGATGCC......TTTGATggcGTGACTGAAAAAGGCTGGCTGATCTTAAGTTTTAACTGGGGCTGCTTTTTTCTCGTTATGGCCTTGCTAAACGAATATCTAAGGACGCATTTCAGTTTTGACGTCTGGCTAACCTTGAAAATCTGGGGCGCGATGATTTTGTCGGCCGTTTTCGGATTTGCCAATATGCCTGTTTTAATCAAAAACGGATTAAATACA