pan•dit

PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF04131 alignment
(6 sequences with 201 aa)

`NANE_BORBU/29-229`	`MSKMALAAKIGGAIGIRANGVNDISQIKLEVDLPIIGIIKKNYNNCDVFITPTMKEIDELCNEGVDIIALDATFRNRPDGVLLDDFFENIKKKYPKQCLMADISSLDEAINADKLGFDFIGTTLYGYTKNTNGlNIADNDFNFLRTLLNSNLKSTLIVEGKIDTPLKAQKCFEMGVDLVVVGGAITRPAEITKKFVEKINQ`
`NANE_STRPY/38-234`	`MPLMAKAAQEAGAVGIRANSVRDIKEIQAITDLPIIGIIKKDYPPQEPFITATMTEVDQLAALNIAVIAMDCTKRDRHDGLDIASFIRQVKEKYPNQLLMADISTFDEGLVAHQAGIDFVGTTLSGYTPYSR-.QEAGPDVALIEALCKAGIA--VIAEGKIHSPEEAKKINDLGVAGIVVGGAITRPKEIAERFIEALKS`
`NANE_PASMU/35-226`	`VAAMAQASVIGGAAGLRIEGIENLKATRNVVNVPIIGIVKRDLPDSPVRISPFLQDIEELAAAGADIIAFDGTDRVRP--TTREAIIKRIKELG--CLAMADCSNFEEGMYCHNLGVEIIGSTMSGYTGGEIP.--AEPDYQLVKDLNAAGCR--VMAEGRYNTPELAKTAIEIGAYSVTVGSALTRLEHIVSWFADAVKS`
`NANE_HAEIN/35-226`	`VSAMAQASVMGGRSGLRIEGVDNLKATRPFVNVPIIGIVKRDLPDSPVRITPFLQDIEDLANAGADIIAVDGTSRPRP--VDIESAVKKIHEMG--CLAMADCSNLEEGLYCKALGFDIVGSTMSGYTGGAVP.--EEPDYQLVKDLKSAGCF--VMAEGRYNTPELAKVAIEIGADCVTVGSALTRLEHIVSWFANSVKS`
`NANE_ECOLI/35-226`	`VAAMALAAEQAGAVAIRIEGVANLQATRAVVSVPIIGIVKRDLEDSPVRITAYIEDVDALAQAGADIIAIDGTDRPRP--VPVETLLARIHHHG--LLAMTDCSTPEDGLACQKLGAEIIGTTLSGYTTPETP.--EEPDLALVKTLSDAGCR--VIAEGRYNTPAQAADAMRHGAWAVTVGSAITRLEHICQWYNTAMKK`
`NANE_VIBCH/41-232`	`IVAMAIAVEQAGAKALRIEGVNNVAAVSAAVTIPIIGIVKRDLPDSPIRITPFVSDVDGLANAGATVIAFDATDRTRP--ESRERIAQAIKNTG--CFAMADCSTFEDGLWANSQGVEIVGSTLSGYVGDIEP.--TVPDFQLVKAFSEAGFF--TMAEGRYNTPELAAKAIESGAVAVTVGSALTRLEVVTQWFNNATQA`

PF04131 alignment (6 sequences with 201 aa)